EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-00751 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr10:7392129-7393560 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DMRTA2MA1478.1chr10:7392212-7392224AATGTAACAAAT-6.44
Foxd3MA0041.1chr10:7392314-7392326AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr10:7392859-7392871AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr10:7392997-7393009AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr10:7393060-7393072AAACAAACAAAC-6.32
Foxj3MA0851.1chr10:7392816-7392833AAATGATAAACAAACAA+6.01
Foxj3MA0851.1chr10:7392954-7392971AAATGATAAACAAACAA+6.01
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr10:7393528-7393543GGGTTCAAAAGGTCA+6.7
RARAMA0729.1chr10:7393528-7393546GGGTTCAAAAGGTCAGGT+6.76
RarbMA0857.1chr10:7393527-7393543AGGGTTCAAAAGGTCA+6.94
RargMA0859.1chr10:7393528-7393544GGGTTCAAAAGGTCAG+7.56
ZNF24MA1124.1chr10:7392839-7392852GGATGAATGAACG-6.07
ZNF24MA1124.1chr10:7392843-7392856GAATGAACGAATG-6.41
Enhancer Sequence
CCGATAAACA ATCAAAGGAA TAAATGAGCA AAAGCACAAA TAAACGAACA AACAAACAAA 60
TGAACGAATG AACAATCAAC AAAAATGTAA CAAATAAACA AACTAAACTA CTTTCATTTG 120
TAATTACACA AAACAAACAC AAATTAAACA AACACACACA CACGCATGCA CGCGCGCACA 180
CACACAAACA AACAAACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA 240
CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA 300
TATATATAGT TGAAGTCAGA ATTATTAGCC CCTCCTGAAT TATTAGACCG CTTGTTATTT 360
TTCCCCAATT TCTGTTCAAC AGAGAGCAGA TTTTTTCAAC ACATTTCTAA ACATAATTCT 420
AAATTTCTAA AATAATTTTG TCCCTAAAGT GGTGTTTAAA AAATTAAAAA CTGCTTTTAT 480
TCTAGCTGAA ATAAAACAAA TAAGACTTTT CCTAGAAGAA AAAATATTAC CAGACAAACT 540
GTGAAAATGT CCTTGCTCTG TCAAACATTA TTTAGAAAAT ATTTTAAAAA GAAGAAAAAA 600
AAATGAAGGG GGGAATTAAC AAACGAACAA ACAAACGAAT AAACGAACGA ACAAATGAAC 660
AAACGAATGA ACAAAGTAAA ACAAACAAAA TGATAAACAA ACAAGCAAGG GGATGAATGA 720
ACGAATGAAC AAACAAACAA ACAAATGAAT GAAAAAACAA ACAAAGAAAC GAACAAACGA 780
ACGAACAAAT GAGCAAACGG ATGATCAAAT GAACAAAGTA AAACAAAATG ATAAACAAAC 840
AAGCAAGGGG ATGAATGAAC AAATGAACAA ACAAACAAAC AAATAAATGA AAGAAAGAAC 900
AAACAAAGAA ACGAACAAAC AAAAAATTAA CAAACAAACA AACTGAACTA CTTTCAATAG 960
AAATTACACA AAACTAACAC AAATTCACCT GTTGGAACAG AAGAGTCTCC AAATCTATTA 1020
CGTTAACCCA GACAGTGGCC ATCTGTTGAC CAGATTAGTC AGATTCCGAC TCATCCTTGA 1080
CATCAGCACA GTCTGACTAA GTTTTGAAAT GATCTTTAAA TGATGACATT CGCACTCTTT 1140
TATCCACATA AGCATGTGCA TTGCCTTCCA CCATTATTAT CTCAGTCCTC CAATACTGAC 1200
ATGGACTGAT GAGTTGTTCC CATTATCAGA TGAGCTGGAA TTAGTGACCA CACAGCACGC 1260
GGCATTAAGC AGAAGCCCCT GCAGGGGTAA ATGAAGCAGA TACTGAGGGC TTTAAGTCCC 1320
CCCAGGCCTG TTAAGCTGTC CCGGGTCTCA TTGCCATTAG GCCGGGAATC AAATGGACAC 1380
GAGGGTGTGT GAATGCAGAG GGTTCAAAAG GTCAGGTCAA CAGCCATGAC C 1431