EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-00028 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr1:1354733-1356312 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXE1MA1487.1chr1:1355819-1355834AACTAAACAAACAAA+6.14
Foxd3MA0041.1chr1:1355734-1355746AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr1:1355738-1355750AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr1:1355823-1355835AAACAAACAAAC-6.32
Foxj3MA0851.1chr1:1355880-1355897AAAAAATAAACAAACAA+7
SOX10MA0442.2chr1:1355903-1355914AAAACAAAGCA+6.02
SOX10MA0442.2chr1:1355934-1355945AAAACAAAGCA+6.02
SOX10MA0442.2chr1:1355913-1355924AAAACAAAGAC+6.14
SOX10MA0442.2chr1:1355984-1355995AAAACAAAGAC+6.14
SOX10MA0442.2chr1:1355853-1355864AAAACAAAGAA+6.62
Enhancer Sequence
GTGTGTGTGT TTGAACATGA CAACACAGGG ATGAAAGACT ACAGATTAAA CGGCAGAAAT 60
CTTTTAGCCT GTATGTTGAT GAGTGTCATT GTTTGGCTCG GGTCCCAGCA GGCAGTGAAA 120
TGTGAAACCA GGTGAAGCAA CAGGAGGAGA AAAGCAGAAA CACTGAGCTT TGTGTTCATA 180
ACAGAAGACA ACGGCAGCGC TTTGATCCAC ACACACACAC ACTGGAGGAC ACACACCATG 240
AGTCACAGAG ACCCCCGGCA CAGAGGAGCA TTTCTGACTA CTGAACCATC AGCGTATGAT 300
CATCACACAC ACACAAACAC ACATACATGT ACATACACAA AAATGCTTAC AAATACACAC 360
ACACACACAC ACACACAAGT ACACATAAAC ACACAAGAAC AGGTGCGCAC ACACACTTAC 420
ACACGAACAC AGAAACACAC ACTTGCATGC ACACAGACAA GGAGAGAAAG ACAGACAGGC 480
AGACACACAT GAACACACAC ACACACACAC ACGTCTCTCC CACGCAGTCA AAGCAGCGGT 540
TGACTCCTCA AAGGAATGAC CTCATCAGGT GTTTAACTCA GACAGGTTTG TGAAAGCAGC 600
TATTCTCTGC TCTATAAACA CGACATCTCA CAGTAAAACA GAGCTTGTGT GCAGTAACCT 660
CACAGACAGA GTAATCTCTT AAACATATTT GAAGTCAACA AAATGAGTTT GTATAGGCGA 720
CACTAAACAT CAATGTTTTC CAAATGTCAG CTTAAACAAT GCTTTCTGAG CAACCCTTAA 780
GATTTGAAAA GTAATTTTAT GCTCTCTATC TCTATAATAA AAAAGTAAAT AAAAAAACTG 840
CCATCGGTTG TTTTTAAATG TGATATCAAA TAACAAACAA ACAAAACAAA TCCACAAAAC 900
AAAAAATAAA TAAATAAAAA ATCTAAGCAA AATAAAAAAC AAATCAAAGC AAAACAAAAA 960
AACAAAACAA AAAAACAAGA ACAAGAACAA AAAACAAAAC AAAACAAACA AACAAACCAA 1020
AACACAAAGC AAAACAAAAT GAAAAACAAA ACAAACAAAA AACAACAAAT CAAAGCAAGA 1080
CAAAAAAACT AAACAAACAA ACAAAACAAA ACCTCAAAAC AAAACAAAGA ACAACACAAA 1140
ACAAATAAAA AAATAAACAA ACAAAACAAA AAAACAAAGC AAAACAAAGA CAAAAAAACA 1200
CAAAACAAAG CAAAACAAAA ACAAAACAAA CAAAATACAA AACAGAAAAT AAAAACAAAG 1260
ACAAGAAACA CAAAACCAAT ATTTAATAAA AAACAAAACA CAAAACAAAA CACGAAGCAA 1320
ATCAAATGCA AATAGAAAAA CAAAAAAACT AAACAAAAAA CAAAACAAAA ACAAAAAAAC 1380
AATACAAAAA AACTAAACAA GAACACAAAA CAATTTTTTT ACAAAAAAAC AAAACAAACA 1440
CACAAAACAA AACACAAAAA CAAAAAGACT AAAACAAAAC AAAAAATGCA AAAAAAAAAC 1500
AAAACAAAAA AACAATTTAA TATAACAGCT CTCTGCAACA AAAGTACAAA CACATGCCTC 1560
TACACTCATT CTGGCCATG 1579