EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-00639 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr1:56596340-56598193 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr1:56598128-56598147TCACCAGCAGAGGACAGCA+6.07
CTCFMA0139.1chr1:56596731-56596750TGGCCACTAGGTGTTGCTG+6.17
NR2F1MA0017.2chr1:56596574-56596587CAGAGGTCAAGAG+7.04
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:56596576-56596591GAGGTCAAGAGGTCA+8.55
PBX2MA1113.1chr1:56597704-56597716CTGATTGACAGT+6.04
RARAMA0729.1chr1:56596576-56596594GAGGTCAAGAGGTCAGAG+6.31
RarbMA0857.1chr1:56596575-56596591AGAGGTCAAGAGGTCA+8.14
RargMA0859.1chr1:56596576-56596592GAGGTCAAGAGGTCAG+7.58
Enhancer Sequence
TGAATAATTG CTGGACTCCT GTGATTTAGT CCAGAACATG AGCGGGAGTG AGGAACAGCT 60
CAGTGTGTGT CGGTGCCGTG TGTTCCCGCG CGAGAACACA CTCATTACAG CTGGAACTGA 120
CTGAGCCAAC TGAGCAGAAT GAGTGCGGTG AAACACCGTG TTCCTCACGC TTTACTGTGC 180
TCCTGCAGCT GCAGTTCCAG CGTGGGCCTG TGGAGGCGCT GCAGAGTCTA TATGCAGAGG 240
TCAAGAGGTC AGAGGAGCAG CGCTGGGATC TGTCCATACA CACACTCACA CAGGTACAAC 300
AACAACAGCT GGAGAGACTG GATATACTTA ATATTAGAGA ACTGAGTGTG TGTGTGCATG 360
GGTGCGTGCA TGTGTGTGTT TGTGTGTGTG TTGGCCACTA GGTGTTGCTG TGTGTTCCTG 420
AGTCAGACGA GAGCAGAGAA ACTAACCTGA GTCGGCTGAA CTCACTGATC CTGGAGCTGC 480
AGCGACCAGC GGCAATACAC ACCACAGCTG TGACATCACA CACCATCAGG TCATACACAC 540
ACACACACTC TCAAACACAC ACACACACTC AAACACACAC ACACACTACA GCTGTGACAT 600
CACACACCGT CAGGTCATAC AAACACATGC ACACACACAC ACTACAGCTG TGACATCACA 660
CACCGTCAGG TCATACACAC ACACACACAC ACACACACAC GCACACACTC TTAAACACAC 720
ACACACACTC AAACACACAC ACACACACAC TACGGCTGTG ACATCACACA CCGTCAGGTC 780
ATACACACAC ATAAACACAC ACACACACAC TACAGCTGTG ACATCACACA CCGTCAGGTC 840
ATACACACAC ACAAACACAC ACAAACACAC TACAGCTGTG ACATCACACA CCGTCAGGTC 900
ATACACACAC ACAAACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC TATAGCTGTG 960
ACATCACACA CCGTCAGGTC ATACACACAC ACACACACAT ACACACTACA GCTGTGACAT 1020
CACACACCAT CAAGTCACAC ACATACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACTCTGTC 1080
AGGTCACACA CACTGTAGAC ACACGCTACA CCTAACAGCT CAAAACATCA TGGGTGCATT 1140
GTACATCCAC TCAGAACACC CTAGCAGCCG ATCATAACAC ACACACACAC ACAACGGGAA 1200
TAAATATTTC AGGCACTGTT TCAGTGCTGC CAACAATAAC AGACTCAATC AAATGATGAT 1260
AACATGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG 1320
TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TTTAGTCTTC AGTTATGGAG GGAGCTGATT GACAGTTTGG 1380
TCTGTGAGTC TGTCAGACTG AGACACATAC TTGGGCTTCA GGAGCACAAC GCTTGGAGCG 1440
ACACAAGAGA AGAACAACAC ACCTGTGAGT ACACACATAC ACACACACAC GACACCTGGA 1500
GTGACACTAC ACGAGAACAA CACACCTGGG AGTACACACA CACACACACA CACACACACA 1560
CATACAATCA CATACACTAT TATATATATA CACACACACA CAGTTATGGA GCCTTATCGT 1620
GATGTTTTGC AGTGGAGCAG AGTGAGCAGC AGAGAGCAGG AGTGACGAGG AGACGAGCGA 1680
GTGTTCTGGA GCTGCAGGAG AAAAGCAGAG CAGCGGAGGT GAGTGTGTGT GTGTGTGTGT 1740
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT AGTCACCATC ACCAGCAGAG 1800
GACAGCAAAC ACCAACACAT CTGTGTTTAT GGAAAGTATG TGTGAATGAG TTA 1853