EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-01513 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr11:22716419-22717572 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Lhx3MA0135.1chr11:22716654-22716667AAATTAATTATAT+6
ZNF384MA1125.1chr11:22717557-22717569ATAAAAAAAAAA+6.27
ZNF384MA1125.1chr11:22717556-22717568AATAAAAAAAAA+6.62
Enhancer Sequence
ATTTAAAGCA CATCTTTGAC AGCTTCAGGG TATCTATTTC GGAAACTATT TACCATGCTT 60
GCCCTTGTCA TAACCTAACA TCCTTCAGTT AGCAGGCTAG CACAATCACA CCACCTACTG 120
CTTTTAAAAC ATGTATAGAG TCTTGAAAGT CTCAAAAGTG CTTAAGAAGT GCGTGAGAGA 180
GAAATATCAT GGCAAATATT TCCTGTCTTT AATTCAAGTG CATTTCTGGA AGCACAAATT 240
AATTATATCA CTGCTTAGAG CTGAGGTCAT CTAAGCAGTA AGAAGGGTCA GCCACTTATC 300
AGTCATGCTG CGATGAAGCC CCGAGGCAGA GCAAGAGATA CTGGGCAGGG ATTAGGACAC 360
AACCTCTGCG GTTATTAAAG CGATCTTTGC TAGAGTATAA CATTCGCTGC CAAACTCTCA 420
TCGAACGAGC CAAACACTCA CCCGGGCAAA GAGCTAACAA AACAGGTCAT TTTAATAGCA 480
AAACAAAGTG AGCTGTGAAT GACATGCTTG TACCAAAACA ACAATGGTAC AATGCTGCAT 540
ATATGCACGC ATACACACAC ACACACACAA ACACACACAC AAACACACAC ACAAACACAC 600
ACACAAACAC ACACACAAAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC 660
ACACACACAC ACACACAAAC ACAAACACAA ACACAAACAC AAACACAAAC ACACACAAAC 720
AGACGAAAAT AAAGGATTAC CATAGCAAAG CCAACATCAG CTTTTTTGAG AGCAGGACCA 780
TCATTAGTGC CGTCTCCAGT CACAGCGACC ACCTGTCTGG TTTCTCCAAC AGTGCTGTCG 840
ATGATGCCTA AAAGACAACA ACACAGGAAC TGCCTAAGGA TAAACCTATA AATAACACAC 900
ATACATACAC ACACATACCA TACAGTATAC CAGGGTTTCT GCAGGTATCA ACAAGGCAAA 960
CTGAAGACCC ATTAGGACTT ATACAGCATT TTATTTCTAA TTGAAATTAT TTTTACTTTA 1020
TTACAAAAAT TCTTATTAGT TTCTACTTAG CCACATATTT TATATGTGTC AAAATGAGCA 1080
AACGTAAGCT GTATACATAC ACAGAGCTGG GCGATATTGA TAAAAAAATT AATAATAAAT 1140
AAAAAAAAAA TTC 1153