EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-00625 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr1:54374981-54376353 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
POU2F2MA0507.1chr1:54375408-54375421ACATGCAAATGCA-6.37
RFX3MA0798.1chr1:54375263-54375279TGTCGCCATGGAGACG+6.01
ZSCAN4MA1155.1chr1:54375629-54375644TGCACACACAGAAAC+6.06
ZSCAN4MA1155.1chr1:54375798-54375813TGCACACACAGAAAC+6.06
Enhancer Sequence
TACCACTGAG CCACTGTGCT GCCTTTTTAA ATGAAATTGT AAAGTGCACT AAAACCTTTT 60
AATTAAACTG CTTTCTGCAC CTCAGCCCTA ATCTTCTATC GCCTTCATTT CTTCACACAT 120
TTAAAACTTG TAAAACTTTA CAGGCTATAA GTATCTGAGC TGTGCCGATC TTGAGAAATG 180
TTCTGGTGTT TAGCAGCGCG TGTCATTTCA CAACGCCGTC TGCTCCTCAC ACACTGTTCA 240
TCCAGGGGAA AAGCTGCATG GCGAGGTTAC GGACAGGACT TCTGTCGCCA TGGAGACGGG 300
ACTTTAACAA CACAACAAAC TGCTGCTGCT GCTGGGCGGG AGTCAAATCA CACACACATA 360
AACACACACA CTTACATGCG CGAACACACA CACACACACA CACACACACA GGCATGCAGA 420
CACAGAAACA TGCAAATGCA CACACATGCA GACAAACACA CACACACACA CACACACAGA 480
CGCCTGCACA TACACACACA CACACACACA CACACACACA CACAAGTAGA TACATACATA 540
CATACACACA GATGCACACA CACATGCACA TACACATGCA TACACACACA TGCACATACA 600
CACACACACA TAGAAACACA CAGGCACATG CATACACACA TGCACATATG CACACACAGA 660
AACACACACA CACACAAATA GATTCACTCA AACTCACACA CACAGATACG CTGGCACACA 720
CACACACACA CACACACACA CACACGCACA CACATACCCA CACAGATGTA CACACACATG 780
CAAACACACA TCCAGTCACA AAAAATGAAC ACGCACATGC ACACACAGAA ACATGCAAAC 840
ACACTCTCTC ACATACACAC AAACAAACAC ACACACACAC ATGCACACAA ACACTCACAC 900
ATAAAAACAG ACAAACACTC ACACACAAAA ACTAGCAGAC AGATACACAC ACACACACAC 960
ACAAACAAAT ACACGCAAAC ATTTACACAA ACTCTCACAC ACACACACAC ACACACACAC 1020
ACAGACGCCT GAGTGTTGAT TTAGTGTCAG TGGGCGATGC TGATTGAAGA GATAAATAAA 1080
CACACACACA TTCTTATTCA CACTGCAAAA ATGCGCTCCT GCTGTGTGTG TGTGTGTGTG 1140
TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG ATTCCTGATA AGGACGATGG GAATTTTGTT 1200
GTCATGGTGA TGTTTGGGTA ACAAAACAAG GAAATGTCAC ACTAATGTTT ATCTGTGCGT 1260
CTCTGCAGTG TCGCCATGGC AAAGCTCTGA CCTCGTTCCT CTGACTTTTA CTGCAGCTCC 1320
TCATACTGTG TGTGCGCTGT ATGCTGTTCA ATGATGACGC TTTAAGAGAT TC 1372