EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-00225 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr1:18656799-18658013 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr1:18656968-18656987TGCTGCCCTCTTGTGGTAC-6.13
HES6MA1493.1chr1:18657534-18657544AACACGTGCC-6.02
Lhx3MA0135.1chr1:18657133-18657146TAATTAATTAATG+6.46
NFYAMA0060.3chr1:18657967-18657978TCTGATTGGCT-6.32
POU6F1MA0628.1chr1:18657135-18657145ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr1:18657135-18657145ATTAATTAAT-6.02
Enhancer Sequence
AAGCCATATC ATGTCAAGTG TGTCACAGCT ACTTACTCAC TTACTGAGAC ATAGAAAAGG 60
GAAGAACCTC ATTGCGTTTA ATGAGCATAT TGAACAAAAC ATGTCCGGTG GATCCACATC 120
ACAGTAACAC ACGTGCTCAG ATTCAAGCCT TCATCTGGAT CCTCTGCATT GCTGCCCTCT 180
TGTGGTACAA AAAGAACTAC TTTTAAATCC TTCAGTTCAG GGGTGTTCAA TGCCGTAGAC 240
TACCTCAAGT AATGTTTTGT ACTAACATGT ACCTGATCTT CAAGAGCACA CAGTATGATA 300
GCCTAAATCA CGAACCCATT CTTAGCTAAA CATATAATTA ATTAATGAGA TGAATTAACT 360
ACTCACCCAC ATGTCGTTCC CAAGACCTTT GTTCATCTTC TGGGGAAAAA ATTATATGTT 420
TAGGATGAAA GCCAAATAGG CCTTCTCCTC CCTCATTCCC CATGGGCAAC GCTCCCAAAT 480
CAAACTCCAA AAAGGTAGGC AACTAAAACA TCCCCAAAAC ATACTATACT CCTTCAGTGG 540
TTTAATTGGA ATATTTCCAA TCTATGATAA TACTTTTGTG GTGAATGAAA CTAAAATAAT 600
GACTTTTTGT ACAGATTCTT CTCCTCAGCG TCCGGGTGCG CACAACCCGG ATGCCCGCGC 660
CCGATGTCCT CTTGAAACAA AGCACAGGTG CATTCAAGGT ATATGTCAGC AATGCGACTG 720
TACATGACAC TCTTGAACAC GTGCCGTATT CTGACATTGA AAAGAATAAA CTTTTGTATA 780
AAGTTGTTGT TGTTGTTTTT TTGCTACCTG TGCACAAATG TATAGTCGAG GCCAGCAATC 840
CTTAAGCAAT TATTGCCATT GGGCCCCAAC AATCCTAATA TGCTTGTATT TTTATTCATT 900
TCAAGAGTTC ACACTTAGAT ACTGTTTGAC AACTTGTTTG CAGGTTTGGC ATGCTGTCCC 960
GGGAGAGAAC CCTGAGCTCG TAAATAGTTA AACCCAGGGC TCCCGCCAGG TCCATAGAGC 1020
ATGTGAGGGG AGTACGAAGT CAGGTGTTCT CGAGAGCTCT CCCCGGCAAA AGAGGAAAGG 1080
AGGAGAAGGG GTGGATGGGG GTTTCTTCGG GAAAACAAAG ATAAGGGAGT CGTTCTTAGC 1140
TAGGTTACTT ATAGTGAGTT TGGATCAATC TGATTGGCTA GCTAATGAGT GTAGATGAGT 1200
GGCCAGCTGC AGTC 1214