EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-00740 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr10:5865912-5868058 
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ESX1MA0644.1chr10:5867669-5867679ACCAATTAAC+6.02
HNF1AMA0046.2chr10:5867291-5867306AACTAATTATTAACT+6.17
HNF1AMA0046.2chr10:5866936-5866951AGCTAATTATTAACT+6.18
HNF1AMA0046.2chr10:5866936-5866951AGCTAATTATTAACT-6.4
HNF1BMA0153.2chr10:5866937-5866950GCTAATTATTAAC+6.02
Hmx2MA0897.1chr10:5867666-5867683ACAACCAATTAACCAAT+7.19
Hmx3MA0898.1chr10:5867666-5867683ACAACCAATTAACCAAT+6.73
NFYBMA0502.1chr10:5867709-5867724CAACTAACCAATCAG+6.51
RREB1MA0073.1chr10:5866582-5866602CCACCAATCAACCAATCACC+6.06
RREB1MA0073.1chr10:5867410-5867430ACCCAACCAACCAACCACCA+6.08
RREB1MA0073.1chr10:5867479-5867499ACCCAACCAACCAACCACCA+6.08
RREB1MA0073.1chr10:5867409-5867429AACCCAACCAACCAACCACC+6.21
RREB1MA0073.1chr10:5867478-5867498AACCCAACCAACCAACCACC+6.21
RREB1MA0073.1chr10:5867363-5867383CCACCAATCACCAACTAACA+6.47
RREB1MA0073.1chr10:5866344-5866364CAACCAACCACCAACCAACA+6.63
Enhancer Sequence
GTGAATTATG AACACATTCT TTTAAATTCA CCCCTGTTCT CTTCATTTGC GCAGAAAAGG 60
GGGATGTATT TCTCTTGCTC TGAGTGGCTT TCTGCCAAGG GCCCTGTGTC CACTGGAGCA 120
CTGCGGGCCG CTGTTTGTCT GTGGGCTGCC TCTTTTGTTC CTTGGAATTC GAAATGGGAA 180
CGTCAGTAGT GTGGGAGACG TCTGGTTTCA CCCAGATGCC AGACAGAGCA GGGTGGGTGG 240
ATTTTAGGGG GATGGGAGAA GCACAGACCC TACAGTGGGT GTACAGTACA ATATGCATTT 300
GTGCTCATTC AGATAGACTG TAATGGTGAT ATGTGATTAT GTGTAATGCA TCATACTCCA 360
TTACACTTGA TATTTAGTCC TAGGGCTGAC AAATTTACTA TGATATTCTG CAAGAGTTCA 420
CTTTCTTCAA TCCAACCAAC CACCAACCAA CAAATCAACC TTCAATCCAA CCATCAACCA 480
ACAATCCATC TATCAACCAA CAATCCAACC AACCAACCAA CCAACCAATA ATCCAACCAT 540
CAACCAACAA TCCAGCCATC AACCAACCAA CCAACAATTC ATCCAACCAA CCATCCCACC 600
AACCAACAAT CCAACCGTCA AACAACTAAC AAACAGTCCA ACCAACAATC CAACCAACCA 660
ACCATTCCCG CCACCAATCA ACCAATCACC AACTAACAAT CCAACTAACT AACAACTATA 720
CCAACCAACA ATCAAACTTA CCAATCACCA ACAATCCAGC CAACCATCTA CCAATCAACC 780
AATTACCAAC TAACAATCCA ACTAATTATA AACTAACTAT CCAACAATCC AATTAACCAA 840
TCGCAAACTA ACAATCCAAC TAACCAATCA CCAACCAGCA ATCTAACAAT TCAACCAACC 900
ATCCACCAAT CAACTAATCA CTAACAGTCC AACTAACCAA TCTCCAACTA TCCAACCAAC 960
CAAACAATAA TCTAACACTC TAAACAACCA ACCAACAATT CACCAATCAA TTAACTTAAA 1020
ATCCAGCTAA TTATTAACTA ACCATCCAAC AATCCAACTA ACCAATCCCT AACCAGCTAT 1080
CTAAGTATTC AACCAACCAA CCAATCACTA ATCATCCAAT CACCAACTAA CAATCCAACT 1140
AACCAATCAC CAACCAACAA TCGAACTATC CAACCAACCA ATCAATCAAC CAACCAACAA 1200
TTATCCAATC ACCAGCTAAC CAATCACCAA ACAACAATTG AACTATCCAA CCAACCAACC 1260
AACCAACAAT TATCCAATCA CCAGCTAACC AATCACCAAA CAACAATCCA ACCAACCAAC 1320
AATCTAACAC TCCAACCAAC CAAACATCTA ACCAACCATC CACCAATCAA CCAATTACCA 1380
ACTAATTATT AACTAACAAT CCAACTAACC AATCACCAAA CAACAATTTA ATTATCCAAC 1440
CAATCAACCA ACCACCAATC ACCAACTAAC AATCCAACTA ACCAATCACC AACCAACAAC 1500
CCAACCAACC AACCACCAAT CAACCAATCA CTAACTAACA ATCCAACTAA CCAATCACCA 1560
ACCAACAACC CAACCAACCA ACCACCAATC AACCAATCAC TAACTAACAA TCCAACAAAC 1620
CAACCAACCA ACAATCCAGC CAATCATCCA CCAATCAACC AATTACCAAG TAGTAATCCA 1680
ACGAATTATT AACTAACCAT CTAACAATCT AACCAACCAA TCACAAAACA ACAATCTAAC 1740
TATCCAACCA ACCAACAACC AATTAACCAA TCGCTAACTA ACAATCCAAC TAACCATCAA 1800
CTAACCAATC AGCAATCCAA CTAGCCAATC AACACACATT TGAATCTGTA TCAAGGTTTT 1860
GTTTTTCTGC TTGCAAACTC TTTTTGTGTT TGACCCATGT GTAGATTTTA ACATGGTACG 1920
TCAAAAATAA AGTAAATTGT TCAACTATAA AATGTCCTTG GGTCTCTCAG GTGCAGAACA 1980
GAACATTAGA GCAGATCAAG GAAAGAACGG TCCAGTGTTT TGCATCTGAC TAGGGTTGTT 2040
TTTCCACAAA TGACTTGGAT ATTCCCTCTC AGCATTTTTT AGAGATGTCC GTGCCAGCAC 2100
CACTGGGGCA ATGTTGGACG ATCATCACAG AGAATCTCTG AAAGCG 2146