EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-00333 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr1:28227123-28228167 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr1:28227221-28227242AGTTGGTTTCGGTTTCAGTTG+6.46
IRF3MA1418.1chr1:28227864-28227885TAGTTTTGGTTTCGTTTCTGC-7.47
IRF4MA1419.1chr1:28227864-28227879TAGTTTTGGTTTCGT-6.39
IRF4MA1419.1chr1:28227224-28227239TGGTTTCGGTTTCAG-7.58
IRF5MA1420.1chr1:28227865-28227879AGTTTTGGTTTCGT-6.75
IRF5MA1420.1chr1:28227225-28227239GGTTTCGGTTTCAG-7.1
IRF8MA0652.1chr1:28227865-28227879AGTTTTGGTTTCGT-6.04
IRF8MA0652.1chr1:28227225-28227239GGTTTCGGTTTCAG-6.91
IRF9MA0653.1chr1:28227225-28227240GGTTTCGGTTTCAGT-6.95
IRF9MA0653.1chr1:28227865-28227880AGTTTTGGTTTCGTT-7.09
MAXMA0058.3chr1:28227341-28227351AGCACGTGGT-6.02
NEUROD1MA1109.1chr1:28227931-28227944ACGCCATCTGTCC-6.62
YY1MA0095.2chr1:28227957-28227969GCCGCCATCTTT-6.22
Enhancer Sequence
CACACACACA AATAATCGTG TTTGCGATGC GCGCTCTCGT CCTGGTGTTA GTGATCATCT 60
GTCTGCAGCA TAGTGTTTTA TTCCCAGCAT CTCAGTCTAG TTGGTTTCGG TTTCAGTTGG 120
CACTGAAACA TGCACGCTGC ATGTGTGGGT GCACAGTGAT TGTCTTCATT CATCGTGTAC 180
TTGTGTCTTG CGTTAAGTCC TCTGTTGGTG TTGTGTTTAG CACGTGGTGC ATGTTTGCAT 240
GCACCGCATG CTTATGTGTT GTCATATGAA CATGCGGTTC ATGAGTTCTC ATTGGCTGCG 300
TGTTCTAGTC TTGTTTTATG TGAGCACATG GCTTGCGGTG TTTTCTTGTG TCATGTGCTC 360
TTCCGTCTAT TGTCTAGTCC CACCCTCCTT GTTAACCCCT AATTTGTTAA GAGTGTATTC 420
TGACCTGCTT CCTTGTGGTG TTGTTGTCCC TGTGTGTCGT CTGCATGTTT TTCTGGAGCA 480
CGCGCCTTTT GTTATGACAG CTCACCATGT GCTTCATCCT TGGCGTGTTT CTTCCCCGCC 540
TTCTTGTTAT CCTATTATCT TTTCATTAGC GTTCAGGGTC GTCACCTGCA GTTCATTGAT 600
TTCATCCCCT ATTTAATCCT TTTTGTCTCT TCACCTTTTG TCAGACCATC TTTGTGTGTA 660
GTCTATGCAA CTCGTCTGAG ATCTGTATAG TTTGATCACT CTCCTGTCGT GTCCTGTCGA 720
GTTTCTAGAC TCCAAGTTCT GTAGTTTTGG TTTCGTTTCT GCGCATCTCT CCTCTGTCCT 780
CTCAGAACCT CCGTGTTGGT GTCAGATCAC GCCATCTGTC CTTTGCGGTG TTTAGCCGCC 840
ATCTTTAGCG ATCTTCCGCC CACCAGCGTC TCCTCACTTC CGCCTGCCTG CCGCTCCGTC 900
CGCCGTACGC GGAGTTGAGT CACGCCGCTC CGCCCACTGA GCATGGACAC TCACCACGCT 960
GCAAGTCCGC CACCGTGTGG CCAACCTTGG GAATTGTTAA AAGTGTTACC TGCATTATTG 1020
AATCCGTGAT TTCTCCTAAC ATAA 1044