EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-00666 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr1:58500699-58501743 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF4GMA0484.1chr1:58501455-58501470TGAGGTCAAAGTTCA+7.03
Hnf4aMA0114.3chr1:58501456-58501472GAGGTCAAAGTTCAGC+7.21
MEF2CMA0497.1chr1:58501264-58501279ATCTATTTTTATAAT-6.28
MEF2CMA0497.1chr1:58501321-58501336ATCTATTTTTATAAT-6.28
MEF2CMA0497.1chr1:58501366-58501381ATCTATTTTTATAAT-6.28
NR2C2MA0504.1chr1:58501455-58501470TGAGGTCAAAGTTCA+6.42
Nr2f6MA0677.1chr1:58501456-58501470GAGGTCAAAGTTCA+6.83
PROX1MA0794.1chr1:58501669-58501681CAAGACGTCTTG+6.32
PROX1MA0794.1chr1:58501669-58501681CAAGACGTCTTG-6.32
RXRBMA0855.1chr1:58501456-58501470GAGGTCAAAGTTCA+7.22
RXRGMA0856.1chr1:58501456-58501470GAGGTCAAAGTTCA+7.42
RxraMA0512.2chr1:58501456-58501470GAGGTCAAAGTTCA+7.38
Enhancer Sequence
AATCTTTTGT CATTTGATTC AAAGATTCAG TGAATCAATC TTAAAGGCAT CACTGGCTTA 60
ATTTGAAATC ATCTGTTCTG AATGATTCGT TTGAGTGAGT GATTCAGTAA ATCAGTGATT 120
CAGTGGTTCA GTAATTCAGT CATTCAGTGA TTCAGTCGTT CAATGATTCA GTGATTCAGT 180
AATTCAGTAA TTCAGTCGTT CAGTGATTCA GTGATTCAGT AATTCAGTAA TTCAGTCATT 240
CAGTGATTCA GTCGTTCAGT GATTCAGTGG TTCAGTAATT CAGTCATTCA GTGATTCAGT 300
CGTTTAGTGA TTCAATGATT CAGTGATTCA GTGATTCAGT GGTTCAGTGA TTCAGTGGTT 360
CAGTGGTTCA GTGATGCTCC TGCTGGTGTT TTGCTCTGCT CTCCGTCAGG ATCTGTCTGG 420
CTGAGATGTA CCAGGATAAA GAGCTGATCT CCAGATTCAG CAGCCGCACT GGAGACTACA 480
ACGATCTCCA GGTGAGAGTC ACAGACCGCT TAGCCAATCA GCTCTGTGTG TGTGTGTGTG 540
TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTTCATCTA TTTTTATAAT ATTTGTGTGT GTCTGTGTGT 600
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT TCATCTATTT TTATAATATT TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG 660
TGTGTTCATC TATTTTTATA ATATTTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGCTGCAGG 720
TGTGTGCTTT GGAGTATAAG GAGTTTGTCA GCGCTCTGAG GTCAAAGTTC AGCTCCAGTT 780
ACGGCCCCAG TGATGTCATC ATCCCAGACA CCCGACAGCA GCTCTTCGAC AGGTGCACAC 840
AGGGGGCCGC GGGGGTCTTC AGACGTGTGG AGGAGTCTTG AGGAGCCGCT GATTTAACTC 900
TGATTCCTCT GTGTGTGTCT GCTGTAGGTT TAAGGTGTAC GCTGTAGGAG ACGATTCACT 960
CCAGCGCACT CAAGACGTCT TGAAGAAGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTA 1020
TGATTTCTTG TGCGCTTTTT AAAA 1044