EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-00113 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr1:8230353-8231419 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr1:8230512-8230533TTCTGCTTTTGGTTTCACTTT+6.75
Lhx3MA0135.1chr1:8231355-8231368TAATTAATTATTT+6.71
ZNF384MA1125.1chr1:8230945-8230957TTTTTTTTTACA-6.07
ZNF384MA1125.1chr1:8230936-8230948TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr1:8230937-8230949TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr1:8230938-8230950TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr1:8230939-8230951TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr1:8230940-8230952TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr1:8230941-8230953TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr1:8230942-8230954TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr1:8230943-8230955TTTTTTTTTTTA-6.37
Enhancer Sequence
CTCCTCTCAC CCTACACGTT TCCTACTTCT CGTTGAGTGT GCGCAAGAAC TGTCCCACAG 60
ACTTCCACAG ACAATCTCAC GTGCTCTGCA GAGACGTGCC TTTGTGGAAC TTAAAACTGC 120
ATCCGTCTAG GGTTTCTAAA TCTTTTAAAA TGTCCGGGAT TCTGCTTTTG GTTTCACTTT 180
GTAAGCCGTC ATCATTTTTA TTTTAAGCTT GATTTACTTA TGCTTTGCTT CAAAGCTGAC 240
AGTGCATACA CAGCCGCAGG AATGAGAGAA ACATTATATA GCATGAATAA ACATATTGTT 300
AACATGCTTC TAGTATGGAT TGATATATTG TTGGTATGTT TCTAGTATGA TTCGTATGTT 360
AATATGTTTC TATTATGTAT TAGTATGTTT CTAGTGTGGA TTGGTATATT GTTAGTATCT 420
TTCAAGTATG ATTGGTGTGT TTGTTAGTAG GTTTCTAGTA TGGATTAGAA TGCTTCTAGT 480
ATGGATTGGT ATGTCGTTAG TAAGCTTCTA GCATGGCTTA GTATATTGTT AGCATGAATT 540
GATATGTTGT TAGTACAGTA TGTCTAATGT AAAGTCAATA GTGTTTTTTT TTTTTTTTTT 600
TACAATGGTA GCCTATGAGT CATTTGCTAA GGTGCCGTAA GTGGTTGCTG AGGTGTGGCT 660
AGTTAGTTGA AAAATCATCA ATGATTGGCA GATTGGTAGT CCGAGTTAAA TGAGCTCAAC 720
CTTAAGTCTG CATAACAATC TGGCACTAAG TTATGAGGTC ATAAATTTTG GTCCGATGTT 780
AAGTCAATGA GACTTTTCAA AATTTTCCGG GCCAGTTTTT AGAAAATCAT AAGTCGAATC 840
AGTTGGAAAA GATATAGCAA CTTAATTCAG TATATTTTGG ACTTTTGGAG TTAGTTTGGT 900
GGTTGTAGTG TGAATGGTCT AGGAGAAGAT GCAATCTTAA AAGAAGAAGA AGAAGAAGAA 960
AAGGTTTATG TAGTATAACA TATTGGCTTT CTCAAGCCAC CATAATTAAT TATTTGATCT 1020
AAACGACTCA GATAAAACTT TTCTACTTAC TCAGAGAGGA CAAAAT 1066