EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-00706 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr10:1348063-1350133 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXC2MA0846.1chr10:1348971-1348983TAAATAAACAAA+6.18
RORBMA1150.1chr10:1350009-1350020AATTAGGTCAT+6.32
RREB1MA0073.1chr10:1349441-1349461ACCCCCAACAACCACAAAGA+6.41
Enhancer Sequence
GGAAAACATT GGATATTGTT GTTGACTGTT GCGATAATAA CGCCATTTTA TTAGCAATAT 60
ATTTATTTAT GTTATGATCA TACTAAAATT AGCATGGCAA TATTCAGAAA ATCACAATCA 120
ACTTACTGGC AACCACAAAG AATACCCTAG CAACTACATA GCAATGGCCT GGCAACAACA 180
AAGTTTTCCC TAGCAACCAA CCAGGACCTC CTAGTGACCA CATAGTAATG TCCAGGCAAC 240
CACAACAAAC ACTCTAGTAA CCACCTGGCA CCTGGCAAAT AGATCTCCCT AACAATCACA 300
TAGCAATGTC CAGGAAACCA CAAAGAACAC ACTAGCAACT AACTGGCAAC CACAAAGAAT 360
ACCCGAGCAG CTACATTGCA ATGTCCTGGC AACCACAAAG ATCACCCTTG TAACCGCTTA 420
GCAATGTAAA GAAAACTACA AACCCCCTAG CAACTACATA GAACACCCTA ACAACCACAT 480
AGCATTGTCC TAAAATCTAC AAAGAAAACC CTAGCAACCA CATAGAACAC CCTAACAACC 540
ACATAGAACA CCCTAACAAC CACAGAGCAA TGTGCAGAAA ACTACTACGA AGAGCCTAGC 600
TACCATAAAA CACCCTAACA ACCACATAGC AATGTCCAGA AAACTACAAC CACCCTAGCA 660
ACTACATAGA ACACCCTAAC AATCACATAG AACACCCTAA CAACCACATA GCATTGTCCA 720
GAAATCTACA AAGAACACCC TAGTAACCAC ATAGAACACC CTAACAATCA CATAGAAAAC 780
CCTAACAAAA ACAACATAGA ACACACTTAC AACCACAAAA ACCCTGGCAA CCACATGTAA 840
CACCCCAGCA AACACATAAC ACCCTAACAA CCACATATAA CACCCTAACA ACCACAAAGC 900
ATTGTGCATA AATAAACAAA GAACACCCTA ACAACCACAA AGAATACCCT AGCAACCACA 960
TAGAACACCC TAACAACCAC ATAGCATTGT CCAGAAATCT ACAAAGAGCA CCCTAGCAAC 1020
CACATAGAAC ACCCTAACAA TCACACAGAA CACCCTAACA ACAACAACAA CAACATAGAA 1080
CACCCTAACA ACCACAAACA CCCTAGCAAC CACATAGAAC ACCCTAATAA CCACATGGCA 1140
TTGTCCAGAA ATCTACAAAG AACACCCCAG AAACCACATA GAACACCCTA ACAACAACAA 1200
CAACAACAAC AACAACAACA ACAACAACAT AGAACACACT TACAACCACA AACACCCTAG 1260
CAACCACATG TAACAACCTA GCAACCACAA AGAACACCCT AACAACCTCA TAGAACACCT 1320
TAACAACCAC ATAGCAATGT GCAGAAAACT ACAAAGAACA GCATAGCAAC CACATAGAAC 1380
CCCCAACAAC CACAAAGAAC ACATTTGCAA CCCCATAGAA CACCCTAGCA ACCATAAAGA 1440
ACACTCTAGC AACCACATAA AAAACCCTAA CAACCACATA GAACACCCTA ACAATAACAA 1500
AGAGCACCTT AACAACCACA GAGAACACCC TAACAACCAC AGAACACCCT AACAATCACA 1560
CAGACTACCC TAACAACCAC ATAGAACACC CTAACAACCA CAGAACACCC TAACAACCAC 1620
AGAACACCCT AACAATCACA TAGAACACCC TAACACCAAC ATAGCAATGT CCAGAAAACT 1680
ACAAAGAACA TCCTAGTAAC TAACTAGCAA TCCCATATAA CACCCTAGCA ACCACCTGGC 1740
AACCACATAA AACACCCTAG CAACCANNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 1800
NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 1860
NNNNNNATTC TATAGCAGCA TCATTAATAT ATCAATATTT ATTGACGTAA TGGCATTTTA 1920
ATGACAAATT CAATTCGTTA CGGACAAATT AGGTCATGAG TGGAAATAAC TATAATTATA 1980
GCAAGAAAAA TGCTTGTTTG TTAGATGAAC AGTCCTTATA TACACTACAT TTTTAAATTT 2040
ATTTTTTTGC TGCTTGTTTA AACTACTTAT 2070