EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-01169 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr10:42424263-42425880 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr10:42425509-42425521AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr10:42424923-42424935AAACAAACATAC-6.37
PBX2MA1113.1chr10:42424681-42424693CCTGTCAATCAT-6.74
SP4MA0685.1chr10:42424658-42424675GGAGTGGGCGGAGCTAA-6.02
Enhancer Sequence
ATGCCTCGGG GAGAAGCGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TAAGCAGATT GATGCAGTTT 60
GAGAAATACA CCTGGAGAGA GTTTGTAGCT GTCTGCCTGA TGTCAAGGGG TCGAGGGAAA 120
GATTGAAACA CTGCTTAAAT ACTTTCCGCG CAGCCGAGCG AAGACGATGG AGATCTTTAA 180
CAGGATTATG ACAACGTAAA AACTTCACAA ACACACTCTT GCCTGACACT CACACACTGG 240
AGAAATGAGG CTTTCTGTCA AAACAGAGTG CAGAAGACAC CTCTTTAAGG AGAGCCCTGG 300
AAGCCTGGAC ATGTGTTGGT GTGACCGCAG GGATTTCACA CACTCAAACC ACTGAAGATT 360
CTTGGAAAGT CAAAAAAAAA CAAACACACA AATCTGGAGT GGGCGGAGCT AAGCAGGTCC 420
TGTCAATCAT TCAAAACAAG GCCTACAATT GTTTCTACTC ATTCCAGACA CACACACAAT 480
TGCATACATA CGTGCACATA TACATTTTCA CATGTGCATA CACACAAACT CAAGCGCACA 540
TACACACATG CACAGACAAA TACACAATCA CAAACATGCA TGCACACATC CTTAAACACA 600
CACCTTAGAC ATACATGCAC GCACATACAC ACTGTTTCAT ATATATTCTC TCCAACACAC 660
AAACAAACAT ACACAACTAA CACACACACA TGGAATCTAA CACACACACA CAAACATACA 720
AATCTAACAC ACACACAAAA TCTAACACAC ACAGATATTC ATATCTAACA CACAATCAAA 780
GACACACGCA CACACACACA AATACAATTT AGCACACACA AAAACACAAT CAAAGACACA 840
CAAATAAACA CAAACACACA CAAACAAACA CACAAACACT GACACACACA CACTCACACA 900
AAAAAAAACA GACTCTAACA CAAAATAACA ACGACACACA CACGGTCTGA CACACAAATA 960
CAAACACACA CACACACACA AATACAAATA CAAACACATA TACACACACA CGCACAATAC 1020
AATCTAACAC ACACACACAA ACTCAAACAC ACAAATACAA ATACACACAA TCTCACACAC 1080
ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC 1140
ACACACAATC TAACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC TCTAACATAC 1200
TGACACACAC AACCACAAAT ACACACAATC TAACACACAC AAATACAAAC AAACAAACAC 1260
ACACATACAC ACACACACAC ACACACACAC AAATAGCACA GCGTGGTCTG AGTGAAGCTC 1320
CTCATTGGAG CAGTTGAGCA GACAATAGAC AGTGGATTAG TGTGTTATGT GTTGTGTGTG 1380
TGTGTGTCTA CAGGGCAGAG CAGTGGCTCA GTCCTCACCT GACTCATTCA TTAAGAGCAT 1440
TTATTAACAC CTCTCGCTGC TCTTTCACTG CCGTCACAAT CAACAAACAA TAGAGGAGCC 1500
GTTTCCAGCC CTGCCTCACC ACAGGCCGCC ATTGTGCCCA TAAGAGCACA CAGACTTTCC 1560
CATAATTAAC AACACAATTC ATAGGCAAAC GACACCCGTA TCTGTGCTAA TTACTAA 1617