EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-01779 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr11:44011763-44014268 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
NR2C2MA0504.1chr11:44012002-44012017TGACCTCTGACCCCG+8.55
Nr2f6MA0677.1chr11:44012002-44012016TGACCTCTGACCCC+7.03
PHOX2AMA0713.1chr11:44011805-44011816TAATTTAATTA-6.62
PROP1MA0715.1chr11:44011805-44011816TAATTTAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr11:44011805-44011816TAATTTAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr11:44011805-44011816TAATTTAATTA-6.62
Pou2f3MA0627.1chr11:44014054-44014070GTTAATTTGCATGAAA+6.11
RXRBMA0855.1chr11:44012002-44012016TGACCTCTGACCCC+7.06
RXRGMA0856.1chr11:44012002-44012016TGACCTCTGACCCC+7.01
RxraMA0512.2chr11:44012002-44012016TGACCTCTGACCCC+6.98
ZSCAN4MA1155.1chr11:44013226-44013241CGCACACACTCAAAT-6.05
ZSCAN4MA1155.1chr11:44012325-44012340TACACACACTTAAAT-6.33
Enhancer Sequence
TTTTGGATAT TTCGTGTCAC CGTCCTTTAT GCATTGTTGG CATAATTTAA TTATAGATCC 60
TTCATTTTGT GATGCGCCCC TGACGTTGAC AGCTCGCAGA TTTATTTGCG AGACACGTCT 120
ATGGTCATTA TGAGGCGGAG CTGTTCCCGC GACAACAAAG GTCGTGACCT CATTGTGGCT 180
GAATGCATCG TGTTATAGAT GTGTTTAATT GGCGGGATGG AGAGGCTGAG GGGCGTGTCT 240
GACCTCTGAC CCCGCTCTGT TTATGGAGGC TCTTTACTGC TGCAGTGTGG GAGACAGTCA 300
CTGTACTGCA CCTCCCCCAC ACACACAAAT CAGCACGCAC ACACACTAAA ATCACTTGCA 360
AACACACACG TGCACACAAA CACATACACT CATCAACACA TGCACACAAA CGCACTCAAT 420
TCAACACACC TGTACACACT CAAATCAACA CAAATGCACA CGCTCGCGCA CACTCAAATG 480
AACACACATG GACACAAACA CACACTCAAA TCAACACACA CACTCCTGCA CCCTCAAATC 540
AACATGCGTG CACACACACA CATACACACA CTTAAATCAA CACACATGCC TACATACTTT 600
AATCGACATA CACAATGCGC GCGCACACAC AAATCAGTAC AAATGTGAAC ACGCATGCTC 660
ACGCACACTC AAGTCAACAC ACACACACAC TCTCACGAAA ATAAGGAAAT TTAAACTCAG 720
GAAATTAAAA CGCACGCACA CTCAAATCAA CACATACAAA CAAACACATG CACACTTAAA 780
TCAACACACA TGAACACAAA CACACACACA CTCAATTAAC ACACACTCCT GCACACTCAA 840
ATAGGCATAC ACTCAAATCC AAACAAAATG CATGCACAAA CACACACACA AATCAACACA 900
CGTGCACACT CAAATCAACA CAAATGCACA CACACACTTT AACCCGCGCG CACACTCACA 960
AACCCAAATC AACACACACA AAGACACACA GATCCACACA CTCCTGCACA CTCAGATCAA 1020
CATGCATGCA CACACACATA CACACACACA CTCAAATCAG TACAAATGCG CACACACACT 1080
CACATCAGTA CAAAAGCGCA CACACACACT CAAATCAACA CGCATGTCCA CACAATCAAA 1140
TTAACATACA CTCAAATCAG CATACACCCA CACACACACT CAAATTGACA TACACACACA 1200
CTCACTCAAA TCGACAAGTA CACACACTTT CAAATCAACA CATATCCCTT CACATACACA 1260
CACACACACA CTCGAAGCAG TACACACATG CACACACACA CTCCAATCAG TACACACATG 1320
CGCACACGTC CACACACTCA AATCAACACA CACGGCCGCA CACTCAAATC AGTACACACA 1380
TGCACACACA CTCAAATCAG TACACACATG CACACACACT CAAATCAGTA CACGGCACAC 1440
ACACACTCGA ATCAGTGCAA ACGCGCACAC ACTCAAATCA GTACACGGTA CACACTCACA 1500
CTTTCAAATC AACACGCATG TCCACACACT CAAATCGACA CACATGTCCA CACACTCAAA 1560
TCGACACACA TGTCCACACA CTCAAATCGA CACACACGTC CACACACTCA AATCAACACA 1620
CATGTCCACA CACTCAAATC GACACACATG TCCACACACT CAAATCGACA CACATGTCCA 1680
CACACTCAAA TCGACGCACA TGTCCACACA CTCAAATCGA CACACATGTC CACACACTCA 1740
AATCGACGCA CATGTCCACA CACTCAAATC GACACACATG TCCACACACT CAAATCGACA 1800
CACATGTCCA CACACTCAAA TCGACACACA CGTCCACACA CTCAAATCGA CACACACGTC 1860
CACACACTCA AATCGACACA CGTCCACACA CTCAAATCGA CACACACGTC CACACACTCA 1920
AATCGACACA CGTCCACACA CTCAAATCGA CGCACACGTC CACACACTCA AATCGACGCA 1980
CACGTCCACA CACTCAAATC GACGCACACG TCCACACACT CAAATCGACA CACACGTCCA 2040
CACACTCAAA TCGACACACA CGTCCACACA CTCAAATCAG TACAAACGCG CACACACACT 2100
CAAATCAGTA CATGGCACAC ACACTCTCAA ATCAACACGC ACGTCCACAC ACTCAAATTG 2160
ACATTCACAC ATATCTCACA CACACACACA CACACACACA CACATACCCT CAAATCAGTA 2220
CATATGCAAA CACACACTCA AATCAACACA CAGTCAAATA TACTTAGACA AAAAACACCT 2280
TAAATATAAA AGTTAATTTG CATGAAAGCA CATAACAGAT GATGATATAG AATGAGGCTT 2340
GTTTTGTGCA GTCTTCATGT GCTCATGAAC ATTTTACATT CAGAAGTGTT GTCATCATTA 2400
ACAACATTAA ACATCAGCCA GAGTCATATG ATTACCTGTA AAGCAGTTCT CCAACAGTAA 2460
CAGTCCTGTA GTTGTTCTAA TCGCCTGTAA CACACTCTTC ATATT 2505