EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-01833 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr12:862092-863386 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Hmx1MA0896.1chr12:862650-862667CCAACCAATTAATCAAT+6.09
Hmx2MA0897.1chr12:862767-862784CAAACCAATTAATCAAT+6.37
Hmx2MA0897.1chr12:862650-862667CCAACCAATTAATCAAT+6.93
Hmx3MA0898.1chr12:862650-862667CCAACCAATTAATCAAT+6.72
NFYBMA0502.1chr12:862683-862698AAACTAACCAATCAG+7.25
PBX1MA0070.1chr12:862952-862964CAATCAATCAAA+6.18
Enhancer Sequence
CGTGTCTAAG GAGGATTATT GTTTACCTGA GAGCTGTTCT CATCTGCAAA CGCTGAGATC 60
CGGATTCGCT GCTCGTCTCC TCTTAATAAA GACGCGGCTC TAGTTGGTGG TGATTGTCCT 120
GTCTCTACAG ATTTGGTAAG TGAGCGACCA GTGCTCTTTG TTTATTCAGT TTGTTTGTAT 180
CGAACTAAGT TAACTATTGC ACCGAGTGTA AACATGTTAG CACCACAACC AAACTTTAAC 240
CTCATGTAGG ATTTTCACCG CATTTTGTNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 300
NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 360
NNNNNNNNCC ATCCATCCAT CCATCCATCC ATCCATCCAA CCATCCATCC AACCAAACAA 420
ACCAACCAAC CATCCAAACA ACCAACCATC CATCCATCCA ACCAACCAAC CATCCATCCA 480
TCCATCCATC CAACCATCCA TCCATCCATC CATTAATCCA ACCAACCAAC AAACCAACCA 540
ACCATTCAAA CAAACCAACC AACCAATTAA TCAATTATCC AATCAACCAC CAAACTAACC 600
AATCAGCCAA ACAACCATCC AGCCAACCAA TCAATCTAAT CAACCAATAT GCCAACCAAA 660
AAAAACCTAT TCAAGCAAAC CAATTAATCA ATCAATCAAT CAATCAATCA ATCAATCAAT 720
TGATCAACCA AACAATCAAT CTGTCAAAAA AAACAGTCAC CGACCAATCA ATCAATCAAT 780
CAATCAATCA ATCAATCAAT CAATCAATCA ATCAATCAAT CAATCAATCA ATCAATCAAT 840
CAATCAATCA ATCAATCAAT CAATCAATCA AATTAATATT CTTAAATAAA GAAAGAACTC 900
AAACCCCAGC GTTGTGTGTT TCATATACAT AATTGTATTT TATATATTTA TATTCAATGT 960
ACAAAGTTAC ATTCAGGCTG CTTCATAGAA ATAAATACTG CGATGGCCAG TTTTGCGACA 1020
GGATTGATTT GTTTTCTGCA GCCGGAAACG CAAGCTGAGC AGCCATTACA GATTAGAGTC 1080
TAAAAGACCA GTACAAAAGT GTCATAAAAA TATGCGTCCG CCTCTGCACT GTGTCTACAC 1140
ACTACAGCAA AGGAGCAGCT CCTGTAGAAA AACAACACAA AACACTCTAG TGTTAAAAAA 1200
GACGGCGAAC CAGCGAAACG GGGACACAGT CGAGGAGTGA TAAAGTATTA AATCAGTTTC 1260
TCTCTATGCT TTGGTAAGCG TGCAACATTC ATAT 1294