EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-00694 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr10:1024552-1025896 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DUX4MA0468.1chr10:1024751-1024762TAATCCAATCA+6.02
Foxd3MA0041.1chr10:1025599-1025611GTTTGTTTGTTT+6.32
HOXD13MA0909.2chr10:1024908-1024919GTTTTATTGCG-6.32
HOXD9MA0913.2chr10:1024908-1024918GTTTTATTGC-6.02
IKZF1MA1508.1chr10:1024619-1024631AAAACAGGAAGA+6.07
IKZF1MA1508.1chr10:1024659-1024671AAAACAGGAAGA+6.07
IKZF1MA1508.1chr10:1024699-1024711AAAACAGGAAGA+6.07
IRF1MA0050.2chr10:1024574-1024595GGAATGAAACAGAAAGAGGAA-6.02
NFAT5MA0606.1chr10:1025095-1025105AATGGAAAAT-6.02
NFATC1MA0624.1chr10:1025095-1025105AATGGAAAAT-6.02
NFATC3MA0625.1chr10:1025095-1025105AATGGAAAAT-6.02
RREB1MA0073.1chr10:1025646-1025666TGTGTGTGTTTGTTTTGTGT-6.41
Enhancer Sequence
GTAAAGAACA GGAAGAGGAA AAGGAATGAA ACAGAAAGAG GAAGAGAACG GGAAAAAGAA 60
AAGGAAGAAA ACAGGAAGAG GAAGAGAACG GGAAAAAGAA AAGGAAGAAA ACAGGAAGAG 120
GAAGAGAACG GGAAAAAGAA AAGGAAGAAA ACAGGAAGAG GAAGAGAACG GGAAAGGGAA 180
GTCCTCTGCA GTCCTCTACT AATCCAATCA GTTTCCCAGG AAACGCCACT TCTGCTGTCC 240
AAATATCCTC CGAGAGCGAC GTCACCATCA AAACAAACAT GTGGAGGATC CTCTATAGGA 300
GGACATGATG AAGATGCCTT TATTTATACG CTCATATCTG TCTGATTGTT TTCCTTGTTT 360
TATTGCGCCA TCCAGTGGAC AAGCCCTGCA ACTACACGTC CAGCCTCTTA TGTGTGTGTG 420
TGTGTGTGTG TGTGTGTGTA TATATGAGCG AACACATTTT AACTGTTTAA CAGTGTTATT 480
CTTACTCTGA GATTATGTTT TCTTTACTAT TAATTTCATT TTGTTGACTA GTGATCTGTA 540
TCTAATGGAA AATGTAGAAG AAAAGACAAA CAAAAGACTA AACGGGGGAG CAGATTGGTG 600
CTGTGGGACT GAACTCTGGA GTTTTCCGGC AGGGTGTGAA TAAAAAGCTG ATCGGACTTT 660
AGTGATGGTG CATGCGGAGC TGCTGCGGTC ACACACGTAC AAAGGTCAGC TGGACTAATA 720
GCCATTCCTG AGTGAGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TTTCACTCCA 780
CCTTCAGTTT CTCTTGTACG AGTTGAGCAG ATTTCTAAAG CTGTCTATGC AAATTCTGCA 840
TCCTTTATAC AACCAATTAT ACATGCTTAA AAAACAGAAC AGAAAACAGA AGCCGCTAGC 900
AGTCGCTATC CATAGCTGTC ATAGCATTAT TATANNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 960
NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 1020
NNNNNNNNNN NNNNGTGGTT TGTGTGTGTT TGTTTGTTTG CATGTGTTTG TGTGTGTGTT 1080
TGTTTGCTTG CAGTTGTGTG TGTTTGTTTT GTGTGTATGT TTGTATGTAT ATGTGTGTTT 1140
GTGTGCGTGT GTGTGTGTGT CTGTATGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 1200
GCGCGCGTGT TTGTGCGCGT GTGTGCATAT ACTTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTTCAGCA 1260
CTAGTCTCTT CTGTCAGCTG GGTTTGAGCT CTGTGAATGA GCCACACTTA AGCAAACACG 1320
TGTGAAAGCC CCAGTGCATT GTGG 1344