EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-00530 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr1:46940106-46941144 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BARX2MA1471.1chr1:46940725-46940737TTAATGGTTTTT-6.44
FOXB1MA0845.1chr1:46941017-46941028ATATTTACATA-6.62
FOXC1MA0032.2chr1:46941017-46941028ATATTTACATA-6.62
ZNF263MA0528.1chr1:46940639-46940660TGGGGAGGAGGGAGAGAGGAA+6.68
ZNF263MA0528.1chr1:46940642-46940663GGAGGAGGGAGAGAGGAAGGG+8.6
Enhancer Sequence
CACTTTTTAT ATCGATTTGT TTTGGGACAA CATGAAGGAA TTGTGTGGAA CCCAGCATTT 60
TTTACTGTGT GTGCTTAATT GAATCATTTT AAATCATCAT ACTGTATGAG CCAGAATCAT 120
TTATAAATTG TTTTACACTT ATTCTGTCAT ACGTTCACCT TTAGGAAGGT TTCTACGCAA 180
ACTTTTATAA ACGAGACCCC TGGATGTTTT CACAAGCTCT CCTCTCGATT GTAGATTGTT 240
GTTAGATTGC TTTCATGCAC GAGCCTCTTT TTCACAGTGA GGAACCGAGA GCCTTTATTT 300
GTAGTTTCCG TCTTTCTCTG AGCGTTAGAT GTGGAGAGGG ATTGAGGACG GAGGGGCTCT 360
GCTGGGACGG GGTCAGTCGG ACGGGCTCTG CTTTACGTGG CAGTGAGTTC AGTGTGACGT 420
TGAACTAGTT AATCTTGTTT GCACAGACTG AGGGCCGTGT GGAGGAGTGG AGGGGCTGCG 480
AAGAGTGTGT GTGTGTGTAT TTGTGTCTGT GTGTGTGGAG CAGATGGCAG ATTTGGGGAG 540
GAGGGAGAGA GGAAGGGCCT TGTTGGAGTG TGTATGTGTG CTCCATTGAA AGAAATTGGC 600
TTAAATAGGT CAATGTGGTT TAATGGTTTT TAGAAGAATG AAGTTGTTTT TAATGATGTC 660
TCTTGAGTTT AGCTTGACTG GAAAGTGACT GGATATTGAC TTCCAGTTGC TCTTCAGTAT 720
ATTTTGGACT GATGGACGTC GGCTTGTTTA TATGAAATTA ATATCAGCTA TAAATGAGAG 780
AAAAGCTGGA TTTTAGAGCT AATCTCCCAT AAATAGATTT TGGACACACA TCCTGATTGG 840
CTGTAGACCA TTGTCAATCA CTCTCATCAG TGCAGTGTCT CCTGTACAGT ACAGAATGCG 900
TTCGGCTTGC CATATTTACA TAAGTGAAGT TTCATAAACT AATTTTCGAG AGGAGCAGGT 960
GATATGGTTG AGCACTGCTG GTCACTCATC CGTAATCAGT AACAATCCAA TCAGAGTGAT 1020
CCTAGCTTAC TATAAATG 1038