EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-00476 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr1:41756786-41758242 
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXC2MA0846.1chr1:41757960-41757972TAAATAAACAAT+6.04
Foxq1MA0040.1chr1:41757962-41757973AATAAACAATT-6.02
NFYAMA0060.3chr1:41757501-41757512TCTGATTGGTC-6.14
PBX1MA0070.1chr1:41757788-41757800TTTGATTGATTG-6.18
PBX3MA1114.1chr1:41757012-41757029CAGACTGTCACTCACAC-6.46
ZNF24MA1124.1chr1:41757839-41757852CATTCATTCATCA+6.11
ZNF24MA1124.1chr1:41757827-41757840CATACATTCATTC+6.37
ZNF24MA1124.1chr1:41757639-41757652CATTCATTCAATC+6.64
ZNF24MA1124.1chr1:41757819-41757832CATTCATTCATAC+6.64
ZNF24MA1124.1chr1:41757803-41757816GATTCATTCATTC+6.74
ZNF24MA1124.1chr1:41757807-41757820CATTCATTCATTC+7.82
ZNF24MA1124.1chr1:41757811-41757824CATTCATTCATTC+7.82
ZNF24MA1124.1chr1:41757815-41757828CATTCATTCATTC+7.82
ZNF24MA1124.1chr1:41757831-41757844CATTCATTCATTC+7.82
ZNF24MA1124.1chr1:41757835-41757848CATTCATTCATTC+7.82
ZNF384MA1125.1chr1:41757620-41757632AATAAAAAAAAA+6.62
Enhancer Sequence
GGACGTCTTA CTTATTCATT TTCTATACGA TCCTGTTCTT GTTTGGTGAG TTTTTGACTC 60
ATGAACAATT CATGAATGTA TTGTTCAGCT TGGTGTACTG GCTCAAAAGA TTCATCAAAA 120
ACATACGGGT CGAAATGCAC GATTCATTCC CGAATCGCAC ACTGGCAGAA GAATGGAAGT 180
ATCAGCTCTA TCAAGGACAG GCTGGGCTCA CTCCTCCACT CTCCTTCAGA CTGTCACTCA 240
CACCCTGCGC CTGCAATAAA CACACAGTGG AATAACAATA GAGGCGATTC CCCAGGGCTC 300
GCTTCACTTT CTCTCCTCTG CACTTTCTCT CTCGTATTCA AATGGGCTGT TTTCCATTGG 360
CTCCCATGGG CCTTTGTGCC CTTTCAAACC CCCTTTAAAG TCTGCTTTTG TCTCTGGTTC 420
AGTGATTGGA GGTTGCATTG CATGACTGAT GTTTTTTTTT TCCCACTTAC TCAACCAACA 480
CATGTTGATT AGCATCAGCT CGCCTTTTGG AGTCAAACTT AGAAGGGTGG TCCACAGTGT 540
ATTTTTAAGG CTTGGTTGTG TTTATAAGAC GCAAAGCCAT GTGTGCTCAT GCTTCATTTG 600
TAGAAAACCC CATTATTTTT CATATATCTT ACTTTGATTA TATGCAGCTA CTCAGCTAAC 660
ATGAAAACCA CTGTACTATT TCCTAGTTCC TCTGAAAGTC CTCCCCTCAA GAGGCTCTGA 720
TTGGTCAGCC AACATAATGT GCTATGATTC ATGGATCGGC TCCACGTCAC TACGTCACGC 780
CCCTACGCCT CTTTAATGAA ATGTATTATA AATGTGACAC TCTGTGCCAG GATAAATAAA 840
AAAAAACAAT TATCATTCAT TCAATCGTCA TCCATCCATC CATCCAACCA GCCAACCAAC 900
CAACCAACCA ACCAACCAAC CAACCAACCA ACCAAGAGTC GATTGATTGA TTGATTGATT 960
GATTGATTGA TTGATTGATT GATTGATTGA TTGATTGATT GATTTGATTG ATTGATTGAT 1020
TCATTCATTC ATTCATTCAT TCATACATTC ATTCATTCAT TCATCAGTCT ATCTTTGCGT 1080
TTTCAGTTCT CTGTGTTGTT TTACTATCAG TTTGCCATTT GGAGTCAAAC TTACTGAGAT 1140
ATATTGTAAA TAAGACCTTC TGTGCCAGAA TAAATAAATA AACAATTAAA CTAAACAATT 1200
AGTGTTTTGC TTCAATCATC ATCCAGTCAA CCAATCATCC TACAAACCAA CCAACCAAAG 1260
AGTCAACTTA TTAAATGATT GATTGATTGA TTGATTGATT GATTCTTTGA TTCATAAATT 1320
TTTTCATTTA TTCATCAGTC TGTCTTTGCG TTCTCAATTC TCTGTGTTGT TTTTGCTATC 1380
AGTTTGCCAT TTAGAGTCAT ACTTACTGAA ATATATTGTT AATGTGTCCT TCTGTGCCAG 1440
AATAAATAAA TAAACA 1456