EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-01815 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr12:101543-103672 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE23MA0817.1chr12:103275-103287CAGCATATGTTT+6.04
RREB1MA0073.1chr12:101660-101680ACCCAAAACACCCCTCAAAC+6.13
ZNF24MA1124.1chr12:103199-103212CACTCATTCATTC-6.92
Enhancer Sequence
TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTCTCCTCA GTTAAATGAC TCCTGCAGGG TGTTTGATTT 60
TAATGTTTGT TTTTTTTCAG AGACGACATG GGAGAGACCG TCCAGCACAC CGGGGACACC 120
CAAAACACCC CTCAAACACA CACACTCCAG CGGCACAGGT ACACCAACAC ACACTTTTCT 180
CTTTGCTTTA GTCTTTTTGA GGTTTACATG TTCTAAAATG AAGCTGGGTT TGCTGCTTAG 240
CCAGTTCAGT TTCAGTTCTA CTAATCCTGG GTTTTAAATT CCATAAAGGC AGCTCAGGTT 300
TAATCCATCT TTGTCATCAT AGTAATTCAT ACTGCACCGC TATGTTATAT TAATGTTTTG 360
TTCTGGTTGT GTTCAGGTTT GTTCTGCTTA TTTTCAGGTT ATGTTACGAA TTTGTTCAGG 420
TTGTGTTCAG TGAATGTTCT GGTTATGTTC CTGTTATGTT CAGTCTATGT TCTGGTTATG 480
TTCCTGTTAT GTTCAGGCTA TGTTCTGGTT ATGTTCCTGT TATGTTCAGG CTATGTTCTG 540
GTTATGTTCC TGTTATGTTC AGGCTATGTT CTGGTTATGT TCCGGTTGTT TTCTAGTTGT 600
GTTCAGGTTA TGTTCTGATA ATATTCTGGT TATGTTCCGG TTGTGTTCAG GATATGTTCT 660
AGTTATATTC CTGTTATGCT CTGGTCATGT ATAGGTTATG TTCCAGTAGT GTTTAGGTTA 720
TTTTCAGGCT ATGTTATGGT GATGTTCTGA TTATGTTCTG ATTATGTTCA GGTTGTGTTC 780
AGGTTATTTT CAGGCTTTGT TTCTGGTTAT GTTCTGATTA TGTTCTGATT ATGTTCAGGT 840
TGTGTTCAGG TTATTTTCAG GCTTTGTTCT GGTTATGTTC TAGTTGTTTT CCGGTTGTAT 900
TCCAGTTTTG ATTATCTTCT GGTTATGTTC CAGTTGTGTT CAGGTTATGT ACAGGTTATT 960
TTCAGGCTAT GTTCTGGCTA TGTTCCGGTT GTGTTCCAGT TATGTTCTGA TAATATTCTG 1020
ATTATGTTCC AGTTGTGTTC AAGATATGTT CAGGTTATGT ACAGGGTATG ATCTGGTTCT 1080
GTTATGTTCT GGTTATGCTT AGGTTATGTT CCAGTAGTGT TCAGGATATG TTCTGGTTAT 1140
ATGCCTGTTA TGTTCGGTCA TGTTTAGGTT ATGTTCAGGT TATTTTCAGG TCAAGTTCTG 1200
GTCATGTTCT GGCTGTGTTC AGGATATGTT CTTGTTATGT TCAGATGTAA AGAACATGTC 1260
AAATCTTNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 1320
NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNACA CACACACACA 1380
CACACACACA CACACACACA CACAAACACA CACACACACA CACACAAACA AACACACACA 1440
CACACACACA CACACACGCA CAAACACACA CACACACACA AACCCACACA CATACACACA 1500
CACACAAACA CACACACACA CACACACACA CAAACACAAA AACACACACA CACACACACA 1560
CACAAACACA CACACACAAA CACACACACA CACAAACACA CAAACACAAA AACACACACA 1620
CAAACACACA CACACAAAAA CACACACACA CACACACACT CATTCATTCT CCTTCAGCTT 1680
AGTCCCTTGA TTGATCAGGG GTCATCACAG CGGAATGAAC CGCCAACTAT CCCAGCATAT 1740
GTTTTATACA GCAAATGCCC TTCCAGCTGC AACTCAGTAC TGGGAAACAC CCATACACAC 1800
TGAACACAGT CGTTATAAAG CACATCTCTG AGCGCTGTCT AGGGTGATGT CTCAGTGACA 1860
GTGAGGAGGA GCGCTGCTGT GATCTGTGTG TTGTTGTGGC ATTTGCTGTG TGTGTGTGTG 1920
TGTGTGTGTT GTGAATCTGT GCTCCTGTGT TCAGCTGTTT TAGAGAAGCC GCTGGAGAAG 1980
AAGGCGGGCC GGAACTACGG GCCGCCGGGC AGCAAACGCC TCGTTTACTT CATAGACGAC 2040
ATGAACATGC CGGAGGTGGA CGAGTACGGC ACGGTGCAGC CGCACACACT CATCCGCCAG 2100
CACATGGACT ACAGCCACTG GTATAGACA 2129