EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-00623 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr1:54305627-54307107 
TF binding sites/motifs
Number: 1             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Rarb(var.2)MA0858.1chr1:54306715-54306732AGGTCACACCAATGTCA+6.26
Enhancer Sequence
AATTATCTGT TGTATATATG TATATTTTAT AATATTGCTG ATGCCACTAT TTTATAAACA 60
GCATCATTTT ATCAAAAGTC CTGTGAGTTT GAAGACTCCA GCGTTCAGTC CATTAACTGC 120
AGCCTTACAC ACTTCACTGC TCCATTATTC AAGCTGCCAG TAAATGCAGA ACACTTGAAC 180
TCTACTGGCA GCCTCTGGAC ATCAGACTCC ACATATAAAT GTGTGTGTGT GTGTGTGTTT 240
GTATTATAAC AACAATGAGG CCTTTAAGTA AAGACCTTGA CCTTCACTGT GAGCGTGTGT 300
GTATGAGACT GTGCAATTGT GTGTGTATGT TTGCGTGTGT GTGTGTCTAC AAGTGTGTTT 360
TTATTTTCTG TGTCTGTTTT GTGCATATGT GTTTGTAAGT GTGTTTATGT AAGTATGTCT 420
GTAAGTTTGT GCAAATGTGT TTATGTATAA GTGTGCGTGT GTGTCTGTCT GTAAGTATGT 480
GTGTGTGTGT CTGTAAATGT GTGTGTGTGT CTGTAAATGT GTAAGCGTGT CTGTCTGTAA 540
GTAATTGTGT GTGTGTGTGT CTGTAAGTGT CTGTAAGTGT CTGTATAAGT GTAAGCTTGT 600
GTATGTTAGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTTT ATAAGTGTGT GTGAGTGTCT 660
GTAAATGTGT GTAACTGTAA GTGTGTGTGT GTGTCTAAAT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 720
ATGTGTCTGT AAGTGTGTGT CTGTAAGGGT ATGTGTGAGT GTCTGTCTGT AAGTGTGTGT 780
AATTGTATGT GTGCTTTGCT TTATGTGTGT CTCAATGTTT GTGAAAGGGT GTGTGTGTGT 840
GTGTGTGTTT ACCTCCATAG GGTATATGAT AGTCTGAGCT GTAGCTCCAG CCAATGAACC 900
AGCCACAAAT CTCTCATGAA CTTTCAGTGT TCCTCCTTCA TTACTGCCTC TCATCAAGCG 960
TTTAATCTGA ACACACATAC ACACACACAC ACACACACAC ACACAAACAC ACACACACAC 1020
ACTATCATTT TAAACAGTTT CAAATTACAA GACACAAGGC ACGTCCTCAT AAACCACCTA 1080
AACATTGTAG GTCACACCAA TGTCATCATA CATTTGTGTC CTCATAAGCT ACATAAACAA 1140
ACACACACAC ACACACACAC ACAGTACCTG TTCATAAGCC AGGAATTTGA TGGCAGTCTC 1200
CGGAGCGATC TTAAGCACAT TAATGCCGTT TCCTCTCCAG AGCGCAGTGA GTCCTCCCTC 1260
CTTCACCATC GCCCGCAGAC CACTCCACAC GTTCCCCTTA TCTGAGCTCT GACCGTGAAC 1320
CTGCAGCATT CACAAAAACA AGAATTCTCA CAGTTAGATT CAGTTCAACC CGATGAGGGA 1380
GCAAAGCAAA AGCACTTGGA CCAACTCAAC TACAAACGTG CAATGCCTTT CACAGCCTCC 1440
AGGGGTCAGT GCGATGCTGG AACATGCAGT TGAGAATGAT 1480