EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-00570 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr1:50234345-50236289 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CrxMA0467.1chr1:50235939-50235950GAGAGGATTAG+6.02
FOXF2MA0030.1chr1:50236167-50236181TTTGTTTACGTGTG-6.1
Foxj3MA0851.1chr1:50236164-50236181GTTTTTGTTTACGTGTG-6.04
RREB1MA0073.1chr1:50235111-50235131ACCCCACACACACACACACA+6.41
Enhancer Sequence
GTCGGCCCTC GGTGCTCTTG GGTGGCCCTC GTAATCCTTA GAGTCTTTAG AGGGACAGAA 60
AGCCATGGCG AAAACTCAAA GGCAAATCTT ACAACACTTA GAGAGAAATT AAAGAGCTGT 120
TGTTAGTGTG TCTGTGCTTC AAATCCCTGC TGACCGTTAC TCTGGTGTGC TGGGCTTTTC 180
AACAACTGCG GTAATGGAGG ATGCTATGGG ACGAACACGC ATACGATGCA TACACACACA 240
CACACACACA CCTGTTTACA CACAGTCACT CACACTCATA TTCTTATTCA CACAGTCACA 300
CACACACACC TATACACACA CATTTATAGG TCACACAATC ATAGACACCC ACACACATAC 360
ACACTCACGG TGACACACTC TTTACACATG AACATGCACA TATACACACA TTCATGCTCT 420
TATAATAACA GACTCTCGCA TGCAGACACA CACACACACA TTCACACAAT CACAAACACA 480
CACAAACACA CTGTCGCAAA CTCACATACA CATTTATGGT AAAAACAATC ACATACACAT 540
TCACACTCAC ACAAACACAC ACATACACAT ACTCACGGTC ACTGAGTCTC TCACATTTAG 600
TCGCACACAC ACACAAACAC ACACACACAG TCACGCAAAC ACACATTCTT GCTCACACAA 660
TCACACACTC ACACACACAC TCTCACAGTC AAACACACTC ACAGTCACAC TAACACAAAC 720
GCACACAAAC ACACATTCAT GCTCAGACTA TCACACACTC TCACACACCC CACACACACA 780
CACACACACA CACACACACA CAATAATACT GTACACACAC ACATTCATAA TTACAGACAC 840
ACAAACACAC AGTCACAAAT TCATACACAA ACATTCATGG TAACACACTC ACACACACAT 900
ACACACACAC ACACACAACA CACACACACA TTCATATTCA CACAATCACA GGTTCACACA 960
CACTCTCACA GTCACACGCA CAAACACGCA CGCATACACA CATTAATGCT CACACAATAA 1020
CAGATTTACA CACACACACA CACTAATACA CACACATTCA TGTTCACACA ATTACAGGCG 1080
CACACAAACA CGCTCACAAA TTCATACACA CACCTTAATG GTAACACACT CACACACACA 1140
TACACATACA CACACACACT TACACGCACA CATACACACA TTCATGCTCA CTCAATAACA 1200
CTCTCACATG CACACAAAGT CACACACACC CATACACAGA CATTCATGCT TACCCAGTCA 1260
CAGACTCACA CAAACACACG CACACACACG CACACACACT CATGGTCACA TAATCACAGA 1320
CTCTCTCTCA CACACACACA CACACACACA TTCATGGTCA CACAATCACA GACCTTCACA 1380
CACACACACA CACACACACG CACACACACA CACACACACA CACACACACA CTTTCACACA 1440
CAGTCAATCA CATTCTTATT TACACAATCA CTGACACACA CACAAACACA AAGCCCTACT 1500
CACTCATACA TACACATAAA ATTTGACACA ATTACAGAAT CACAAACACA CACACATATG 1560
GCAGTGAGAG TAAGTGAGGC AGTGTCTGCA GCCAGAGAGG ATTAGAGATT AGTGCCGTCG 1620
CCAGCATTCC TCACATACCT GATTCCTGAG TTTACCTCAC ACCGAACACC TCATGACTGC 1680
ACACACACAT ACACACACAC TCACAGCATC ATACACTGAT AACAACACTA CAGTCAGCTG 1740
CACCTGTCAA AATACATCAC TTATGTTTCA ACCAAACCTC GATTCTTCCA TTTATAGTTG 1800
TGTGTTTTCA GTTCAGGATG TTTTTGTTTA CGTGTGCAAG CTGCCGATGA CGTTTAGTCA 1860
TAGTTTAAAA TAAATATGTT GTCATTTAGA GCATGAAATA ACAAAGATGC CATTTTTGAT 1920
TGCACATTTA AAACACGTCA CCAT 1944