EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-00602 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr1:52934691-52936337 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr1:52934877-52934896GACTGCCCTCTACTGGCCG-7.51
ETV6MA0645.1chr1:52936232-52936242CACTTCCGCT-6.02
ZNF24MA1124.1chr1:52935948-52935961GAATAAATGAATG-6.5
Enhancer Sequence
CCTCCATCTT CTTCTCCTCC AGAGATGCGC TGTCTGGAGA GGGCGGGTCG TTCTCTGTTC 60
CCGGGTCGAT AAGGGAGGAG TCTCTGGTTT CAGTGTCTGA GGTGCTGGTG GGCGTTAACG 120
CCTCTCCAGG CTCCGCCTTT TGCACAGAGC ATGGAGCCAA TGAAGATGAG GTGGAGGCAG 180
GGCAAAGACT GCCCTCTACT GGCCGATCTT CAGCACTGCT GCTCACTCGC CGCCGCTTCA 240
CTGGAGTCAC GCCCTCCTCC TCCACTGCAG ACCAGAAAAC AACCCGTGAT GTTATGAACT 300
ATTATTACAC GACTGGCTAC TCAAATATAC TTCCCTGAAC ATGTACACAC ACACATATAC 360
AGATAGAGAG ATAGAGAGAT AGAGAGAGAG AGAGACAGAC AGACAGACAG ACAGACAGAT 420
AGACAGACAG ATAGATAGAT AGATAGATAT ACAGACAGAC AGACAGACAG ACAGACAGAC 480
AGATAGACAG ACAGACAGAC AGACAGACAG ACAGACAGAC AGACAGACAG ACAGACAGAC 540
AGACAGACAG ACAGATAGAT AGATAGATAG ATAGATAGAT AGATAGATAG ATAGATAGAC 600
AGACAGACAG ACAGACAGAC AGACAGACAG ATAGACAGAC AGACAGACAG ACAGACAGAC 660
AGACAGACAG ACAGACAGAC AGACAGACAG ACAGACAGAC AGACAGACAG ACAGACAGAT 720
AGATAGATAG ATAGATAGAT AGATAGATAG ATAGATAGAT AGATAGATAG ATAGATAGAT 780
AGATAGATAG ATATACAGAT AGATAGATAG ACAGACAGAC AGACAGACAG ACAGACAGAC 840
AGACAGACAG ACAGACAGAC AGACAGACAG ATAGATAGAT AGATAGATAG ATAGATAGAT 900
AGATAGATAG ATATACAGAT AGATATACAG ATAGATATAC AGATAGATCG ACAGATAGAT 960
CGACAGACAG ACAGACAGAT AGATAGACAG ATAGATCGAC AGATAGATCG ACAGACAGAC 1020
AGACAGATAG ATAGACAGAT AGATAGATAG ACAGACAGGC AGACAGACAG ACAGACAGAC 1080
AGACAGACAG ACAGACAGAC AGACAGACAG ACAGACAGAC AGACAGACAG ACAGACAGAC 1140
AGACAGATAG ATAGATAGAT AGATAGATAG ATAGATAGAT AGATAGATAG ATAGATAGAT 1200
AGATAGGCGG TACATTCCGC TGTGGCGACA TACATCAGGG ACTAAGCCAA AGGAAATGAA 1260
TAAATGAATG CATGAATAAG AGCATTTTAG AAGGCATGTA TAAGAGTGAT GTTTGTGCAT 1320
GAGTGAACAC CTTTGGCTTT GCGCTCCTTG GCCTCCATCT CCAGTGTGCT GCGCTGCTGG 1380
AGACACAGCC TGCATTTGAC CAGCAGCTCC TGCAGAGCCG GAGCCAGAGC CGCATCCATT 1440
TGCTGAGGAG AATACACTGA CAGAACCAGC AGCAGCGCAC GCAGATCCTA CAACACACAC 1500
ACAGAGACAG AGGGATGAAC ACAGGGCTCG AGCTTCATAG ACACTTCCGC TGAGTGTGTT 1560
ATAAACCAGC AGCCAAAAAA ATTCAAAGCT CCAAAACAGT GACAAAATTC AAGTTTAGAA 1620
AGTGTAAACC TGATGTAAAC ATCCAA 1646