EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-01749 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr11:42575959-42576659 
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Lhx3MA0135.1chr11:42576522-42576535AAATTAATTTATT+6
Nkx2-5(var.2)MA0503.1chr11:42576016-42576027CTTGAGTGCTT-6.02
Enhancer Sequence
TGTGTGTGTG TGTGTGGTGT TGTAGACGGC AGGATCACTC CTCTCCTTTT ATGGTGGCTT 60
GAGTGCTTGT GTGTATGTGA GAGAGGAGTG ACGGAGCGTT TGCAGTGGCG GATGAAATGC 120
CTGAATGAAC TGAATTAACG AGGAGTTCAG TCACACTGAC GCTTCAGTCT GAACTCTGAG 180
GAAAATCACA CACACTCACT CACGATAGCA GATTACAGGA AGACAGAGAA GGATGAAGAC 240
TGTGAGTGAG TATGTGCAAG TGAGAGAGAG AAAGAATAAA TATGAGTGTA TTTGAGGGTG 300
AGTGTGTATT AGTGTATGTT TATGGTTTGC ATGTGTGTGT GTGTAAGTTG AGCACGTTTG 360
CAAGAGAGAG AGCTTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG 420
TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGCG TGCTTGTAAG AGATTTTTTT 480
ATATACTGTG CATCCGGAAA GTATTGATAG CGCTTTACTT TTTCCACATT TTTTTATGTT 540
ACAGCCTTAT TCCAAAATGG ATTAAATTAA TTTATTTCCT CAACATTCTA CACACAATCC 600
CCCATGATGA AGATGTGAGA AAAGGAGTTT TTGAAATTGT TGCAAATTTA TTAAAAATAA 660
TAAACCTAAA AGATCACATC TACAGTATTC ACAGCCTTTG 700