EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-00548 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr1:48553486-48554598 
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RARA(var.2)MA0730.1chr1:48554580-48554597AGGTCAGACTGAGGTCA+7.02
Rarb(var.2)MA0858.1chr1:48554580-48554597AGGTCAGACTGAGGTCA+7.45
Enhancer Sequence
AGATAGATAG ATAGATAGAT AGATAGATAG ATAGATAGAT AGATAGATAG ATAGATAGAT 60
AGATAGATAG ATAGATAGAT AGATAGATGA AAGAAATGAT GGATAGATAG ATAGATAGAT 120
AGATAGATAG ATAGATAGAT AGATAGATAG ATAGATAGAT AGATAGATAG ATAGATAGAT 180
AGATAGATAG ATAGATAGAT AGATAGATAG ATAGATAGAT AGATAGATAG ATAGATGAAA 240
GAAATGATGG ATAGATAGAT AGATAGATAG ATAGATAGAT AGATAGATAG ATAGATAGAT 300
AGATAGATAG ATAGATAGAT AGATAGATAG ATAGATAGAT AGATAGATAG ATAGATAGAT 360
AGATAGATGA AAGAAATGAT AGATAGATAG ATAGATAGAT AGATAGATAG ATAGATAGAT 420
AGATAGATAG ATAGATAGAT AGATAGATAG ACAGATAGAC GGATAGATGG ATAGATGGAT 480
AGATAGATAG AAATGATGGA TGGATGGATG GATGGATGGA TGGATGGATG GATGGATGGA 540
TGGATGGATC GATCGATCGA TATAATATAA AATATATATA TATATGCTCA GATAAAAATA 600
CACTACTGAC GTCGCCCCTT TAAATGTTTT CAGCCATGTT GTTCTATTCA TGGTGGGCAG 660
AGAAGCACCA ACATTATTAT TCAGACAAGA ACCTCTAAAG GGTATTTTTC AGTCTCGGCA 720
TGACAAAAAT CAGCACTGAC GTCAAAGGCT GGTTGAACGT AGTGTTGAGC ACCAGCAGGA 780
CATCAAACCA CACCTGGAGC CACTGCAGCC TCCCCTATTG ACCCTGAACA TCGCTGCTAA 840
CGTAGCTTTA CCTTCAGGCT CCTCCAGAGA AGAAAAGATG AAAGCCGAAC TGACGGTAAG 900
CTGGTTAGTC CTGCGTTAAA TGCATGGACT GACGTTTTCA GCAGCGTTCT GTAAATCTCT 960
GAATGATGCA CACTGAGCTT TTGGCCTGAT GGCAGAGCAT TGGAGATGTC TGTCCACTGA 1020
CCTGAGCTCT GACAGACGGT GTGCTGAGGT GGCTTTCGGT GTGGATTTAC CCCAGGGTAG 1080
CAGAGGTAAG GACTAGGTCA GACTGAGGTC AA 1112