EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-00761 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr10:8675583-8676581 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr10:8675901-8675913GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr10:8675905-8675917GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr10:8675909-8675921GTTTGTTTGTTT+6.32
MyogMA0500.1chr10:8676136-8676147AACAGCTGCAG+6.02
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr10:8676495-8676510TGACCTTTTAACATC-6.4
RARAMA0729.1chr10:8676492-8676510AATTGACCTTTTAACATC-6.58
Rarg(var.2)MA0860.1chr10:8676021-8676038TGAACTTTTATGAACTT-6.34
SOX4MA0867.2chr10:8676403-8676413GAACAAAGGG+6.02
Tcf12MA0521.1chr10:8676136-8676147AACAGCTGCAG+6.62
Enhancer Sequence
ATATATTTTG AAAAATGACT CACTTCATTT ACTTCCATAG AAAAAAACAA ATACTATAGA 60
AGTCAATGGT TACAGGTTTC CAGTTTTCTT CAAATATTTT ATTCACTGTT TGACAGAAGA 120
AAAAAATTCA AACTGTTTTT GAAGAGTTGC ATAGATAGTG GGGGAACTAT CATCATAAAA 180
CATTGGAGGA AAGGTAAAAG AATCAAGGGC CTTTTATTTA TATATAGACA CGTGTGTTTT 240
CAATATGTGA GTGTGCAGTT GCTAGTGTGT GTTTGAGTGT GTGTGGGTGG GCTACTGACC 300
ACCATTGTGT TTATTTTGGT TTGTTTGTTT GTTTGTTTTT TGTCAGGGTT GAAAAGTGGA 360
AAACGAAGAC AGGAAATATG TATTTTTAGA TGCCCAGTGA ATAAACCTTT TCCTGTGAGT 420
TTGTATTTAA TTAATAAATG AACTTTTATG AACTTGAAAT GTTAACGCGT GTCTATATGG 480
AGGTTGGTGT GTTTCTCTGG CGTATGAAGT CAGTGTGTGT TTCTGGTGTC TGCTGCAAAC 540
ATGTTTCTTA GCTAACAGCT GCAGTATGTG GGCACAGATC AAATGTTGGT CTCAGTATTG 600
GCCGCAGGTG TCAAATTATA CCTTAGGTTT TCAAAGAAAA CCTGGACAAT GTTTCTAGGG 660
ACGTTTTCAA AGATGTTGTA AAGATTTAGA ACAGTAATTT AATCTTCCGG ATAAATGTGA 720
ATTTCATGGT GTGAAGTTGC ATGTGTTAAA CGAGCTGCTT CCTGTGCTTT AAAGTGAAAC 780
GTTTATATGG TGGTAGAGGG AAACCTGACA GTGTAGCGTC GAACAAAGGG GACATGAAAT 840
AAAACATCAA AACTGTTTTG CAACTCACTC CATTTGAGAA AGTTAATCCT GTACAGCTTT 900
TCATTCCTAA ATTGACCTTT TAACATCCAT GGAACCTTTC CATTGTACTA GAGGTTTAGT 960
AAATAGGGAA TTTTAGTTGT AATTCAGCTG AAGGCCCA 998