EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-00029 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr1:1481611-1482335 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RREB1MA0073.1chr1:1482213-1482233CCCCAAACCAACTCTACACA+6.01
SOX13MA1120.1chr1:1482194-1482205TTCCATTGTTT-6.32
Sox6MA0515.1chr1:1482196-1482206CCATTGTTTT+6.02
Enhancer Sequence
GCTACCAGTC ATTTAAGGAG GGGCTATCAG TCATTTAGGG AGGTATTTTC AATCATTTAG 60
GGTGGGGCCA TCAGTCCTTT ATGGAGGGGC TATCATTCCT TTAGGGTGGG CTATCAGTCT 120
TTTAAGGTGG GACTATCAGT CCTTTAGGGA GGGGCTATCA GTCATTCAGG GAGGGGCTAT 180
CAGTCCTTTA GGGAGGGGCT ATCTGTCATT TAAGGAGGGG CTCTCAATGC TTTAGGTGTT 240
GGGGCTATCA GTTCTTTAAT GTGGGGAAAT CAGTCCTTTA GGGAGGGGCT ATCAGTCCTT 300
TAAGGAGGGG CAATCAATCA TTTAGGGCGG GGCTATTAGT CCTTTAAGGT GGAGCTATCA 360
ATCATTTAGG GCGGGGCTAT CAGTCATTAA GGGAGGGGCT ATTAGTCCTT TAAGGATGGG 420
CTATCAATAC TTTAGGGAGG GGCTATCAAT CCTTTAGGGC GGGGCTATTA GTTATTTAGG 480
GCAGGGCTAT CAGTCCTTTA GGGCGGGGCT ATCAGTTCTT TAGGGCTTTA GGGCTAACAC 540
ACACACAGTT AGTATTTATT ATGCATGAAG ACATTCCAAA GATTTCCATT GTTTTAATGT 600
CTCCCCAAAC CAACTCTACA CACATGCAGG AAACTGTGTG CAATTTTACA TTCTGAAAAA 660
AAAAACAGTG TCATACCATG GCATTGCAGC AAAAATGCTT TAGCTTTAAG TTTTTTTATC 720
TCAT 724