EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-01885 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr12:6659104-6660149 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr12:6660022-6660039ATTGATTAATTAATTGA-6.21
ArxMA0874.1chr12:6660022-6660039ATTGATTAATTAATTGA+6.34
DUX4MA0468.1chr12:6660036-6660047TGATTGAATTA-6.14
Hmx2MA0897.1chr12:6659875-6659892ATTGATTAATTGATTGA-6.14
Hmx3MA0898.1chr12:6659875-6659892ATTGATTAATTGATTGA-6.45
Hmx3MA0898.1chr12:6660026-6660043ATTAATTAATTGATTGA-6.45
MEF2CMA0497.1chr12:6659423-6659438ATTTATTTTTGGATT-6
PBX2MA1113.1chr12:6659440-6659452ATGATTGACAGA+6.22
POU6F1MA0628.1chr12:6660026-6660036ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr12:6660026-6660036ATTAATTAAT-6.02
Enhancer Sequence
ACTCACAACT TTATCGCTTG AGCTGTGTCT TATCAACAAA ATTCAACAGG TATGCCTTCG 60
AACATTCATT GCTACTGGTT TATTTTTAAA TGGTAACTTA AATCTGCAAA AAGAGAAGTT 120
TATGCTGTTC ACTTCAATGG GGGTTTTAAA AAATTAAATA CGATTAGGTC AATCATTCTC 180
AGTCACAGTA TGTCTCAGTA TGTTATGCAT TTGAAAGAAA GAAAGACATA GATAGATAGA 240
CAGACAGACT GAATAACTGA TTGACTGATT GACTAACAAA TAAATTGATT GAAGGATTGA 300
CTGAGAGATT AATTGATTAA TTTATTTTTG GATTAAATGA TTGACAGATT GACTGACTGA 360
CTAATGATTG ATTAAAACAG TCAACTAATA GATAGATAGA TAGGTAGGTA GGTAGGTAGG 420
TAGGTAGGTA GGTAGGTAGG TAGGTAGGTA GGTTGGTTGG TTGGTTGGTT GGTTGGTTGG 480
TTGGTTGGTT GGTTGGTTGG TTGGTTGGTT GGTTGGTTGA GTAATTGATT GATTGAAACG 540
GTGAACTGAT TGACTGACTG ATTAAAACAG TGTTAACTGA TTGATTGATT GATTGATTGA 600
TTGATTGATT GATTGATTGA TTGATTGATC GATTGAAACT GTGAACTGAT TGACTGACTG 660
ATTAAAAAAG TGAATTGACT TATTGAATGA TTGATTGATT GATTGATTGA TTGACTCACT 720
GATTGATACA GTGAATTGAT TTATTGATTG ATTGATACAG TGAATTGACT GATTGATTAA 780
TTGATTGACT CACTGATTGA TATAGTGAAT TGATTGATTG ATACAGTGAA TTGACTGATT 840
GATTGATTGA TTGATTGATT GAAACAGTGA ATTGATTCAC TGGCTGACTA ATGATTGGTT 900
AAAACAGTGA ATTGATTGAT TGATTAATTA ATTGATTGAA TTACTGACTA ATGATTGATT 960
TAAACAGTGA ATTAATTGAT TAATTTAATG ATTGATTGAT TGATTGATTG ATTGATTGAT 1020
TGATTGATTG ATTGATTGAT TGATT 1045