EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-01823 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr12:445706-447088 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr12:446500-446512GAATGTTTTTTT+6.52
HOXC12MA0906.1chr12:445904-445915TTTTTACGACT-6.02
HOXD10MA1506.1chr12:446421-446432GTTTTACGACT-6.02
HOXD11MA0908.1chr12:445774-445784TTTTTACGAC-6.02
HOXD11MA0908.1chr12:445904-445914TTTTTACGAC-6.02
HOXD12MA0873.1chr12:446421-446432GTTTTACGACT-6.32
HOXD12MA0873.1chr12:445904-445915TTTTTACGACT-6.62
Enhancer Sequence
TGTTTTTGCA ACAGTGTCTT TGCGACTGTG TCATTGTGAT TGTTTTTAAA ACTGTCTTTG 60
CGACTGTGTT TTTACGACAG TGTCTTTGTG ACTGTTTTTG CAACTGTTAT TGCAACTGTG 120
TTTTTGCGAC TGTGTTTTCA CGACTGTCTT TGTGACTGTC TTTGCGACTG TTTTTCTGAC 180
AGTGTCTTTG CGACTGTGTT TTTACGACTG TGTCTTTATG ACTGTCTTTG CAACTGTTTT 240
TACACAGTGT TTTTGCGACT TTGTTTTTGC GATTGTGTCT TTCCGACTGT TTTTCCGACT 300
GTGTCTTTGC GGCTGTGTTT TTACAACTGT CTTTGCGACT GTGTCTTTGC GACAGTGTCT 360
TTGCGACTAT GTTTTTGGGA ATGTCTTTGT GACTGTGTTT TTACGAATGT CTTTGTGACT 420
GTGTTTTTGC GAATGTCTTT GTGACTGTGT TTTTGCGAAT GTCTTTGTGA CTGTGTTTTT 480
GCGAATGTCT TTGTGACTGT GTTTTACGAG TGTCTTTGCG ACTGTGATTT GCGAATGTCT 540
TTGTGACTGT TTTTATGACT GTGTTTTTGC GACTATTTTT ACACAGTGTT TTTGCGACTG 600
TGTCTTTATG ACTGTCTTTA CAGTGTTTTT GCAACTTTGT TTTCACGATT GTGTCTTTGC 660
GACTGTTTTT ACACAGTGTT TTTGCGACTT TGTTTTTGCG ATTGTCTTTG CGACTGTTTT 720
ACGACTGTCT TTGCAACAAT GTCTTTATGA CTGTATTTGC GACTGTGTAT TTAAGACTGT 780
GTGTGTATTT TTGTGAATGT TTTTTTGCAA CTGTGTGGTT TTGCAACTGT TTTTGCAGGT 840
GTGTGTTTTT GCAGGTGTGT GTTTTTGTAG ACGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 900
GTATGTGTGT GAATATGTGT ATGACTCTGC AGATGATTAG CATGATTCAT TCAGCTGTCA 960
GTGCGTTGGC TCCTGAGGGC CGAGTCCCCG AGGGCTCGAT GACCTGCAGA TAAAGACTCA 1020
CGGAGGCCAG CTGGACTTCA ACTCTGTGTC AGAGAGCTGC TCACACTCAT TTACATAACA 1080
ACACACACTC TCTACTCATT ATAGACTCCT GTGTGTGTTC AGTTTATTTC TGTGTGCGTG 1140
TGTGTGTGTG AGAGAGAGAG AGAGAGTCTA GTATATTATC GTTTGTTAGA ATTATGTGTT 1200
TTGTACAGTA TGTCCATGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TTTGTGTGTG TGTGTGTGTG 1260
TGTTTGTTTG TGAGCGATGA GAGAGAGTGT GCTAGTGTGT TTAGTTTTTG TGTGTGTGTG 1320
TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG 1380
TG 1382