EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-00561 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr1:49107305-49108267 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXA1MA0148.4chr1:49107684-49107700ATTTGTTTATTTAGTG-6.21
FOXC2MA0846.1chr1:49107685-49107697TTTGTTTATTTA-6.18
FOXE1MA1487.1chr1:49107818-49107833TTTGTTTGTTTTGGC-6.19
FOXE1MA1487.1chr1:49107685-49107700TTTGTTTATTTAGTG-7.29
Foxd3MA0041.1chr1:49107743-49107755GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr1:49107817-49107829GTTTGTTTGTTT+6.32
Enhancer Sequence
AATAATAATG AAGTATTATC ATTATTATTA TTATGGTTTC TGTAATGTGA ATGGGGAACC 60
TGACTAAAGA GGTGCGGATA AAAATGCAGG TTTACTGAGA ATATGGAGCA GGTGTGTGTA 120
TGTGTTGCTT GACTGGATCT TGTAATCCAT ATGGAAGCAG GGTTGTAGTC CATGTAAATG 180
TTCTCCAGGG ATCTATGAAG GTTAGAGCGC TGGTGATTGT GTTGTTGTTG TTGTTGTTGT 240
TGTTGTTGTT GTTGTTCAGT TTCCTCTGAT ATTGTTCAAA ATTCTTTTAA AAAGTTTTTG 300
TGGTTCGTAA TTTTATTTAT TTTATTTGTT TGTTTTCCTT TGTTCTTCTT ATTATTACTT 360
TTAGAAATAA ATTGCTTGCA TTTGTTTATT TAGTGCTGAG TGTATTTATT TATTTATTGT 420
TCTTTTATCT TCATTGCTGT TTGTTTGTTT TTGGTTTGTT TACAAAATCC GACCACTGAT 480
TATTTCTTGT TCTAATAATG TCCAATACAT TTGTTTGTTT GTTTTGGCAG TGGATTCAGT 540
GTTTTGATTT TTCAACAAAT TGACATGTTT GTGCTCATTG TAAAACTTCA GAAATCTTTC 600
AGTTGATCTA AAAGTGCTCG GAAAGCGAAC AAGCTCTCCA AGCTGTACCA AAACAGAGAG 660
AACACTGAGA TAAGAGCTGA ATCAAAGATG GCCAATCCTT GATTTGAAAT ATCTTCTGCT 720
CTGTTTTTCC TTTTTTCATT TCTCCCCCCC AACCAAACTG ACTCATTAAC TTCAAAGCCA 780
CTGATAGAGC TTTTAATTAA GACGAATGTA ACACTGAAGC ACAGATAAGC CTCCCCGTAT 840
TAAACACACA TCATTAGGAA CTCACTGTAG GTTCACATTC ACACCACTAA TAATCACTGA 900
CAAACCTGCA CTGCCAGAAA CACAGCCCTT ACCTGACAGC ACATGATGTC ACTTCCTGTG 960
GG 962