EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-00338 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr1:28704309-28705069 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr1:28704948-28704965TGAGTTAATTAATTATT+6.86
Lhx3MA0135.1chr1:28704953-28704966TAATTAATTATTA+6.18
Lhx3MA0135.1chr1:28704950-28704963AGTTAATTAATTA-6.64
RREB1MA0073.1chr1:28704909-28704929CCACAAACCAACAGCAAAGA+6.57
SPDEFMA0686.1chr1:28704490-28704501AACCGGATGTG+6.02
Enhancer Sequence
TTAATAACTC ATCTCTAAAA ACTGATTTAT TTTATCTTTG TCATGACAGT AAATAATATT 60
TTACTAGATA TTTTTCAAGA CACCTCTATA CAGCTTAAAG TGACATTTAA AGGCATTTAA 120
TAATAGGCAT TTAATAGACG CTATTGCTCC GGCCGTAAGT AAGGATACGC AACTACCGCT 180
CAACCGGATG TGCGCGCTAC CGTCCGTGAA AAAGGCCTAT TGAGGCAAAA AACTAGATTA 240
GAGATGTCCA TGTAAACGTA GTCAGTATTG TCTTTGAAGT AAGTGAAAGA TCCAGAAGAG 300
CATCGTGCTG ATTTGATTCA GAAGGGCACT TTTTTGTCAG ACGGCTCACC GGTCAGGTGT 360
ACATCCACGC TAAAACATCA AGGTGTAAGT CATCATTACT TGCGTAGAAT AGACCCAGCT 420
CCCAACCCAA CTTTGAGAAT AGATTAACAG CAATATTTTT TTTCGCCCGA TAAAGAGTCT 480
CGTGTCAACA GCCCACCACT ATTAAAAAAT GTAGGTCTTA TAGGCTTTTC CTTACTTGTG 540
AACAGCCACA ATATGCTGGT GCAGATTCTC ACTGAGCTCC TTTGTCTTAG CCATAACTGT 600
CCACAAACCA ACAGCAAAGA GCTTTTGTTT TTCACTTGTT GAGTTAATTA ATTATTATCT 660
TTTGGGAAAA GCATGTGTCA TTTCCAGTCA TTAAAACTAG CTGGTTAAAT AAAAGTAACT 720
TTAAATCATA ATTGGGGTCC ACATCATACG TGAACGATGC 760