EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-01707 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr11:39570289-39572399 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RREB1MA0073.1chr11:39571621-39571641CCACCACACACACACACACG+6.09
RREB1MA0073.1chr11:39570978-39570998CCCCCACACACACACACACA+6.95
RREB1MA0073.1chr11:39571391-39571411CCACCAAACACACACACACA+6.95
ZSCAN4MA1155.1chr11:39571915-39571930CACACACACTGACAC+6.08
Enhancer Sequence
AACCCTGCCA AACTTTAGGC ATTATTCACC TCCTTTTGAA GTTCAGTTCT GTTCCTCCCC 60
CCCAAAAAAG CTACCTTGAA AAGTGAAAGC CGTGACTTTA GCACCCTAAG CCCTCCGTCT 120
GAACACTACG TGACACATCT GAGTCCTTGA GGAGCGCTGA GACTTCCAGC CCAACAACCT 180
GAGAGGTGAA ACACACACAC ACACACAGAC TTGTTCCTAT ATCCAAGTGA GGACAAGTCA 240
CCATGCATGC GTCTGTGTGC ATTCAGGTTT AAAGTCTCCA CTGGGATATA AAAACAACAC 300
ATTCACACAC AACATACACA TGCAGACACA CACAGAAAAA AACCCTAACT CACACATGCG 360
CACACACTTA TGTACAAAGA CATAAAAATG CACAAGCACA CACAAACACA TGAACAGCAT 420
ACATGGAGAC ATACACACAC ACTCACACAT ACACACAAAA CCACGTACTG TATACAGCAC 480
ACATGCAGAC ATACACAGAA CACATGCAAA CACAGGCACA CAAACTGACT TACACACAAA 540
CACAGACACA TAAACAGCAC ACATGCTGAC ATACACACAC GTACAAAGCA TACTGTACAT 600
AGAGACATAA ATACATGGAC ACACGCACAT ACACACACGG ACACACACAT ACATACATAC 660
ACATACATAC ATACAGTAGA ACACACTAAC CCCCACACAC ACACACACAC ACACACACAT 720
ATTGAAGTCT AACACTACTC AGGAGACTCT AGTGACCTCC ACACACACAC AAACACACAC 780
ACACACAGGC ACACAAACTG ACACACAGTC ACAGATACAC ACACACACAC ACCCATACAC 840
ACAAATGCAA ACACACACAC ACTCTTCTTA CACATACTCA TACACACACA GATACATACA 900
CACTGAAGTC TTGCACTCCT CAATACTCTA GTGACCTCCA CAAACACACA CACACACACA 960
CACACACACA CACANNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 1020
NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNCTTGCG 1080
CATTCTCAGA AAACTCTGGT GACCACCAAA CACACACACA CACAAACTGA CACACACACA 1140
CTCATAAACA CAAATGCACA AACACACACA AACACTGTCT TACACATACT CATGCTCAAA 1200
GACATACCAA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACTGAAC TCTTGTCCTC 1260
CACACGAGAC TCTGGTGACC AGCACACACA CACACACACT GAACTCTTGC GCTCCTCAAG 1320
AGACACTGGA GACCACCACA CACACACACA CGCACACACA TGAGAACTCT TGCGCTACTA 1380
CACACACTAT CACAGATACA CACACTCTTA TACACACCAA TGCAAACACA CACACTCTTC 1440
TTTCACATAC TCACACACAC ATACATGCAC ACTAAAGTCT TGCACTCCTC AATACTCTAG 1500
TGACCTCCAC AAACACACAC ACACACACTT CTTACACATA CTCATGCTCA CAGACATACA 1560
AACACATACG CACACGCGCA CGCGCACGCA CACACACACA CACACACACA CACACACACA 1620
CACACACACA CACACTGACA CGTCTGCACT CATACACACA CACACATACA CACACTTCTT 1680
ACACATACTC ATGCTCACAG ACATACAAAA ACACACACAC ATACACACAC ACACTGAAGT 1740
CTTGTGCTCC TCAACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA 1800
CTGAACTCTT GCGCTTCTCA GGAAACTCTG GTGACCACCA CCCTCCACAC ACATACACAC 1860
ACAGGAGGTG TTGAGGTAAA TGCGGTGTGT TGTGCAGCCA TTAGCACAGT TTTCCCCTTG 1920
ACATGTCAGA CAGGATCGGC CATTAGAACA GTGTCCAACA AAAAGCTGGA GGTGTGCGTT 1980
CAGTGTTTGA AAGCCCGGCA GGTTTGGTCT GGAAGTAGCG CTGCGTTCTG AGAACAGAAG 2040
AGAGACAAAA CGAACAGCGA GCGCAAGTCA AAGAGCACGA GCTCATGAGC CATTCAATAA 2100
AACATCCTTC 2110