EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-01687 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr11:37938962-37941074 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr11:37939087-37939099AAACAAACAATC-6.92
Foxj3MA0851.1chr11:37939592-37939609TTAAGATAAACAAACAG+6.17
NFYAMA0060.3chr11:37939349-37939360AACCAATCAGA+6.62
RREB1MA0073.1chr11:37940663-37940683GGTTTAGGGTTGGGTGGGGG-6.52
Enhancer Sequence
CCGGCTTCTC CTATTACTCT TGATCTATGG GCTCTGTAAG GTCATTTCAT CCCCGTGGCA 60
ACAAGAACGT CACGCTGTTC CTTGACTCAC AGCTTAGACA AATGCCACTG ACCGCTACTG 120
ATCTCAAACA AACAATCGGC TCTCTTGGCG AGCGGTCCTT CCCGTCGCTA ATGTCAGCCA 180
CACAAACACT AACTCTGACT GACCCAAACA CCAACGCATA AACAAAACAA ACAGCCATCA 240
ATGCAATCAC ATCACCTGAG AGGAGTCGGT ATGCCTGTTC GTGGATGACC ATAAGATTCA 300
CGTCTCATCG CTTTGCTGCA CTCTTAAGAT CTGATGAACT TCCGACCCTA ACCTACACAG 360
TATTCAGTGG CGCTTGATCA AACAAACAAC CAATCAGAGC AACCAACTGT TCGCGACTAC 420
ATAGCAACAG ACTAAAAATT CTCAGAAAAA CATAGTAACC ACATACCAAC AGTTTAGAAA 480
CACCTCAGCT ACCACATGAA AACATTGTAA TATAAGCTAG AGCACCAACG CATGTCAACA 540
TTCTAAAAAA ACACCCTAGC AACAGCATAG AAATGTTCCA AAACAACCAC ATAACACAGC 600
ACAAACCTAG CAACTACATC GCAACACCCA TTAAGATAAA CAAACAGAGC AACACTGTAA 660
AACGCTCACA GACACACAAT CAGAACACCC TAGCAACGGC ATAAAACTTT CTAAAACACT 720
TAAGACACCT TAGCAACCCC ATTACAAAAT ACTAAAAACA CTCAGAACGC CCTAGCAACG 780
ACATTAAACA TTCTAAAACA CTTAAGACAC CCTAGCAACC CTATTACAAA ATACTAAAAA 840
CACTCAGAAC ACCCTAACAA CCATATAGAA TCATTCTAAA CATGCAGAGC AACCTGAAGT 900
AGCAACCACA TAACAACAAA CACTAAGTAT ACCCAAGCAT CCACATAGCA ACATTGTAAA 960
ACAATCATAA CATCTTAGCA ACACTATAAA CAACACCCAG ACACAACCAG AACGCTCTAG 1020
CAACTGCATA AAAACGTTCT AAAATACTTA AGACACCCTA GCAACCCCAT TACAAAATAC 1080
TAAAACACCC AGAACACACT AGCAACCACA TAGCCACATT CTAAAACACT CAGAACATCT 1140
TAGCAACACT ATAAACAACA CACACAAACT CAAAGCGCAC ACACACACAC ACACACACAC 1200
AATCAAAAAG CTTTAGCAAC TGCACAAAAA CTTTTTCAAA CACTTAAGAC ACCCTAGCAA 1260
CCCCATATAA TCATTCTAAA ACACTCAGCA CACCCTAGCA ACAACATAGC AACATTCTAA 1320
AACACTCAGC ACACCCTAGC AACTACATAG CAACATTCTA AAACACTCAG CACACCCTAG 1380
CAACATTCTA AAACAGGGGG TAGGCATTAA AAAACAATAT ATTGGGTAAT TTAATAGATA 1440
ACATAAATAA TACTCGCTAC TGTTTTTACA TTACTGTGAT AGATGGGTTT AGGGTTGTGA 1500
TGAGGGTAAA CGTTAATAAA ATATAATTTA TTGGGTAATT TAATAGATAA CATAATACTC 1560
GCTACAGCTA CTGTTTTTAC GTTACTGTAA CGGTTGGGTT TAGGGTTGGG GGTAGTCGTT 1620
AAAAAAAATT AGTGGGTAAT TTAATAGATA ACATAAATAA TACTTTGTAC AGCTACTGTT 1680
TTTACGTTAC TATGATGGAT GGGTTTAGGG TTGGGTGGGG GTAGCAGTTA AAAAATACAA 1740
TTTAATGGGT AATTTAATAG ATAATATAAA TAATACTCTG TACAGCTACT GTTTTTACCT 1800
TACTATGGTG GTTGGGTATA GGGTTGGGGT GGGGGTAGGT GTTAAAAAAT ACAATTTATT 1860
GGGTAATTTA ATAGATAACA TAAATAATAC TCGGTACAAC TACTGTTTGT ACGATACTGT 1920
GATGGTTGGG TTTAGTGTTA GGGTGGGAGT AGACGTTAAA AAACACAATT TATTGGGTAA 1980
TTTAATAGAT AGCATGAATA ATACTCGTTA CAATCACTGT TTTTACATCA CTGTGAGGGT 2040
TGGGGTGGGG ATAGGCGTTA AAAATACGAA TTATCGTGTA ATTTAATAGA TGGCATAAAT 2100
AACACTGAGT AC 2112