EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-00536 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr1:47316870-47318224 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHA15(var.2)MA1472.1chr1:47317011-47317021AACAGCTGTT+6.02
BHLHA15(var.2)MA1472.1chr1:47317011-47317021AACAGCTGTT-6.02
MSCMA0665.1chr1:47317011-47317021AACAGCTGTT+6.02
MSCMA0665.1chr1:47317011-47317021AACAGCTGTT-6.02
MYF6MA0667.1chr1:47317011-47317021AACAGCTGTT+6.02
MYF6MA0667.1chr1:47317011-47317021AACAGCTGTT-6.02
Rhox11MA0629.1chr1:47317271-47317288ACCTTTAACAGCGGATA-6.19
Tcf21MA0832.1chr1:47317009-47317023AGAACAGCTGTTTT+6.11
Tcf21MA0832.1chr1:47317009-47317023AGAACAGCTGTTTT-6.3
Enhancer Sequence
GGCATTTGGT ATTGGACAAA CAGAGTAAGT GAGAGAACCG TGTGTATATG TGTGTGTGTG 60
TTTGAGAGGT CCTGGAATAA TAGTGTGTTG AACGCGAGAC TGCATGATCA CTGGAGCACA 120
GTTGAAAGCG AGCTGGATAA GAACAGCTGT TTTCTCCAGG GAGCGTGTGG ATCTTTGTGT 180
CTGACGTGTG GGTGTTGGAC AGGAGAAGGA CAAGAGAAAG TGTATGTAAA TGTGAGTTTT 240
GTGTGTGTGC GCTGCTTGAG GTATTTTGTG ATGTGTTTAG ATGTGGGTAT ATATTCAGCG 300
CTCGGTGGAT GTTTATCTGC AGGACTGTAA TAGAAAAGCG TAGCCAGCCG TGCATCTCTC 360
TGCTCTTTCA GGGGTCGTAC ACTGTGGATG CTTTTTTTTA AACCTTTAAC AGCGGATATA 420
GACGGAGCGT GCTGAAATGG AGCATATTAG GGTCTCAAGA TGCGTTTTTA ACAACTTGTC 480
GTTATCCGTA ATTACCCCAT TAATGTTACA GTAGCTGATG TAAACTCTTG GTACGTTCAA 540
GATCTCTGCT GCTTTTTGAA GTAACTGAAG CACTGTGTCA TCTATTTTTA ATTCTGAAAG 600
CTGTTTTAAA CATGGTATGA ATACATTACT GTACATGGGC CCCGCTGTAT TTTCGCAAAC 660
AAGTGTCCTT GATATTGAAG GAATTCCTAT CTATCTATCT ATCTATCTAT CTATCTATCT 720
ATCTATCTAT CTATCTATCT ATCTATCTAT CTATCTATCT ATCTATCTAT CTATCTATCT 780
ATCTATCTAT CTATCTGTCT GTCTGTCTGT CTGTCTGTCT GTCTGTCTGT CTGTCTGTCT 840
GTCTGTCTGT CTGTCTGTCT GTCTGTCTGT CTGTCGTCTG TCTGTCTGTC TGTCTGTCTG 900
TCTGTCTGTC TGTCTGTCTG TCTGTCTATC TATCTATCCA TCTTTCTGTT TGTCTGTCTG 960
TCTATCATCT ATCTATCCAT CCATCCATCC ATCCATCCAT CCATCCATTC ATCCATCTAT 1020
CTACCAGTCC GTCTGTTTGT CTGTCAATCT ACCTATGCAA GTCATCAATC CACCTGTCTG 1080
TCTGCCTGTC TGTCTATCCT GCTGAAGGCT ATCCTGTCTG TCTGTCTCTC CATTTATAAT 1140
TATCGATGTT TATCTTTAAT GCCTCCTTCT TCATCTTACC CTAGACATGC TCAATAATGT 1200
TCATGTCTGG TGACTGGGCT GGCCAATCCT GGAGTACCTT GACCTTTTTT GCTTTTAGGA 1260
ACTTTGATGT GGAGGCTGAA GTATGAGAAG GAGTGCTATC CTGCTGAAGG CTATCCTTCC 1320
TGTCTGCCTG TCCGTTTATA TTCATCCATA TTTA 1354