EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-01322 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr11:5353475-5354563 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HOXA10MA0899.1chr11:5354119-5354130TTTTTATTGCC-6.32
ZNF384MA1125.1chr11:5354280-5354292TTTTTTTTGATA-6.14
ZSCAN4MA1155.1chr11:5353655-5353670CACACACACTGTAAA+6.76
Enhancer Sequence
TGTCAGCCAC CAAATGAGAG CAGAAACTGT AAGCTGTTGG AAAATTGGAG TATATGTGGA 60
GTATAAATCT TATAAATAAC AGTATATAAA TGCATGTTTC ACTTGTTTAG CCAGGATGTG 120
ATAACACTCA CTAACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA 180
CACACACACT GTAAACAGTA CACAGTTTAA TACTGAATGA AAAGGGGAAT CCATTTCACA 240
GCACACACAT ACACAGAGAG AGAGAGAAAA AAAAACTCGG AGCTTAAACA TTGTAAGCAT 300
TATTCAAGTG GAAAACGATT TTCCACTTCA ACAATGTTAA TGCACTATAA TGACATGTCA 360
TAAATTCCCA GCGTTGTTCA CTCACACAAG GCCCAAAGTA ATGACTTTAA AACAAATTAG 420
CACTGAAACT TCAACACAAA CCATCTATTT TTCTGACATT AAGTGTGTTT ATATTACTTT 480
CTTCCACCGT TCCAACTCCA CAAAAGCCAG ATTCGTGCAA TAAATTAGTT ATTTTGCGCA 540
GTAATGCATT ACTGTGTGCA CCTTCCGTCT CTGCCGCTGA ACGGCATCCT ATAAAATCTT 600
TTTAGATAAC AGATTCATGC CTGCCTTTTT TCCAATATTT GTATTTTTTA TTGCCTTTCC 660
AAGAAAAGGG GAACAACCAA TTCCTGACAT AATGTTATAT TTTCCTCTCT GCCTCCTCTG 720
ACACCGAAAA CGCATCCATT CTTTAAAAGC CATGTGAAAC CTGGAGGGCA AATAGATGTT 780
GTCCCAGTTC TTCACTTTGC TGCAATTTTT TTTGATAATC TCGCCGTAGA TCCCGTCCGC 840
TCCTGCCTTT CTTTGCTCAA AAACAGTGTT TCCCGTATTT TATGAAGAGA TGTAATACCC 900
GTGAAATGGG AAATAAAAGG CACATGACAC TTTTACAGAT CTCAGGGCGC CTTTGTGGCT 960
CTTTCATACT CTGGGAGGAA GGATGAGTAG ACAATAATTT CATTTCTCTC TCTCTCTCTC 1020
TCTCTCTCTT CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTTTCTCT CTATCTTTCT CTCTCTCTCT 1080
CTCTCTCT 1088