EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-00303 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr1:26140478-26141784 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXE1MA1487.1chr1:26140520-26140535AATGTTTGTTTAAGG-6.98
Foxd3MA0041.1chr1:26140519-26140531AAATGTTTGTTT+6.27
HNF4GMA0484.1chr1:26141447-26141462ACAGGTCAAAGGTCA+6.28
NR2C2MA0504.1chr1:26141447-26141462ACAGGTCAAAGGTCA+7.42
NR2F2MA1111.1chr1:26141453-26141464CAAAGGTCAAA+6.62
Nr2f6MA0677.1chr1:26141448-26141462CAGGTCAAAGGTCA+7.73
RXRBMA0855.1chr1:26141448-26141462CAGGTCAAAGGTCA+7.31
RXRGMA0856.1chr1:26141448-26141462CAGGTCAAAGGTCA+7.52
RxraMA0512.2chr1:26141448-26141462CAGGTCAAAGGTCA+7.58
ZNF384MA1125.1chr1:26140759-26140771TTTTTTTTTTTT-6.22
Enhancer Sequence
TAAGGGCACT ACATTTTCAG CAGTTATAAG CAGGTGTGGA AAAATGTTTG TTTAAGGCCA 60
CGCGTTATTG TGAAAAAATT GTATCGCATC AATCAATTAC GAAAATGTTC TTTCCTGATC 120
TGATGTGTTC AGCAAACAAT GTAATAAATC AATGATACAC ATTCTTCTGT TTTGGTAAAG 180
AGACACAATT TTTTAAAAAA GAGACACGTT TTACACTTTG AACGTGTTGA GAAAAAAGGA 240
GACACAAAAT ATCACTTTGT AGAAAAAACG ACACGGGCAT GTTTTTTTTT TTTCAATGAG 300
CCTGCTTGAG ATGAAAACAT GCAAGTACAA CATAAACAAA TCACAACATT GACCTAGTGG 360
TCTGTGTCTT CTTCCCCCCC GTAAAAAAAG AAAACATAAA AAAGCTCACC TGCCAATAAA 420
CTCGCTTGAT CACAAGTCAG AGGAAGAGCC ACCCTCCCTG CGGAGCGCGT TAGGAGACGG 480
AGGGTGGAAA AAAACCAGAG CATGAGCATG TTGAAAGAAA AGAAAAACTA ACGCGCGGGT 540
CACTGTGTCG GTGTCAGTGC AGCTCTCTGG GGACTCAGAC TGGTCTCAGC CTTGTCATAC 600
AGTGAGCAGT TGTGTCGGCC GAGCCGAGAA AACGTCGATA GCAACTTGCC TGTGAAGAGT 660
CTCCTGCGGG CCGCTGCTCT GTTTGTGTGT ATGTGTATGT ATGTGAGTGT GTCAATAGCA 720
GCCTGCTGGT GGAGAGTCTC TAGTGAAGCT TGGCTCAATC TCCCTGCATC GACAGACCTG 780
CCAGATCAAT ACTTGGCCCA CCACTAACAA GCTGCTTCGG GGTCTCACAG CCCAACAGAG 840
GAAGCAAGAG AAGGGGAGAG AGAGAAAGAG AGAGAGAGAG ACTGAGCTGC CTGATGGCAG 900
TCTTCAGAGT CCTCTAAAGT GTCCAGCGGC GAGAGGAAGA GATGTGCAGG CCGGGGATAG 960
ACAGGTCACA CAGGTCAAAG GTCAAAGCCA CTAGCGCTGC AGTGACACGC CAGAGCCGCT 1020
GAATAATACT AAATGCATGT TTCAGGCCAA ACACACACAC ACACACACAG AGTCAGAACA 1080
GAAATCATGC ATTCTTTAAT GATCTCCTAC ATATTGTTGC TAAGAGATTT AATTTTATTC 1140
AGAACAAACA AATACTGCAT GTAAAAAAAG GCTAAGGTTT GAAACTCGTG AGCTAATTCA 1200
GTCGATCTTA ATGAACAACA CCAATCTTTG CTGTCAACTA GATTTTAAAT CTTTAAAACA 1260
ATGCTTTCAT AGTGAGCCTC TGACAATGCC AGTGTGTTGA TTTTGA 1306