EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-00450 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr1:39685663-39687651 
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Nkx3-2MA0122.3chr1:39686609-39686622GAAACCACTTAAT+6.24
Nkx3-2MA0122.3chr1:39686967-39686980ACAACCACTTAAA+6.57
Enhancer Sequence
AATTGTGAGA TATCAAAGGT AGTGAAAGAT ATTCTGTCTT TAAAAAAGGC GAAGGGATTT 60
AGGTAGACAG GAAGTAGAGC CAGATTAGGA TTCAGATGTT ACCTTGATGC CTCCCCTACT 120
TTTAAATGCA TCCTTCGAAG GCAACATCTT CCAGGTTTAG GGCACAGCCA CAGACAAACT 180
TAGCAATGTG CTAAAAACAT GTATAACATC ATAGCTACAC GACAACACTA TAGCAACACC 240
TTAATCAAAC ATATTTCTAG AAATATGCTA AAAACACCTT AGAAAAATGT TCATTCTGTA 300
TATAATAATC CCTCACAACA CCCAAGCAAG GTGATTAAAA CACCATTTAA CACCATAGGA 360
CCCCCACACA CACAATTTAG CAACAACCTA GAAAAGCCCC ATCAACCACC CAAAAAGCAA 420
GCATCTGGCA ACCACCTACA GCATTAAAAA ATCTCATTAT AACACTCTGG CAACCATTCA 480
AGACACCCTA GCAACCATAT ATTGAAATGT TAGCAATCTC CCCAACCCTA GCAACCACCT 540
AAAAAGCAAG CATCTGGCAA CCACCTACAG CACTCTTAAA AAAGACTTAA TAAACCACAT 600
CATAACACTT TGGCAACAAT TCAAAACACC CTAGCAACCA TATACCGAAG TGTTAGCAAT 660
CTCCCAAAAA TCCCTAAACC CTACTGACAA CCTAGAAAAA TCCCTAGCAA CCAACGACAA 720
CACCCCAACA ATCACCAAAA AAGCAAGCAT CTGGCAACCA CCTACAGCAC TCTTAGTACC 780
TAATAATCCC CCACAACGCC CTAGCAAGGT GTTTAAAACA CCATTTAACA CCATAGGACC 840
GACTCACACA CAACAATTTA GCAACAACCT AAAAAAAACT CCATCAACCA CATAAAAAGC 900
AAGCATCTGG CAACCACCTA CACAGCACTT TTGAAAAAAG ACTCAAGAAA CCACTTAATA 960
ACACTTTGGC AACTATTCAA GACACCCTAG CAACCATATA CGGAAGTGTA AGCCATCTCC 1020
TACAATTCCC CAGACCCTAG CAACAACCTA GTAAAATCCC TAGCAACCAC TAACAATCTC 1080
CCAGGCCCTA GCAACCACTG ATAACACCCT TACAACAACC TAAAAAGCAA GCATCTGGCA 1140
ACCACCTACA ACACTCTTAT AAAAGACTTA AGAAACCACA TTATAATACT CTGGCAACCA 1200
TTCAAGACAC CCTAGCAACC ACAAAAGTGT TAGCAATTTC CCACAATTCC CCAGACCTTA 1260
GCAACAACTT AGAAAAAGCC ATAGCAACCA CGGACAACAC CCTAACAACC ACTTAAAACA 1320
CAAGCAACAG GCAACCACCT ACATCACTCT TATAAAAGAC TCAAGAAACC ACATAATAAC 1380
ACTCTGGCAA CAATTCAAGA CCACCCTAGC AACCACCAAG CAAAGTAGCA ATCACCCAAA 1440
TCACTTTAGC ATTATGCCAG CTAATTCTGC TCTGCACCAT TCAGAATTTC TGTGCAAATG 1500
GTGAAATTAT CAATGTTGTG ACACTAGACT ACCTGAGAGG CTGGCTGCCC ATTAAACAAC 1560
GCCCCACTGT TAATATCCAA AGCCTCCACA CATCTATTAG TTCACACACA TGCTTTACAA 1620
TGACATTAGC CCTAACACAA ACACACTTAC TTACACACAC GCACACACAC AAACACATCC 1680
CACCATACAG TTCCCCTCTT TGATCACCCA CAAATAAATT ACAGCCGTCA CAGCGACATG 1740
CAAAATGGCA TGGAGTGACA ATCAAAGCCT GACTAACAAG CTTTTAAGGA GCATGCTAAA 1800
GTTTCATAAT CACACACTAA TAAGATTATG CAAACTCGTC CATTTTGCCA CCTGTGTGTG 1860
GAAAAAAAGT AGAAACAAAA AAACAAACCC CTAGATGCAG TCTGATCTCT ATGAATGTGT 1920
GTTCAGCTAT TGCGAGAAAG CTTTAACTGA ATGCCTCTAC CTTCATAAGT GACCATAAAT 1980
ACTACTAA 1988