EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-01248 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr11:203579-205243 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ATF3MA0605.2chr11:205061-205073GATGACGTCACT-6.11
ATF3MA0605.2chr11:205061-205073GATGACGTCACT+6.14
ATF7MA0834.1chr11:205060-205074CGATGACGTCACTG-6.06
ATF7MA0834.1chr11:205060-205074CGATGACGTCACTG+6.16
CREB3L4(var.2)MA1475.1chr11:205061-205073GATGACGTCACT-6.02
Creb5MA0840.1chr11:205061-205073GATGACGTCACT+6.37
IRF1MA0050.2chr11:204216-204237AAACTAAAACTGAAACTAAAC-8.25
JDP2(var.2)MA0656.1chr11:205061-205073GATGACGTCACT+6.07
JUNB(var.2)MA1140.2chr11:205061-205073GATGACGTCACT+6.07
LHX2MA0700.1chr11:204758-204768GTTAATTAGT-6.02
RREB1MA0073.1chr11:204138-204158ACACAACACACACACACACA+6.19
RREB1MA0073.1chr11:204368-204388CCCCCCAACACACACACACA+6.69
RREB1MA0073.1chr11:204370-204390CCCCAACACACACACACACA+7.29
Enhancer Sequence
TGAATCAAAT ATATACATTT ACTCAGATGT TTGAGTATTT TACAGTCCTG AAAAACACAA 60
GCCTACACAA AAACATGTAA AGGGATTCGC TACTTTGGTA AAAATGTTGT TTTTTTCATG 120
GCAAGGCTGA CATTTGGATG GAATCACTCA ATAATCAAAA TCAGGACAAG GAGCGCTGTT 180
AAACACCATA TACAGCAGGA CAGCTGAGGC CTGCAGCGCG ATGCGGCTCA ACAAACCCAG 240
GAACACAGGA CTCATCTGGG TAGACAACAA CAGCAGACAT CATCCTCACA CACCACCTCT 300
TAGATTAAAC GTAATGAAAG GCTCAGAGTT CACACACACA CACACACACA CACACACACA 360
CACACACACA CAGAGAGAGA GAGACCGCTG TTCATCTGGA CTTTCACCTG GACTACAGCA 420
CAGAAACACA CTTTAACCCA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA 480
CACACACACC TGTCAGAAGA GTTTCAGAGC GCAGTTATTA GCATATCCCT GATCAGCAGA 540
GACAAAGTCA AGCTCAGATA CACAACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC 600
ACACACACAC ACATCAAATG AACACGCAGT TCTGATCAAA CTAAAACTGA AACTAAACAG 660
AGCTGTGTTC ACCACACTAC AGGCAAACTA ACACTAACTA CACCATTAAT AACACACCAA 720
CAACCACTGA TGCACAGCAC ATTTCAGAAT TTTAAATAAT TACTAATAAT AACAATGACA 780
AAAATACACC CCCCCAACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACAAATCA GTCTCTGACG 840
CACACTCAAA TTCTGTCTAA CACACACATT TTCACTCACA CTCAACTCAA TCTCTCTTTC 900
ACACACAAAA AAACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC 960
ACACACACAC ACACAGATTA ATAACAAACA GGAAAACCCT CACACACCTA CACACGGAAA 1020
CAACATTTCG CTCTCTCACA CACTCACAAA CAAACACACA AACAACCGCA CACAGCGAAC 1080
GTAATCGAAG GGAAAGTTCA GCTCCAGCTC GACAATCCCC GTTTAATAAA AGACACGCAA 1140
CCCTCCGTTA TACATAACAC CTAGTCAGTC GGTCAGTTGG TTAATTAGTT AGCTAGCCAG 1200
CTAGTCAGGC AGCAGTGGTC GGTTACCGTC AGCTAGGCAG CAGCGGCAGT ATTAGTGGTT 1260
GTGGTCGTGA CGTGAGTTCT TATCCGCGGT TTGTTTACGC GCTCCTCGGT CGTCGTGTAA 1320
CGGCCGCTGG TCAAATCTTC TTCATTAGTG TAATTAGAAG CTTAATGTGC GAGTGTGATG 1380
ATGATTTCAT TACCATAAGC CGTCAATCGC GTCTCTTCCC GTCTGTGTGT TTCTGAAGGC 1440
CTGAGTTTGG GTTCAACGCC TCTCTCGCAC GTCAGGCAAC GCGATGACGT CACTGGCGTC 1500
ACGCGCTCGC TCTTCTTCGT GTGCTTTTAA GTGCACTTGT TAGTGAGGTT TGGCCTCTGC 1560
TGGAGCGGAG ATGTGTAAAT CGCTCAGTCA TCGAGTGCAT GAAACTCTGT TCACTTGGGA 1620
TGAGGAAACA CCATCACTGT AAAGTGAATT AAAATAATTA AACA 1664