EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-00516 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr1:45797483-45799161 
TF binding sites/motifs
Number: 26             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr1:45797779-45797796ATTGGTTAATTAATTGG-6.08
Alx1MA0854.1chr1:45798615-45798632GTTGGTTAATTAATTGG-6.3
Alx4MA0853.1chr1:45798615-45798632GTTGGTTAATTAATTGG-6.21
ArxMA0874.1chr1:45797929-45797946GTTAGTTAATTAGTTGA+6.53
DMRT3MA0610.1chr1:45798316-45798327GTTGATACATT-6.02
ESX1MA0644.1chr1:45798038-45798048GTTAATTGGT-6.02
ESX1MA0644.1chr1:45798154-45798164GTTAATTGGT-6.02
ESX1MA0644.1chr1:45798292-45798302GTTAATTGGT-6.02
Hmx2MA0897.1chr1:45798109-45798126GTTGATTAATTGGTTGT-6.06
Hmx2MA0897.1chr1:45798324-45798341ATTGATTAATTGGTTGA-6.31
Hmx2MA0897.1chr1:45798288-45798305ATTGGTTAATTGGTTGG-6.54
Hmx3MA0898.1chr1:45798288-45798305ATTGGTTAATTGGTTGG-6.19
Hmx3MA0898.1chr1:45798109-45798126GTTGATTAATTGGTTGT-6.1
Hmx3MA0898.1chr1:45798324-45798341ATTGATTAATTGGTTGA-6.21
LHX2MA0700.1chr1:45797933-45797943GTTAATTAGT-6.02
LHX2MA0700.1chr1:45798563-45798573GTTAATTAGT-6.02
NR2C2MA0504.1chr1:45799145-45799160TGACCTCTGACCTTC-7.33
Nr2f6MA0677.1chr1:45799145-45799159TGACCTCTGACCTT-7.28
RELMA0101.1chr1:45799087-45799097GGGGATTTCC+6.02
RXRBMA0855.1chr1:45799145-45799159TGACCTCTGACCTT-6.55
RXRGMA0856.1chr1:45799145-45799159TGACCTCTGACCTT-6.58
RxraMA0512.2chr1:45799145-45799159TGACCTCTGACCTT-6.62
ZNF24MA1124.1chr1:45798279-45798292CATTCATTCATTG+6.59
ZNF24MA1124.1chr1:45798271-45798284GATTCATTCATTC+6.74
ZNF24MA1124.1chr1:45798275-45798288CATTCATTCATTC+7.82
mix-aMA0621.1chr1:45797932-45797943AGTTAATTAGT+6.14
Enhancer Sequence
TTTTGTGCAA GCTTTAGTTG AAACATCAAA TCAAAGTTTT TACAGAGACA ATTAAAAAAG 60
ATTTATTAAT TCTAAATTTA CATGCATTAA ACCCATGTGT ACATGTTTCA CATACTGTAT 120
TTAATTTTTG CAAGTGTTAA TTGTTTAATA ATGAAACATT TTAAGCATTT AAATACTATT 180
ATATGATTTG TAAATTAATT CATTAAAGAA ATTGTTGATT GATTGATTGA TTGTGTTTGT 240
TGATTGATTG GTTGGCTGAT TGATTGGTTG ATTAATTGAT TGCTTAGTTA ATTGTGATTG 300
GTTAATTAAT TGGTTAAATC GTTGATTTGG TTGGTTTTTT TAACCGATTT ATTGGTTCAT 360
TCGTTTGTTG GTTTGTTATT TGGTTGATTG GTTGATTAAT TTATTGGTTT ATTGGTTGAT 420
TGTTTCTTTT GTTGATTGGT TGGTTGGTTA GTTAATTAGT TGATTGATTT ATTGGTTCAT 480
TGGTTGATAA ATGTTTTTGG TTTGTTGGTT GGTTAATTGA TTGGTTGGTT AGTTGTTTGT 540
TTGGTTGGTT GGTTGGTTAA TTGGTTGGTG GGTGGTTAAT TGATTGGTCG GTTGGTTGAT 600
TGATAACTTA ATTGACTGCT TGGATAGTTG ATTAATTGGT TGTTTGGGTA ATTAATTTGG 660
TTGGTTGGTT AGTTAATTGG TTTGTTGGTT GATTGGTTAA TTGATTTATT GCTTTGTATG 720
TTAGTTGGTT TGTAAATTGG TTGATTGGTT GATTAATCTT AGTTTGTTTG TTGATTGATT 780
GATTGATTGA TTCATTCATT CATTCATTGG TTAATTGGTT GGTTGAGTAA TTGGTTGATA 840
CATTGATTAA TTGGTTGATT AGTTGATTTA TTAGTTCGTT CGTTTGTTGG TTGGTTGGTC 900
TGTAAATAAG TGAGTGAGTG AGTGAGTGAG TGAGTGAGTG AGTGAGTGAG TGAGTGAGTG 960
ATTGAGTGAG TGAGTGAGTG AGTGAGTGAG TGAGTGAGTG AGTGAGTGGT TGGTTGGTTG 1020
GTTGGTTAAA TGGTTGGTTG GTTAAATGGT TGGTTGGTTA GTTATTTGAG TGGTTGATTG 1080
GTTAATTAGT TATTGGATTG GTTGGTTGGT TGGTTGGTTA ATTGGGTTGT TGGTTGGTTA 1140
ATTAATTGGT TGGTTGGTGG GTTTAATTGG TTGGCTAATC AATTGATTGG TTGGTGGGTT 1200
GGTTGATTGA TTTAGTTGGT GGTTTGGTTG ATTAATTGAC AGGTTTTTTA TCATCTTACA 1260
AACTATAAGC GATATAAAAT GACAACATGT ATCTTGTATA GACTGTAAAG TACTATAATA 1320
TAAACCATAA ATGTATTTAA ATTGTAGCTA TAAAATGTAT CTTTATTCTT CAGTCCAAAT 1380
TATTATATTT GTTTTATTAT TGGTCTTTAT TGATCTTCAC AGAGGCTGCA GTTCAGTCGT 1440
GTGGAGTTAC ACAGAAAGGC ACATTGTGTT TATGGTTGTC TTCATTAAAA GTGACGGCTT 1500
TTATTCTCTT AACCTCTAGT GTGTGAGTGA CTGATGACAG ATGAGCGTAC AGTGAGTGTG 1560
TATATATATA GCAGGACACA AGATCTAAGA GAAGAGAGAG AGTAGGGGAT TTCCAGATCC 1620
TCCACAGCCT GACCTGCTTT TATAAAGTGC TCCTGCTGAA TCTGACCTCT GACCTTCA 1678