EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-01186 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr10:43300950-43303032 
TF binding sites/motifs
Number: 89             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr10:43301822-43301839ATTCATTAATTAATTCA-6.61
Alx1MA0854.1chr10:43301986-43302003ATTAATTAATTAATTCA-7.27
Alx1MA0854.1chr10:43302485-43302502ATTAATTAATTAATTCA-7.27
ArxMA0874.1chr10:43302486-43302503TTAATTAATTAATTCAT-6.04
ArxMA0874.1chr10:43302478-43302495TTCATTAATTAATTAAT-6.09
ArxMA0874.1chr10:43302133-43302150GCTCATTAATTAATTTA+6.39
ArxMA0874.1chr10:43301823-43301840TTCATTAATTAATTCAT-6.39
ArxMA0874.1chr10:43301986-43302003ATTAATTAATTAATTCA+6.7
ArxMA0874.1chr10:43302485-43302502ATTAATTAATTAATTCA+6.7
ArxMA0874.1chr10:43302477-43302494GTTCATTAATTAATTAA+6.82
ArxMA0874.1chr10:43301822-43301839ATTCATTAATTAATTCA+7.59
Lhx3MA0135.1chr10:43301985-43301998TATTAATTAATTA-6.25
Lhx3MA0135.1chr10:43301989-43302002AATTAATTAATTC-6.29
Lhx3MA0135.1chr10:43302488-43302501AATTAATTAATTC-6.29
Lhx3MA0135.1chr10:43302480-43302493CATTAATTAATTA-6.46
Lhx3MA0135.1chr10:43302136-43302149CATTAATTAATTT-6.54
Lhx3MA0135.1chr10:43301988-43302001TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr10:43302483-43302496TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr10:43302487-43302500TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr10:43302484-43302497AATTAATTAATTA-6.78
POU6F1MA0628.1chr10:43301826-43301836ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr10:43301986-43301996ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr10:43301990-43302000ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr10:43302137-43302147ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr10:43302481-43302491ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr10:43302485-43302495ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr10:43302489-43302499ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr10:43301826-43301836ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr10:43301986-43301996ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr10:43301990-43302000ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr10:43302137-43302147ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr10:43302481-43302491ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr10:43302485-43302495ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr10:43302489-43302499ATTAATTAAT-6.02
SOX21MA0866.1chr10:43302002-43302017AACACTACATTTGTT-6.3
ZNF24MA1124.1chr10:43302695-43302708CACTCATTCACTC+6.01
ZNF24MA1124.1chr10:43300958-43300971ACTTCATTCATTC+6.06
ZNF24MA1124.1chr10:43301194-43301207AGTTCATTCATTC+6.13
ZNF24MA1124.1chr10:43301474-43301487TTTTCATTCATTC+6.15
ZNF24MA1124.1chr10:43302675-43302688AATTCATTCACTC+6.1
ZNF24MA1124.1chr10:43301769-43301782TCTTCATTCATTC+6.24
ZNF24MA1124.1chr10:43301909-43301922TATTCATTCACTC+6.28
ZNF24MA1124.1chr10:43302608-43302621TATTCATTCACTC+6.28
ZNF24MA1124.1chr10:43301877-43301890TACTCATTCATTC+6.29
ZNF24MA1124.1chr10:43301226-43301239CATTAATTCATTC+6.2
ZNF24MA1124.1chr10:43301230-43301243AATTCATTCATTT+6.32
ZNF24MA1124.1chr10:43301294-43301307TATTCATTCATTA+6.36
ZNF24MA1124.1chr10:43301644-43301657CATACATTCATTC+6.37
ZNF24MA1124.1chr10:43302348-43302361TGTTCATTCATTC+6.3
ZNF24MA1124.1chr10:43301361-43301374CATTTATTCATTC+6.48
ZNF24MA1124.1chr10:43301429-43301442CATTTATTCATTC+6.48
ZNF24MA1124.1chr10:43301518-43301531CATTTATTCATTC+6.48
ZNF24MA1124.1chr10:43301425-43301438CATTCATTTATTC+6.5
ZNF24MA1124.1chr10:43301514-43301527CATTCATTTATTC+6.5
ZNF24MA1124.1chr10:43301656-43301669CATTCATTTATTC+6.5
ZNF24MA1124.1chr10:43301111-43301124CACTCATTCATTC+6.92
ZNF24MA1124.1chr10:43302244-43302257CGTTCATTCATTC+6.98
ZNF24MA1124.1chr10:43301773-43301786CATTCATTCATTA+7.12
ZNF24MA1124.1chr10:43302504-43302517CATTCATTCATTA+7.12
ZNF24MA1124.1chr10:43302496-43302509AATTCATTCATTC+7.22
ZNF24MA1124.1chr10:43300974-43300987CATTCATTCATTT+7.34
ZNF24MA1124.1chr10:43301510-43301523CATTCATTCATTT+7.34
ZNF24MA1124.1chr10:43301652-43301665CATTCATTCATTT+7.34
ZNF24MA1124.1chr10:43302256-43302269CATTCATTCATTT+7.34
ZNF24MA1124.1chr10:43302384-43302397CATTCATTCATTT+7.34
ZNF24MA1124.1chr10:43301522-43301535TATTCATTCATTC+7.52
ZNF24MA1124.1chr10:43300962-43300975CATTCATTCATTC+7.82
ZNF24MA1124.1chr10:43300966-43300979CATTCATTCATTC+7.82
ZNF24MA1124.1chr10:43300970-43300983CATTCATTCATTC+7.82
ZNF24MA1124.1chr10:43301478-43301491CATTCATTCATTC+7.82
ZNF24MA1124.1chr10:43301482-43301495CATTCATTCATTC+7.82
ZNF24MA1124.1chr10:43301486-43301499CATTCATTCATTC+7.82
ZNF24MA1124.1chr10:43301490-43301503CATTCATTCATTC+7.82
ZNF24MA1124.1chr10:43301494-43301507CATTCATTCATTC+7.82
ZNF24MA1124.1chr10:43301498-43301511CATTCATTCATTC+7.82
ZNF24MA1124.1chr10:43301502-43301515CATTCATTCATTC+7.82
ZNF24MA1124.1chr10:43301506-43301519CATTCATTCATTC+7.82
ZNF24MA1124.1chr10:43301648-43301661CATTCATTCATTC+7.82
ZNF24MA1124.1chr10:43302248-43302261CATTCATTCATTC+7.82
ZNF24MA1124.1chr10:43302252-43302265CATTCATTCATTC+7.82
ZNF24MA1124.1chr10:43302352-43302365CATTCATTCATTC+7.82
ZNF24MA1124.1chr10:43302356-43302369CATTCATTCATTC+7.82
ZNF24MA1124.1chr10:43302360-43302373CATTCATTCATTC+7.82
ZNF24MA1124.1chr10:43302364-43302377CATTCATTCATTC+7.82
ZNF24MA1124.1chr10:43302368-43302381CATTCATTCATTC+7.82
ZNF24MA1124.1chr10:43302372-43302385CATTCATTCATTC+7.82
ZNF24MA1124.1chr10:43302376-43302389CATTCATTCATTC+7.82
ZNF24MA1124.1chr10:43302380-43302393CATTCATTCATTC+7.82
ZNF24MA1124.1chr10:43302500-43302513CATTCATTCATTC+7.82
Enhancer Sequence
GCTAACACAC TTCATTCATT CATTCATTCA TTCATTTATT ATTTCTTTCT TTCTTTCTTT 60
CTTTCTTTCT TTCTTTCTTT CTTTCTTTCT TTCTTTCTTT CTTTCTTTCT TTCTTTCTTT 120
CAATCAATCG TTTATCCATT TAATCATCGA CTTAATTTGT TCACTCATTC ATTCAGTTAA 180
TCACACACGC CTTTAATCAT TTATTTACTA ATCAAATTTT TATTCATTTA TTCGTTAATT 240
CATTAGTTCA TTCATTCAAT ATTTTGCTAA CTTGTTCATT AATTCATTCA TTTATGCATT 300
CAATTATTGG CTCACTCACT CCATTCTTTC ACTTACTACT TTTTTATTCA TTCATTAAGT 360
CATCAATTAA TACATTCAGT AATTTGCTAA CTTGTTCATT CAATTATTAT TCATTTATTC 420
ATTCAATCAT TGGCTCAGTC ATTCATTTAT TTACCCATTC ATTAATTTAC TTGCACATTC 480
ATTTATTCAT TCGCTCACTC CATTTATTCA CTAACTCATT CCTTTTTTCA TTCATTCATT 540
CATTCATTCA TTCATTCATT CATTCATTCA TTTATTCATT CATTCAATAA TTTGCTAACT 600
TCTGTAGTTA GTTTGTTCAT TTATTTATTC TTTTTATTAA TTTATTCATT AGCTCAATCA 660
TTTATTAATT CACTCACTCA TTTATTCACT TATACATACA TTCATTCATT CATTTATTCA 720
ATAATTGGCT CAATTATTCA TTTTTTCACT CATTCAGTCA GTCAATCACT GATTCCCTCA 780
TTCACTCACT CCATTCATTC ACCTACTCTT AAATTTTTTT CTTCATTCAT TCATTAGTTC 840
AATAATTATT TAATTCAGTA TTTTGCTATC TTATTCATTA ATTAATTCAT TTATTTATTC 900
AATCATTGGC TCAGTCATTC ATTTGTTTAC TCATTCATTC CTTTACTTAC ACATTAATTT 960
ATTCATTCAC TCACTCCATT CATTTACTTG CTCATTTTTT GTTAATCAAT TCATTTGTTC 1020
ATTCACTCAT AAGCTTATTA ATTAATTAAT TCAACACTAC ATTTGTTTAG TTACTCATTA 1080
ATGAATTACT TAATTCATTC AAACGACATT CTTTTATTCA TTTTGTCATT GGCAAATAAT 1140
CATTTGTACA CTCTCTTGTA AGTTCACTCT CGTTCTCCCA CTCGCTCATT AATTAATTTA 1200
TTCACGTACT CGCACATTAA TTTATTCATT GTTTTACATA CTCATTCGTT GACTCACTCA 1260
TTAATTCACT CATTCCCTCA CTCACTTGTT CGTTCGTTCA TTCATTCATT CATTCATTTG 1320
TTTATTCATT CAATCATTGG CTCAATTGTT CATTTGTTCA CTGACTTATT ATTTCAAACC 1380
ATCATTCCCT CCCTCACTTG TTCATTCATT CATTCATTCA TTCATTCATT CATTCATTCA 1440
TTCATTTGTT TATTCATTCA ATCATTGGCT CAATTATTCA TTTGTTCACT CACTCATTAA 1500
TTCAAACCAT CATTCCCTCC TTCACCTGTT CATTAATTAA TTAATTAATT CATTCATTCA 1560
TTCATTAACT CATTTGTTTA TCCATTTAAT TATTGGCTTA ATCACTCATT TGTTCACTCA 1620
CTTGTTCATT CTTTCATTTA TTCACACACT CATTTATTTA TTCATTCACT CACTCTATTC 1680
ACTCACTAAT TCACTCACTC TCTCTCAATC ACTAGTTAAT TCAGTAATTC ATTCACTCTT 1740
TCTCTCACTC ATTCACTCTT TCGTATATTT CTCTCCACCA CTTGTCTTGT TCGTCTATTC 1800
GGGCACATTT ATAAATTCAG TCTGTTGTAA TTCCGTCAAC TTCATCAATA TTTACTTCCT 1860
CCCAATCATA TTCTCCTCCA CTCGTCCGCT CCCTCCACTA GACTCATTCA CATCTGTGCG 1920
ATGTATGAGA GCAGCACCGC TCGATCTCCG CTGATTGGCC AAAATGGCTC TCAACACTTA 1980
ACCATTCCCA GAGAAGCAGC GCTCTTTATG TGGAGCTTTA ATTGAGGTTT CCCTCGACTG 2040
ATCTCATGCC AAGCTCAAGG GTGTCGAGGA GCTCCAGTGT CT 2082