EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-00682 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr10:424011-425140 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CEBPAMA0102.3chr10:425089-425100ATTGCATAATA+6.02
Foxq1MA0040.1chr10:424069-424080TATTGTTTATA+6.32
HNF1AMA0046.2chr10:425109-425124AGTTAATTATTAATT+6.08
HNF1AMA0046.2chr10:425109-425124AGTTAATTATTAATT-7.99
HNF1BMA0153.2chr10:425110-425123GTTAATTATTAAT+6.92
RREB1MA0073.1chr10:424718-424738CCCCCACACACACACACACG+6.61
Enhancer Sequence
GAACGGCATA AACCCCTTAT TATAACGAGT AAACTGCAGC ACATATATGG ATACATTATA 60
TTGTTTATAC TGCATATGTT ATATCGTTAT GTTAAACAAA TCCCACACTC AGTTGAATCT 120
GATCTCTGCT GTCAGTCTGT GTGTGATTTG TCAGTGCGCT GGCGCCCTCT GGCGGATCAG 180
TCTGCACATG CGCACATTAC GGAGTGACGC GTTGCGCGCT CCCGCTCCTC CATCTGCGCG 240
CTCCTGCTGT GCTGACAGCA AAACACGCGT TTTACACTCG GTGTGTCCTC ACGACCGTCT 300
GATTTCACTT CAGGAGGAGT GTGTGTTCAT CTAGAAGTGT TACTGTACTG TCTGAACACT 360
CGCTTCAGTG CTGTTGATAG ACTCGCGGGA GTGACGGAGC TGGACTCTTC TTCTTCCTCA 420
GGACTGATCG GTCGATTAGA CGAGCTTCAG TGATCGATAA CAGACTCAGG TGAGACGCTC 480
TTCTCCTTTA TTAAACTGTT CTGAGATCTG TTCAGCTGAA GGATCAGTGT TCAGGCCTGT 540
TTGAGTTATT ATTCATGTGT ATTTCATAAC TTTCAGGAGA GTCCAGAAAC TCCCCGATTA 600
ATAATAGATG TGAGTCATGC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC 660
ACACACACAC ACACACACAC ACACACACCC ACACACACAC ACACACACCC CCACACACAC 720
ACACACGTGC ATAGAAACTT CTCACAGATG TTATGTTTTT ATACTTATAT ACTTATTTAT 780
ATACTTTACA TGCTGTATTT TCGATTCCCC TACCATTTAG TCCCCACGAC GTAAGGAATA 840
CAGGGTATAC ACACACACAT AATGTTGGTA TTGGTGGTTT TTGAGGACTC ACATAGGCTA 900
ATATATTTTA TACAGTAAAA ACTGCTTATT GTATGTCCTC ATATGTTGTA ATATATAGGT 960
CATGACCATG TCATTACACA GACCTATGTC CTTGTAAACC ACCAAAACTA GTACACACAC 1020
ACACACACAC ACACACACAC ACACACATGT TTAAACCCTT TATAAAAGTG TTTTTTTTAT 1080
TGCATAATAA TAATATGAAG TTAATTATTA ATTATTCTAA TTATTAGTA 1129