EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-00741 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr10:5983893-5985574 
TF binding sites/motifs
Number: 47             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr10:5984347-5984364ATTAATTAATTAATGGA-6.01
Alx1MA0854.1chr10:5984395-5984412ATTAATTAATTAATACA-6.32
Alx1MA0854.1chr10:5984332-5984349TGAATTAATTAATTAAT+7.27
Alx1MA0854.1chr10:5984388-5984405TGAATTAATTAATTAAT+7.27
ArxMA0874.1chr10:5984331-5984348ATGAATTAATTAATTAA+6.04
ArxMA0874.1chr10:5984387-5984404ATGAATTAATTAATTAA+6.04
ArxMA0874.1chr10:5984395-5984412ATTAATTAATTAATACA+6.4
ArxMA0874.1chr10:5984332-5984349TGAATTAATTAATTAAT-6.7
ArxMA0874.1chr10:5984388-5984405TGAATTAATTAATTAAT-6.7
ArxMA0874.1chr10:5984348-5984365TTAATTAATTAATGGAT-6.95
ArxMA0874.1chr10:5984347-5984364ATTAATTAATTAATGGA+7.17
EWSR1-FLI1MA0149.1chr10:5985432-5985450GGATGGAAGGATGGATGG+6.57
EWSR1-FLI1MA0149.1chr10:5985436-5985454GGAAGGATGGATGGATGG+6.59
Lhx3MA0135.1chr10:5984397-5984410TAATTAATTAATA+6.25
Lhx3MA0135.1chr10:5984333-5984346GAATTAATTAATT+6.29
Lhx3MA0135.1chr10:5984389-5984402GAATTAATTAATT+6.29
Lhx3MA0135.1chr10:5984349-5984362TAATTAATTAATG+6.46
Lhx3MA0135.1chr10:5984337-5984350TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr10:5984341-5984354TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr10:5984345-5984358TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr10:5984393-5984406TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr10:5984334-5984347AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr10:5984338-5984351AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr10:5984342-5984355AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr10:5984346-5984359AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr10:5984390-5984403AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr10:5984394-5984407AATTAATTAATTA-6.78
POU6F1MA0628.1chr10:5984335-5984345ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr10:5984339-5984349ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr10:5984343-5984353ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr10:5984347-5984357ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr10:5984351-5984361ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr10:5984391-5984401ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr10:5984395-5984405ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr10:5984399-5984409ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr10:5984335-5984345ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr10:5984339-5984349ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr10:5984343-5984353ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr10:5984347-5984357ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr10:5984351-5984361ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr10:5984391-5984401ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr10:5984395-5984405ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr10:5984399-5984409ATTAATTAAT-6.02
ZNF24MA1124.1chr10:5984321-5984334AGATGAATGAATG-6.25
ZNF24MA1124.1chr10:5984381-5984394AAATGAATGAATT-6.32
ZNF24MA1124.1chr10:5984377-5984390GAATAAATGAATG-6.5
ZNF24MA1124.1chr10:5984325-5984338GAATGAATGAATT-7.22
Enhancer Sequence
GTAATGGACG CAGGGTCTGA AGGGGTTAAT TCAAATATTA AAGTACCACT GATTGTATAT 60
GTATGTTTAA ATACAGTATC AGCTTGCAAA TTAAGTGATT ATTAAAATTT GTTGTGCTAT 120
TTAAAGGCTT TAGGTTTGCT TTGCTTGTTT ATAGGGCAAT TGGTTTTATC ATTAATGCGT 180
GTAATTGATA ATTTTGTTGG ATAAATGGAT GGATGTAGAG AGAGATGGAT GGATGGATGG 240
ATGGATGGAT GGATGGATGG ATGGACTGCA TATATTTGAG AATTTTGTCA TGGATGGATG 300
GATGGATGGA TGGATGGATG GATGGATATA CAGTGCATAT AAAGAATTTG GTTATAGATG 360
GATGGATGGA TGGATGGATG GATGGATGGA TGGATGGATG GACTGCATAT ATTTGAGAAT 420
TTAGTTTTAG ATGAATGAAT GAATTAATTA ATTAATTAAT TAATTAATGG ATACACGAAT 480
TAATGAATAA ATGAATGAAT TAATTAATTA ATTAATACAC ACTGCATATA TTTGAGAATT 540
TTGTTTCAGA TTGATGGATG GATGGATGGA TGGATGGATG GATGGATAGA GATAGATAGA 600
GATAGATAGA TAGATAGATA GATAGATAGA TAGATAGATA GATAGATAGA TAGATAGATA 660
GATAGATAGA TAGATAGATA GATAGATAGA TAGATAGATA GATAGATAGA TAGATAGATA 720
GATAGATGGA TACACACTGC ATATATTTGA GAATTTTATT ATGGATAGAT GGACGGAGAC 780
ACACTGCATA TTAGGCATGG GCGGGTATAA GATTCTGACG GTATGGTAAC CTTGGATAAA 840
AATATCCCGG TGTCACGGTA TGATTACCGC TCTAAAATGT GCTTTTTGAT TGTCTGAGTA 900
AAAAAAAACA ACCTTTTCCC CCATTGAACA CAATACATTT CGCTTTAAAA ACATTTTCAA 960
TATTTTGGAA CGGTAAACGT CAGTGTAAAT AATTAAAATC TTCATTAATT TCAAAAACAC 1020
AGATTTGATT ATAACTTGAA AAGGCATCTT TGGATATCTA TCTTTTCTTT GGATATTAAA 1080
GTATTTCTCT GCACTGTTCA GCTCTAAAGC ATGCTTGGAT GTTGGTGTAT AAGCGATTTG 1140
TTTCTCAAAT ATACCCTAAA TCGTGGGCTG ACCAGATTTT GATGTGGAGG GTCGGTTTCT 1200
TTTGGACATA CTGCTGCCCT AAAAAACTAA ATTAAATAGT CATAAAAAAA GCATGTTAAA 1260
AATACGTTAG GAACAGTATA AAAGAAAATT TGAGTGGTTT TAAAACATTG ATTTTTCCAA 1320
ACTGTGCTAA ACGTCCTGTG CCTACTGCAT ATGTTTGAGA ATTTTGTTAG ATGGATGGAT 1380
GGATGGATGG ATGGATGGAT GGATGGACGG ACGGATGGAT GGACGGACGG ATGGATGGAC 1440
AGACAGATGG ATGGATGGAC AGATACACTG CATTGAGAAA TTTGTTATAG AAAAATAGAT 1500
GGATAGATAT ACACTGCATA TATTTGAGAA TTTTGTGATG GATGGAAGGA TGGATGGATG 1560
GATGGACTGA TACACACTGC ATATATTTGA GGTTTTTGTT GGATATATAG ATGGATAATT 1620
AGAGGGATTG ATGAATATAT TTGTGATGGA TGGATGGATG GATGGATGGA TACACTGCAT 1680
A 1681