EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-00634 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr1:55723117-55724241 
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
KLF9MA1107.1chr1:55723570-55723583ACCCACACCCACT+6.52
Lhx3MA0135.1chr1:55724008-55724021GTTTAATTAATTT-6.28
Enhancer Sequence
ATAGAGCTGT CAGTGTACTA TTAAATCATA AAGTACATCA GTAAATAATG GACCTGTCCT 60
ATCCTCCAGC CCTACGAGCA GTTTAACCTG AACAAATAAT CCACTAATGC AGAATCTCTG 120
CAGTATCGGT CTCAGGAGAT TATAACAGAT TATAACAGCA CAGTTGAGCT CCGGCGCCGT 180
GATTAAGAAA TGCTGATCAT GTTTTCACAG TATCACACTC ACACACTGCA GGAATATCAA 240
GTCAATATCA CCTTACTGTT ACACTCACAG CTCTGGATAA TGGCTTACTG TTACCAATCA 300
GTTTACTGCA TTAACTGCTC CATCACACAC ACACACACAC ACACGATAAA ACATACACAT 360
TACACACTCA AACACACAAT CTGCAAACAC AAACACACAC ATTAAACACA AATGCTCAAA 420
CACACATTCA CAGAAAGACA GACAGACACA CACACCCACA CCCACTCGAA CATACACAGT 480
CAACCACACA CATCTGCAAA CACACACACA CTCACAGATG GACACTCACA CAAAAACATA 540
CTTACAAACA GACTCTAAAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACTCAAAC 600
ATACACAGTC AAACACACAC ATCTGCAAAC ACACACACAC ACACACACAC ACTCACACAC 660
AAACATACTT AAAAACAGAC TCAAAACACA CACACACTCG AACATACACA GTCAAACACA 720
CACATCTGCA AACACACACA CACACACACA CACACACACA CGCACACACA CACACACACA 780
CTATAATATT TGAATCCTTT GACTATTTAT ACACTGTAAA TGCACCACAG GAATAAACAC 840
AAATCAAACT AAACCGGCTT TAATAATACA GTAATCATAT TGTTTCATAC AGTTTAATTA 900
ATTTATTTAT TTTTATTAGA GTATCAAACT TTTATTTTAC AGAAATATGG TTTTTATTTT 960
TATTTTAATA ACCACATTTT AAAACTACAA ACTATTATAG AGTAGAATCC CAATTAGATC 1020
ATTGAATTTT CTTCACACAG TTGATACAGT GGCCCAGACT TGAGATTGTG CTGATTCAGA 1080
GATCAGAAAC ACACACGTGC AGAACAGAAT CAGGCTGATA CGGA 1124