EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-01942 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr12:12921319-12922175 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxj3MA0851.1chr12:12921820-12921837AAAGTGTAAACAAACCA+6.22
POU4F1MA0790.1chr12:12921653-12921667ATACATAATTTATG+6.46
POU4F3MA0791.1chr12:12921653-12921669ATACATAATTTATGAC+6.45
Enhancer Sequence
ACAACTCCAA TATGCTTTCT TTGTTCCTCT GGAAGTATGT CCTGGTCCAC AGCACCATCT 60
AATGGATATC ATCATTTATA CATTTCACTT TTTTGTGCTT GTTAAATTGT CTGAACCTTT 120
CTCTATGCCT GCGTGTGCCA ATTTCAGGCC CAAGAGTTAT TCAAAATATA ATACTTTGAA 180
GTTTTCCACA GTCTATGGTT TTTAATGGAC CAGACAGAAC AGTGAGAGGT TGGTCTAGAG 240
AGGTGAAGTC TCAATTGTGG CAACCTTAGA ACACCTACAA CCCTGTCAAA ACTTCAGAGT 300
CTTAGTTGAG GTCTGTGGGG CTCTCAGCTG TTTCATACAT AATTTATGAC GGCTCACCAA 360
GAATTAAACC AAGGCAGCTG AGAAAAGGTG ATAGAGTTCT GAGGCAGAAG AAATCTGTGG 420
TGGAAGGGGA AAGTAGACGC AGAAAAAAGG AAAGAATGAA AAGTCGTGGA GAAAAAAAAA 480
GGTAAGCTTT GTAAACTAAG CAAAGTGTAA ACAAACCATG AAGTTTTACA CAAATGATTT 540
CATACTTGAA AATGTTTTTT TTTCCATTAA AACTATTGCT GATACTAAGA GCAGGCTGTT 600
TCGTGTAATT CTCACATGCT CACACCTAAA TTGAATTTTA AAATTGATTA AATACAAACC 660
CCAACTACAT CCACCTGTGC CTAGCATTCA ATATTTTTTT TAAATGACTA TTATGTGTAT 720
TTCTAAAGGC AGAAATTAAG AAAAAAAGCA TCAAATGTCA ATGACAGTTT GGTCTAAAGA 780
GGTGTTCATA TGGAAATGAA GTGTGAGAAA TGAACTTAAT AATTATTTCA CCTCACAGCC 840
CATGTACACT GTGTTC 856