EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-01348 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr11:8352573-8355150 
TF binding sites/motifs
Number: 35             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ESX1MA0644.1chr11:8353410-8353420ACCAATTAAC+6.02
Foxd3MA0041.1chr11:8353357-8353369AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr11:8353300-8353312AAACAAACAATC-6.92
HOXA13MA0650.2chr11:8353945-8353956ACCAATAAAAC+6.32
HOXA13MA0650.2chr11:8354211-8354222ACCAATAAAAC+6.32
HOXA13MA0650.2chr11:8354245-8354256ACCAATAAAAC+6.32
HOXA13MA0650.2chr11:8354486-8354497ACCAATAAAAC+6.32
HOXA13MA0650.2chr11:8354520-8354531ACCAATAAAAC+6.32
HOXB13MA0901.2chr11:8353945-8353956ACCAATAAAAC+6.32
HOXB13MA0901.2chr11:8354211-8354222ACCAATAAAAC+6.32
HOXB13MA0901.2chr11:8354245-8354256ACCAATAAAAC+6.32
HOXB13MA0901.2chr11:8354486-8354497ACCAATAAAAC+6.32
HOXB13MA0901.2chr11:8354520-8354531ACCAATAAAAC+6.32
Hmx2MA0897.1chr11:8354097-8354114CCAACCAATTAATCAGT+6.5
Hmx3MA0898.1chr11:8354097-8354114CCAACCAATTAATCAGT+6.05
LHX2MA0700.1chr11:8353274-8353284ACTAATTAAC+6.02
RFX1MA0509.2chr11:8352585-8352601TGTTGGCATGGCAACT+6.01
RFX1MA0509.2chr11:8352585-8352601TGTTGGCATGGCAACT-6.03
RFX5MA0510.2chr11:8352585-8352601TGTTGGCATGGCAACT-6.22
RFX5MA0510.2chr11:8352585-8352601TGTTGGCATGGCAACT+6.23
RREB1MA0073.1chr11:8354368-8354388CAACCAACCAACCAACAACC+6.09
RREB1MA0073.1chr11:8353955-8353975CAACCAACCAACCAACCACC+6.21
RREB1MA0073.1chr11:8354190-8354210CAACCAACCAACAACCAACC+6.33
RREB1MA0073.1chr11:8354465-8354485CAACCAACCAACAACCAACC+6.33
ZNF384MA1125.1chr11:8353421-8353433AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr11:8353422-8353434AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr11:8353423-8353435AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr11:8353424-8353436AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr11:8353425-8353437AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr11:8353426-8353438AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr11:8353427-8353439AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr11:8353418-8353430ACTAAAAAAAAA+6.32
ZNF384MA1125.1chr11:8353529-8353541ACTAAAAAAAAA+6.32
ZNF384MA1125.1chr11:8353420-8353432TAAAAAAAAAAA+6.37
ZNF384MA1125.1chr11:8353531-8353543TAAAAAAAAAAA+6.37
Enhancer Sequence
TTTGTTCTGT CCTGTTGGCA TGGCAACTAA GTCAAGCCCT CGCTGTTATC AAAGCAAACC 60
CATTGGGGCA CAGTGTGTCA GTGTATGTGT GTGTGTGTAG TATCCTGCGG TAATGAAAAC 120
TGCAGTTTGG AACTCTGTGG CATAAAGATG ATGCTGCGAC GTATATGCAT CTGCCGTGCT 180
ACATGTCAGA CTACATGACA CTGATTCAAA GAGAACTGAG AGCGGAGGAG AGAAAAGCCT 240
CAAGCAATGA CCTAAAGTGG CTCGATTTGT TTTACTGTGT ATTTTTGTGT TTGTATTCTC 300
ATAAGGAAAA CTGTAAGTCA AATAGTGGTT AAAATCTTGT AACACTGTGA CTTTTTTTGG 360
AGTCGGTGTG AAATTGAAAT TTGCTCTTTA TACGCATATT GCCTCCATAA TATTATATAC 420
ATAATAATAA TACCATATAC ATAATAAATA ATAATCCCAT AGCGTTCCCA CCTCCTCCTC 480
GGAATTACTT TTTTTCACTT CTGGAATGCC TTACAGAAGG GGTTATCAGC GTGTGTCTCA 540
TTTTTGCCCT GCTTTTGTCT ATTCCACCAT CTTCCATCAG TCTTCCACCA TTTAATTAGC 600
AACACCCATC TTCCAATAAT CAATCAGATC CAATAAGCAC TTGTTTTTCC TCTCATTTCA 660
AGACCATTTT ATTTGGATGT ACGTCACAAT ATGGGAAAAA AACTAATTAA CCAAACACCC 720
AACCAACAAA CAAACAATCA AACAACCAAC CATCAAACCA ACAATCAGAC AACCAACAAA 780
CAAAAAACAA ACAAACAACT AACCAAATAA TCAGCCAGAC AACCAGCCAA TGAACCAACC 840
AATTAACTAA AAAAAAAAAA AAAAAATCAA CCAACCAACC AACAAACCAA TCAACCATAC 900
AACAAACCAA GCAACCAACC AATCACCAAA CAACCAGCCA ATGAACCAAC CAGTTAACTA 960
AAAAAAAAAA TCAACCAACC AACAAACCAA TCAACCATAA AACAAACCAA GCAACAACCA 1020
ACCAACCACA TAACAACCAG CCAATGAACC AACCAATTAA ATAAAAAAAT CAACCAACCA 1080
ACCAAACAAC CAACCAATCA ACCAACCAAC CAACAAACCA ATCAACCATA CAACAAACCA 1140
AGCAACAACC AAACAACCAA CCAACCACCA AACAACTAGC CAATGAACCA ACCAGTGAAC 1200
TAAACAATAA ACCAACCAAC CAACCAAACA ACTAGCCAAT GAACCAAACA ACGAATGAAC 1260
CAACCAACCA ACCTAATGAC CAACCAAATA ATCAGCCAAA AAACTATTCA ACAAATCAAC 1320
CAATTTACTA AACAATGAAC CAACCAACAA CCAAACAACC AACTACCTAG TGACCAATAA 1380
AACAACCAAC CAACCAACCA CCAAATAATC AACCAACCAA ACAACCAGCC AATAAACCAA 1440
CCAGCGAACC AAACAATGAA CCAAAGAACC AATGAACCAA ACAAACAGCC AATGAACCAA 1500
ACAATGAACC AACCAACCAA CCAACCAACC AATTAATCAG TCAATAAACC AACCAATTTA 1560
CTAAACAATG AACCAACCAA CCAACCAACC AACCAACCAA CCAACCAACC AACTAATCAA 1620
CCAACCAACA ACCAACCAAC CAATAAAACA ACCAACCAAC CAAAACCTAC CAACCAATAA 1680
AACCAACCAA CCAAACAACC AACCAGCCAA TCAACCAACC TAACAACCAA CCAACCAACC 1740
AAATAATCAG CCAAACAACC AGTCAATGAC TCAACCGATT TACTAAACAA TGAACCAACC 1800
AACCAACCAA CAACCAAACA ACCAACAACC TGGCAACTAA TAAAACAACC AACCAACCAA 1860
TAACCTACCA ACCAACCAAC CAACCAACTA ATCAACCAAC CAACAACCAA CCAACCAATA 1920
AAACAAACAA CCAACCAAAA CCTACCAACC AATAAAACCA ACCAACCAAA CAACCAACCA 1980
GCCAATCAAC CAACCTAACA ACCAACCAAC CAACCAACCA ACCAAATAAT CAGCCAAACA 2040
ACCAGTCAAT GACTCAACCA ATTTACTTAA CAATGAACCA ACCAACCAAT CAACCAACCA 2100
ACAACCAAAC AACCAACAAC CTGGCAACTA ATAAAACAAC CAACCAACCA ATAACCTACC 2160
AACCAATCAA CCAGCCAACC AACAAAATTT TAGGTAATAT CAATTAAATA GGGCTGTCAT 2220
CTTGATTTGA CAGTGGCTTT TAAGCAATGT AAATAGCATG TGTTAATAAA CAACAGCATA 2280
CAGTGTCATT CTTTGCAATG TCTATGTAAC TCCCTGTGCC ACCCAGTTTT ATAGTGACTT 2340
TAATATCAGG GCCTGTTCTA CTTATGAATA TTATTTGCTT AAACAATGGT CTGAATTATG 2400
GGCGGGGTCT GTTTTGTCAG TCAATGACAG ACAGGCAGTT GTTATTGTTT TTGTTGTAAC 2460
ATTTTTAATT AGTATGAAGT TAGTATGGGC TTTATAAAAA CCAAGTATTC ATCAATTATG 2520
GAAAAAAATA AAATAAAATG CACACCGTAA AGTCTAGCAG TCACAGTGAT TAATTGT 2577