EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-00177 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr1:13926250-13927842 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HOXA13MA0650.2chr1:13927764-13927775GTTTTATTGGC-6.14
HOXB13MA0901.2chr1:13927764-13927775GTTTTATTGGC-6.14
HOXD13MA0909.2chr1:13927764-13927775GTTTTATTGGC-6.14
RUNX1MA0002.2chr1:13927420-13927431GTTTGTGGTTT+6.02
Enhancer Sequence
AAACATCTAC ACACACATAC TCATACACTT CGGACAATTT AGCCTACCCA GTACCGCATG 60
TCTTTGGGCT GTGGGGGAAA CCGGAGCACC CGGAGGAAAC CCACGCGAAC GCAGGGAGAA 120
CATGCAAACT CCACACAGAA ACACCAACTG AGCCGAGACT CGAACCAGCC ACCCAGCGAC 180
CTCCTTGCTG TGAGGCGACA GCACTACCTA CTGCGCCACT GCTTCGCCAC ACACAATACA 240
CATAATACAC TCTATACGTT TTATACACCC TATACATATA CATATATACA CTTAATACAC 300
TCCTATCAGG GTTCAGCATA GAACACAGGC CTTTGGTGTG AGAGGTGAGT CACATACCCA 360
CTGAGCTACT GGAAATTGAT GAACCCACAC ACAACGAAAG GCAATTTGCT ACATATACAC 420
AAATGATACA CTCCATACAT ATACACGATA CATTCTATAC ATATACACTA CATACATATG 480
CACACACGAT ACACTCCATA CATATGTTAC ACCCTATACA TATACACATG ATACACTCTA 540
TACATAAGCA CACGTGATAC ACTCCATACA TATGCACACA TGATACATTC TATAAGTATA 600
CACAAGCACA CACGATACAC TATATCCAAA TGCACACACG ATACACTCTA TACATATACA 660
CTCATATGAT ACACCCTATA CATATACACA AATGGTAAAT AAGCACACAA TACCCACCAT 720
ACATAAACAC ACATGATAGA CTCTACACAA ATACACTCCA TACATTTGGA CACATGAAAC 780
ACTCCATACA TATATACACA TATGATACAC ATCACATCAT ACATAAACAC ACATGATACA 840
CTCTATCCAA ATGCACACAC GATACACTAT ACATTCACAC ACATAGGATA TACATATACA 900
CATACACATG ATAAACTCTA TACATATACA AGCACATCAT ACATTTTATA GGTATACACA 960
CCATACATAT ACACACTTGA TACACTCCTG TCAGGATCTG GTAAAAATCT TATAGATTTA 1020
CTGTCATAAT TTTTATCGTA ATATTAAAGG TCTAGGGCAG CTTGAACTCC CTGAGCAAAA 1080
TTGCGATTAT TTACAAATTT ACATTGTGTA AATAATAATT CAATTTTGTT TGCATCAAAG 1140
TGCTTTTAGG TGTACAAAAC CCTGTGGCTG GTTTGTGGTT TGAGCCTCCT CAGTCCACTG 1200
GTAAAATTTC AATCTGCAAG CCTTTTCAGT TTCAGAGCTG TTTCAGAAAC ACTTAGACAG 1260
ATAAAAACCA ATCTCTTCCG GAATCACCTG AACTCAACTA TGAACAAAAC CAGGACCCCC 1320
TCATCTCTCC CCACACCAAA CCACATGACA ACTTCAAAAT ATGATGCAAT TCTAAGTGTG 1380
CCTCACAGGT GAGTGGGCTT GACTCTTTCA TCTCTCATTT TAACCAACAC TTTCACCAGT 1440
TTTGCACACT TACACCAAAC ACTATCTTAC AATCAACCAA CAGCTAAAAA ACAAATCAAT 1500
TCAATTCAAT AATTGTTTTA TTGGCATGAC AAATGCTACA AATGAATTGT CAAAGCATTT 1560
ATAAAGTTTA CATAAAAAGT AACGTACAAA AA 1592