EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-01664 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr11:35727691-35729391 
TF binding sites/motifs
Number: 18             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXF2MA0030.1chr11:35728994-35729008CAAACATAAACAAA+6.38
Foxd3MA0041.1chr11:35728147-35728159AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr11:35728167-35728179AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr11:35728209-35728221AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr11:35728213-35728225AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr11:35728217-35728229AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr11:35728221-35728233AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr11:35728274-35728286AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr11:35728571-35728583AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr11:35728831-35728843AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr11:35728931-35728943AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr11:35728935-35728947AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr11:35728731-35728743AAACAAACAATC-6.92
Foxj3MA0851.1chr11:35728994-35729011CAAACATAAACAAACAA+6.05
IRF1MA0050.2chr11:35729100-35729121CAGTAGTTCCACTTTCAGTTC+6.22
SOX10MA0442.2chr11:35728199-35728210AAAACAAAGCA+6.02
SOX10MA0442.2chr11:35728542-35728553AAAACAAAGGA+6.32
Sox3MA0514.1chr11:35728542-35728552AAAACAAAGG-6.02
Enhancer Sequence
TATGAAAATA TAAATATGTA ACAACACTCT AGGGAAATAT CAAACTCTTT TTTTTTTTCA 60
TTCAAAATTA CACAATAAAA AAATTTTACA ATTCTAATAT AAATATTAAA ACGAAGCTAT 120
TACTTCTTTC TGGCAACACT GCCAGTCTCC ATGGAGTGTC TTTCTCAGCC AGATGCATAT 180
TGCACGTGAG TTGGTCATGC CCACTGATTC ACATTTGGCA TTTTTCCTAT GTTACGCGTT 240
CAGCTGTAAT GATATATACC ATTGTACCTT CCAGCCCTAA TAATACATAT TACATGATAT 300
CATAATGATT ACAGAATATT TATAATTGCT TCCAAATTAG ATACAAATGG ATTTTTAAAG 360
GGGACAAAAT AAAATAATAA AACCAACAAA CAAACCAACC AGCCAACCAA CAAACAACCT 420
AACAAGCAAA CAAACAAAGC AAGCAAATAA GCCAACAAAC AAACAAACAA GCCAACAAAC 480
AAACAAACCA ACAAGCAAAC TAACTAACAA AACAAAGCAA ACAAACAAAC AAACAAACAA 540
ACGGGCCAAC AAACAAGCAA ACCAACAAGC AAACTAACTA ACAAAACAAA CAAACAGGCC 600
AACAAACAAA CCAAGAAACA AGGCAACAAA CAAACCAATA ATCCAACTAA CTAACTAACT 660
AACTAACTAA CCAACCAACA AACCAATAAA CAAATGACTT AACAAACAAG CCAACGAAAA 720
AACAAACCAA CAAACCAAAA ACTAGCAAAC AGACAAGCCA AGAAATGAAG CCAACAAACA 780
AATCATCAAA CAAACAAGCC AACAAGCAAG TGAACAAACA AACAAGCCAA CAAAAAAACT 840
GACAAAACAA CAAAACAAAG GAACCAACAA ACAGGCCAAA AAACAAACAA ACCAACAAAC 900
AAATGGATTA ACAAACAAAC CAATAAACAA GGTAACAAAC AAACCAACAA TATAACAAAC 960
AAACTAACTA ACTAACCAAC CAATAAACAA ATGATCCAAC AAGTCAACAG ACAAACAAAC 1020
CAACAGACAA ATGGATTAAC AAACAAACAA TCCAATAAAC AAGGCCACAA ATAAACCGAC 1080
AGTCTAACAA ACCAACTAAC TTACCAACCA ACCAACAAAT TGTTGACCCA ACAAGCCAAC 1140
AAACAAACAA ACCAACTAAT AAACAAACCA TAAACAAGCA AAGAAACAAG CCAACAAATA 1200
AAGCCAACAA ACAAACAAAA TAAAAACAAA CAAAACAATA AAACAAACAA ACAAACTAAC 1260
TAACTAACTA ACTAACTAAC TAACTAAATA ACTAACCAAC CAACAAACAT AAACAAACAA 1320
ATAAATAAAA TCCTTCAAAT AATCAGGGAC CGAGCTGAAG GATATTAAGT GAGCGAGTAG 1380
GTGAATATAA ACTGAACCAC AGACTACTAC AGTAGTTCCA CTTTCAGTTC ACTTTAGTTC 1440
AGTTCTGTTC AAACGCTACA CCACAAGCTT CTAACTTCAT CACCCCCAGC AGGTCACATT 1500
TTAATATGCA TATCTGACTG ATCCCAGAGC AGCTTGTGTC AAAGGCAGTA ATGAGAAGAG 1560
TCGTTTCCCT AATATTTGCA TGCGACAGTG TAATAGCAAT AATGTGACAG TAGAGAAGAG 1620
ACAGTGATGA TCAGAGCAAA CATGACACAC TCATCAAAGC TCATCAAGCA TTTGCTTAAA 1680
TACATGCAGT TAAGTCTCAT 1700