EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-00108 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr1:7813711-7814408 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Klf12MA0742.1chr1:7814248-7814263AGCCACGCCCTTAAT+6.05
LHX2MA0700.1chr1:7814181-7814191ACTAATTAAC+6.02
PBX3MA1114.1chr1:7814231-7814248CTAGCTGTCACTCAAGT-6.46
Enhancer Sequence
ATACAGGAGA ATCCCGGGAA AGATGGGAGG GTTGACAGGT ATGGTGTATG TGCTTGAATT 60
AGACATTTAT TTTGTTCTTA TGTGTGTTTT CAGGCTGGTC GAAGCTCGAA GCGGCAGCTT 120
TTTCTCTTTC CAGGAGGAAT TGAGAGACAT TTGAAGATCA AAACTTGCTC TGTAGGTCTC 180
CTCATATGTG TTACTGCATG TGATTGTTTT TTAAGATTAA TACCGATGTT GACGTGATGG 240
GTGTGTGTTC AGGTGGCGCT GGATGTCATA GAGGAGTTGT GTTATGAGAT GGCTTTACAA 300
AGGCTGGAGG CCATGGATGA ATACACAGTT TTCATAGTCA CCAACAGAGG TACAGATGAT 360
GATTTTTCAT CTCTATAATG GTCAATACTA ACAACTGGAT ATTGATCAGT GTGTTATTCT 420
GCATTGTACA TCCTGTGGTT CAGTGGTTAG AAGCATAGAC TAAACGCACG ACTAATTAAC 480
GGCTAATCAG CTAAGGAGAT GAGACAGTGA GCAGCGAGAC CTAGCTGTCA CTCAAGTAGC 540
CACGCCCTTA ATTATGCAGA CTTAATAAAA CTTAATAAAA ACGAAATGGA TGAGTTATAA 600
ATATTCACCC CCTCACAGTT GTCATGAAGG GTAATATTAG CTATTTGCAC CAAAACCATT 660
TTTTATACCA GGCTGTAAGA TGTTTTTATC AGCTGTA 697