EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-00573 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr1:50263439-50264505 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HOXD13MA0909.2chr1:50263960-50263971CGCAATAAAAC+6.32
HOXD9MA0913.2chr1:50263961-50263971GCAATAAAAC+6.02
POU2F2MA0507.1chr1:50263517-50263530TTCATTTGCATTT+6.59
Stat4MA0518.1chr1:50263597-50263611TCTTTTCCCGGAAG-6.17
Enhancer Sequence
TATAGTTACT AGATCTAGAA TTATCATTAA GATTAAATAT AACAATTTTA AAAGTACATT 60
ATTTTCAGTG TAAGATACTT CATTTGCATT TTTTAGTTGA AGGTCTTTGT ATATACATGC 120
AAATTGTGTC AGTAAAGCAA AACAAGCCTC AAACTAGGTC TTTTCCCGGA AGTAGGAGGA 180
GGAAATATCA TCTCAGACGT AAACGTGAGC TTTTTAAAGG TGGATTGGGG AAGGTCGAGG 240
CCCTGACGAA ACTCCGATAG ACAAATTGGA TTACAGAGCG AAGGATTAAA TAAAAAAAGG 300
GCGGATGACA AACAAGACAA GCCAACTGTG ATCACAGGCT TTAATATATT TCTTTCCCTT 360
CTTCCTTTTC ATCTTGCCCA CTGACCCTCC CTCTTTCTCT TTCTTACGAA GGGAAAAACT 420
CGGGCTTACT CTGGACTTAT TAAAGCTGGG ATTAATTTGT AATGCTCCCT TTACCCTGAG 480
GGCGAGCGGC AGATTTGTTA TCTAAAGCAA ACAGGGTGAA GCGCAATAAA ACAGACGCAC 540
AAAAGACTGT GAAGTTTTAG AGGGAGCTTT TTTTTAAGGA GCTTTGCAGA TTAAGAGAAA 600
GTCGTATGTC GGAAATATGT GGCCTTCGTG AAAAGAAAGT GTGGCAAAAA CGAGTCTAAA 660
ATGTTCTGGG TGTTTTGCGA TTATTAATTC AGGGTTGTAT TTTTTTGCAT GCCATGAGAT 720
ATATGCAACT GCTAGTACTT TTTTTGTTTG TTTTCTATTT GAATATTAAT TTGTGATGTG 780
GTTGTTTATT ATCTGGCTGC GTGAATACGA GTAGTTGGAC ATTATCATTA GTGTGTATTT 840
TTAAGTATGT ATGCATAATC ATTGTGCACA GAAGTGTCCC TATTGGTGTC TAGCAGACAA 900
ATATGAGGAT ATATAAGATT TAAACACAGT TGTTTTAGTT TTAGTATTAT TAGTAACTGC 960
TAATATTATC AACACAGGCT CATTCTGAAA GCCTACCCCT ATATACATTT CTGGAGATCG 1020
CAAGTTATGT AGCCAGAAGT ATGCATGGCT GTATTTTGTC TTTAAA 1066