EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-00996 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr10:28315956-28317051 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXF2MA0030.1chr10:28316581-28316595TTTGTTTATCTTTA-6.02
Foxj3MA0851.1chr10:28316578-28316595CACTTTGTTTATCTTTA-6.14
RREB1MA0073.1chr10:28316340-28316360CCACCACACACACACACACA+6.41
RREB1MA0073.1chr10:28316330-28316350CCCCCCACCACCACCACACA+7.85
Enhancer Sequence
TCTGGGAACT ACATATCCTA AGCACTTAAA AATGATGGAG GGAAAAAAAA CATACATAAG 60
AGAGACGCAT ACAAAAGAAG AAGAAAAAAA GCTTGTCCTG AAGGCATGCT CACACGGGGA 120
GCCATCCACA CTCACACTCC CCTGTAATGT CCCTCAGCCA GGCTGAAGGA AGAAATGAAT 180
GATTTCTCAG AACTCTCACA TTTATCACCG GCGGTTCCTG TAAGAACTGG TTTCAGCCAA 240
TTAATGAGGA AGTGAGCCTA TGCCGAGTCA TTACTGGTCG AGAGAGTGTG TAAGGCCGCC 300
TAGGGGTGGG GCTTTGTGAG AGACAGCCCA TATTAGGAAA CCCTTTTATG AGATTTAGCC 360
ACTACCTACA ATACCCCCCC ACCACCACCA CACACACACA CACACACACA CACACACACA 420
CACACACACA CACACACACA CACTCTTTTA CATACACACA CAATCACATG GAAAGGAGAA 480
GAGAAGGAGA TTGCCCTGGT ATGGCAAAAT TGCCCCTCCC AAAACAAAAT CTAAATGATT 540
GATTTTAAAA TATAACCCTG TTTGAAACGC ATATCTTAGT ATTTTCATCA ATAAAATAAG 600
GCTTTAAATC TGAAATAATG AGCACTTTGT TTATCTTTAC ATGACCTGAT GCTTGCTGAC 660
ACACTTGGAC TTTTGTTTTA TCACTTTACA CACTCATGCG GCCCGATAAC ACTCCCTTTG 720
AACTCGACGT TTCACAGACG CAAACAGGAC CCCTCTGCCC ACTCGAGTTT CTGAAAGTGC 780
AACTTCACGG ATAAACAATA GATGAGCTCA TACCGGTTAT TTTGTTAAAT CATTAACCAA 840
ACGCACCATC ATCATCCACC CATGATGTGG GTTAACTAAA CGCAAACACA TCGAGCCTAA 900
AGGAAAAGCA AAATGATCCT GAAAATCCAC CATCAAAACC AACACCCACA CACCCCGTAG 960
GAGAACATAC CAAAATCCAA CCAACTGTAA ACACGCACAG AAGCTAGCAT TAGCCCATCT 1020
GAAGCATAAT CTCTCATCTA AACCTTCATT AGCTTGTGTT TTTTTCAGTC TGTATGAAGT 1080
GAAACTGTCG TGTTA 1095