EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-01793 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr11:44480141-44481775 
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXH1MA0479.1chr11:44481668-44481679CCCAATCCACA+6.14
HNF4A(var.2)MA1494.1chr11:44480357-44480372TTGACCTTTGACCCC-6.01
HNF4GMA0484.1chr11:44480358-44480373TGACCTTTGACCCCG-6.32
KLF5MA0599.1chr11:44480311-44480321GCCCCGCCCC+6.02
NR2C2MA0504.1chr11:44480358-44480373TGACCTTTGACCCCG-8.18
NR2F1MA0017.2chr11:44480354-44480367CATTTGACCTTTG-6.54
NR2F2MA1111.1chr11:44480356-44480367TTTGACCTTTG-6.62
Nr2f6MA0677.1chr11:44480358-44480372TGACCTTTGACCCC-7.95
RXRBMA0855.1chr11:44480358-44480372TGACCTTTGACCCC-8.42
RXRGMA0856.1chr11:44480358-44480372TGACCTTTGACCCC-8.42
RxraMA0512.2chr11:44480358-44480372TGACCTTTGACCCC-8.42
SP1MA0079.4chr11:44480308-44480323CTGGCCCCGCCCCTC+6.11
SP4MA0685.1chr11:44480308-44480325CTGGCCCCGCCCCTCTC+6.36
Sox1MA0870.1chr11:44481683-44481698CACACTAACATTGTC+6.51
ZNF24MA1124.1chr11:44480158-44480171CATTCATTCATTT+7.34
ZNF24MA1124.1chr11:44480601-44480614GAATGAATGAATA-7.52
Enhancer Sequence
ATATATATAT ATATATCCAT TCATTCATTT TTTTCGGCTT AGTCCCTTTA TTAATCTGGG 60
GTCGCTACAG TGCAATCAAC TGCCAAGTGT ATGTATCACC GTGTCAGACT GAAATCAAGT 120
GAGCAGGCAG ATAAAGCACA TGGGAGTCAT TAACCTGTCA GGCAGGGCTG GCCCCGCCCC 180
TCTCCACTGA TTGGTCAACA CTTATCTGGC AGTCATTTGA CCTTTGACCC CGCTGGTCTG 240
ACGTTAAGAA AATAAACACA AGCGCAGGCG TCACATCTGG AGCACAGCGG CTTCACAAAG 300
ACGCCTTCAG GCCTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT ATGAATGTGT GTTTATGTGT 360
TTGTGAGAGT ATGTGTGTGT TTGTGTGCAA GTAAGAGTCT CAGTGTGAGT GAGTGCATTT 420
GTTTGTGTGG GTGTGTGTGC GTGCGTGTGT ACTAGTGTGT GAATGAATGA ATATATGAGT 480
GTGTGTGTAT GTGTGTTTGT GTGTGTGTGT ACGAATGTGT GAGCATGTGT GAGTGTTTGT 540
GTTTGTGTGT GTAAGTATGT TTGTGTGCGA GTGACTGCAC ATGCACGTGT TAGTGTGTGT 600
GAATGTCTGC ATGTGAGAGT CTGTGTGTGA ATGCGCATAT GTGAGAGTGT GTTTTGTGAG 660
AGTGTGTGTG TGTGTATGAG TGTCTACATG TATTGACTGT GTTTGTGTGT CAGTTTGTGA 720
GTGTGTGTTT CTATGTATGT ATGTGTTTGT GTGTGATTGT GTGTGTGTGT GTTTGTGTAT 780
GTAAGTGTGA TTGTGTGTGA GTGTGTGTGT GCATGTAAGA GTGTGTGCTT GTGTATGAAA 840
GTGTGTTTGT GTGTGTGCGC GCATGTGAGA GCGTGTTTTT GTATTTGTGT GTTTGTGCAC 900
ATATATGCAT GTGTGTGTTT GTGTATGTAA GTGTGTTTGT GTGTGTGTGC GCATGTAAGC 960
TTGTGTGTGT TTGTGTATGT AAGTGTGTTT GTGTGTGTGC ATGTGAGAGT GTGTGTTTTT 1020
GTATTTGTGT GTGCATGTAA GTGTGTGTGT GTGTGTTTGT GTATGTAAGT GTGTTTGTGT 1080
GTGTGCATTT AAGTGTGTGT TTGTGTTTGT GTATGTAAGT GTGTTTGTGT GTGTGCATGT 1140
GAGAGTGTGT GTTTTTGTAT TTGTGTGAGT GCGCAACTGC GCATGTAAGA GTGTGTGTTT 1200
GTGTATGTAA TTGTGTTTGT GTGTGTGTGC GCATGTAAGC GTGTGCGTGT TTGTGTATGT 1260
AAGTGTGTTT GTGTGTGTGT GTGCATGTGA GCCTGTATGT TTCTGTTTGT AAGAGTGTGT 1320
GTGTGTGTGT GTATCAGTGC GAGTCAGAAT CTGCTTGTGT ATTAACTCAT TATTCTCAGT 1380
AAAACTCAAT AATTTCACCT TAAAGATGTC AAATGCAGCA GTTTAAGACA CATTCAGGAC 1440
ATGATCACAT GACAACAGTG AACAAGTGTT TAGTGTTGCA CACAGATGAC AACATTATCA 1500
AAACTAACCC TTTCACACAT CCTGCGGCCC AATCCACACA CTCACACTAA CATTGTCTGT 1560
TCAAATCTTT CATTGTAAAA AGCAAACAGT GTCGCTAAAC ATCATGGAAA TCATTACATT 1620
TGTTCCACTA AATG 1634