EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-01742 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr11:42228885-42230218 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ALX3MA0634.1chr11:42228939-42228949TTTAATTAGA-6.02
ARGFXMA1463.1chr11:42228939-42228949TTTAATTAGA-6.02
Arid3bMA0601.1chr11:42229076-42229087ATATTAATTAA+6.62
EsrrgMA0643.1chr11:42229453-42229463ATGACCTTGA-6.02
FOXB1MA0845.1chr11:42228954-42228965AATGTAAATAT+6.32
IRF1MA0050.2chr11:42229735-42229756CCTCACTTTCACTTTTTCTCC+7.05
PHOX2AMA0713.1chr11:42228936-42228947TAATTTAATTA+6.62
PRDM1MA0508.2chr11:42229737-42229747TCACTTTCAC+6.02
PROP1MA0715.1chr11:42228936-42228947TAATTTAATTA-6.32
PROP1MA0715.1chr11:42228936-42228947TAATTTAATTA+6.62
Phox2bMA0681.1chr11:42228936-42228947TAATTTAATTA+6.62
RORAMA0071.1chr11:42229454-42229464TGACCTTGAT-6.02
ZNF263MA0528.1chr11:42229857-42229878CTCTCTTTTTTCTCCTCCTTA-6.24
Enhancer Sequence
GAAATAAACT CTGTGAATAA TAAAACTCTT AGATAAATCA GAAAATATAA ATAATTTAAT 60
TAGAATAGAA ATGTAAATAT TGGGAAAAAC CCCAGATGTA AAACAAAATA CAAAATATAG 120
AATTTATGCA CAGCTAAAAA AACAGTAAAT TGACCCAAAG TCAAACCCAG CAATTTACAG 180
TACAATGAAG AATATTAATT AAACCAATAT AGAAAAATAC CACCTTTCTA CACTCTAACA 240
ATTAAACTTA TAAATCAACA AGTGACTAAG AGTAACTGAA TATGTTTCTC TTTGAAAGTG 300
GCTACAATTG TGTCACTAAA TTACACACTG AATTAAACCT ATATAAACTA TTAGTATAAA 360
TCTATACTGT AAAACACGCA GCAGTATTTT ATGCTCACTG CATCTCCATA AACAACTCAA 420
TACTCTGTGG GCCCACACAC TCACACATTC ATACACCCCC CGTTGCAGGC CTGTATCGCT 480
GCTAGTGTAC GTTGTGGCCG GGAAAATGAA AATGGCCTCT TCACTCTCCT GAGCACAAAT 540
AAAATTAAAC AAGATACCTC AGATGAAGAT GACCTTGATC AAGATGACAG CAAACCAGAT 600
GCCAGCGATC CAGATGACAG CGATCCAGTT GACAGCGATC CAGATGCCAG CGATCCAGAT 660
GACAGCGATC CAGTTGACAG CGATCCAGAT GACAGCGATC CAGTTGACAG CGATCCAGAT 720
GACAGCAATC CAAATGACAG CGATCCAGAT GACAGCAATA TATGACAGTT CTCCAAACTG 780
ACAACACTTG TGAACAACGG GCCAACGAGC CGCGATCGAT CGGCGAACTT CTGCCGCGGG 840
TCTTTCAAAT CCTCACTTTC ACTTTTTCTC CCCAGCTGAG GAGAGACAAG TCTCATGTAG 900
TATTCAGGCT TTTTGTGGTG CTATTTGCTC CTCTTTGACT CTTTCAGCGT TGTTTCATGC 960
AAATCTAACA GTCTCTCTTT TTTCTCCTCC TTATTTTCGG TCTAACCGTC ACTCCCTCAG 1020
TTCAGCTTTA GTCCTCCGTA ACTGTCCGTT GACAATCTAG GCATTTAAAA AATGCTCACT 1080
CACTCTGAAC TGACTAATAA CTGACACTGG AAACTTATAT GATGAAGACA CACCGCGAAC 1140
TTAAAACAAA CACAAAACAA ACTCAAAGTA ATCAAAAACG TGTTGTTCAC ACGCAATATA 1200
TATTCACTTG TTTTTATACT CCGTGAATGT TACGCAATCA AAACAGCCGC GACGCGAGTC 1260
TCCCCTTCAG TTTCCAAAAC TGCCGGCTGT GTCCCCTCTC TCCGCTCTCT GTTCCCAACA 1320
GCCAATCACA TTT 1333